More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_2129 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_2129  cold-shock DNA-binding domain protein  100 
 
 
64 aa  129  1.0000000000000001e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0301  cold-shock DNA-binding domain protein  96.88 
 
 
64 aa  126  1.0000000000000001e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0554  cold-shock DNA-binding domain protein  93.75 
 
 
64 aa  122  2e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1585  cold-shock DNA-binding domain protein  92.19 
 
 
64 aa  120  8e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0647  cold-shock DNA-binding domain protein  90.62 
 
 
69 aa  119  9.999999999999999e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0430  cold-shock DNA-binding domain protein  87.5 
 
 
64 aa  117  4.9999999999999996e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2592  cold-shock DNA-binding domain protein  88.89 
 
 
64 aa  115  1.9999999999999998e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.00103043  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1855  cold-shock DNA-binding domain protein  85.71 
 
 
64 aa  115  3e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2850  cold-shock DNA-binding domain protein  85.71 
 
 
65 aa  114  5e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0339  cold-shock DNA-binding domain protein  87.3 
 
 
64 aa  113  7.999999999999999e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.219193 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1421  cold-shock DNA-binding domain protein  87.3 
 
 
64 aa  113  7.999999999999999e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1986  cold-shock DNA-binding domain protein  84.38 
 
 
64 aa  113  7.999999999999999e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.320623 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1550  cold-shock DNA-binding domain protein  85.94 
 
 
64 aa  112  1.0000000000000001e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1312  cold-shock DNA-binding domain protein  84.38 
 
 
64 aa  113  1.0000000000000001e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.632587 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1326  cold-shock DNA-binding domain protein  85.71 
 
 
64 aa  112  2.0000000000000002e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.706189  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0048  cold-shock DNA-binding domain protein  84.13 
 
 
64 aa  111  4.0000000000000004e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.152198  hitchhiker  0.00109076 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1549  cold-shock DNA-binding domain protein  84.38 
 
 
64 aa  110  6e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0661  cold-shock DNA-binding domain protein  82.54 
 
 
64 aa  108  2.0000000000000002e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.90481  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3545  cold-shock DNA-binding domain protein  82.54 
 
 
64 aa  108  2.0000000000000002e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2827  cold-shock DNA-binding domain protein  87.5 
 
 
64 aa  100  8e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.433406  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3576  cold-shock DNA-binding domain protein  85.94 
 
 
64 aa  98.6  3e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2828  cold-shock DNA-binding domain protein  85.94 
 
 
64 aa  97.8  5e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.272905  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1630  cold-shock DNA-binding domain protein  74.63 
 
 
68 aa  95.5  2e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.686511  normal  0.327142 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0386  cold-shock DNA-binding domain protein  68.66 
 
 
78 aa  86.7  9e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.659141  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2053  cold-shock DNA-binding domain protein  53.85 
 
 
67 aa  71.6  0.000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.203977  normal  0.0111256 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0493  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  50 
 
 
66 aa  68.2  0.00000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.156279  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1055  cold-shock DNA-binding protein family protein  49.25 
 
 
67 aa  67.4  0.00000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.481948  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1440  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  44.78 
 
 
67 aa  67  0.00000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6014  cold-shock DNA-binding protein family protein  46.27 
 
 
67 aa  67  0.00000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1131  cold-shock DNA-binding domain protein  49.25 
 
 
67 aa  66.6  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.294478 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07120  cold-shock DNA-binding protein family  52.31 
 
 
67 aa  65.5  0.0000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.976007  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3637  putative cold-shock DNA-binding domain protein  50.75 
 
 
67 aa  65.1  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4798  cold-shock DNA-binding protein family protein  49.25 
 
 
67 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2200  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  52.24 
 
 
66 aa  65.1  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000689795  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4269  cold-shock DNA-binding protein family protein  49.25 
 
 
67 aa  65.1  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4884  cold-shock DNA-binding protein family protein  49.25 
 
 
67 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.71911  normal  0.101787 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5398  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  49.25 
 
 
67 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.262283  normal  0.0908383 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5184  cold-shock DNA-binding protein family protein  49.25 
 
 
67 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00427326 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6028  cold-shock DNA-binding protein family protein  44.78 
 
 
67 aa  64.7  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3880  cold-shock DNA-binding domain protein  50.75 
 
 
67 aa  64.7  0.0000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.902071  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0252  cold-shock DNA-binding protein family protein  46.27 
 
 
67 aa  64.7  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.994476  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13677  cold shock protein A cspA  50.75 
 
 
67 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0108357  normal  0.108106 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2503  cold-shock DNA-binding protein family protein  47.69 
 
 
68 aa  64.7  0.0000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00000079429  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1584  cold-shock DNA-binding protein family  49.25 
 
 
67 aa  64.7  0.0000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000297873  unclonable  9.08249e-24 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0262  cold-shock DNA-binding domain protein  46.27 
 
 
67 aa  64.7  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0273  cold-shock DNA-binding domain protein  46.27 
 
 
67 aa  64.7  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1392  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  49.25 
 
 
67 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.124556  normal  0.329269 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1251  cold-shock DNA-binding domain protein  43.94 
 
 
67 aa  64.3  0.0000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.791861  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2246  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  45.45 
 
 
67 aa  64.3  0.0000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.000000157436  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0567  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  49.25 
 
 
67 aa  64.3  0.0000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000164882  normal  0.415354 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0555  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  50.75 
 
 
66 aa  63.9  0.0000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000000705321  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5230  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  47.76 
 
 
67 aa  64.3  0.0000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.244858  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4380  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  49.25 
 
 
66 aa  63.5  0.0000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000149248  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0218  putative cold-shock DNA-binding domain protein  50.75 
 
 
67 aa  63.5  0.0000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.230692  hitchhiker  0.00399283 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1189  cold shock protein CspE  51.61 
 
 
69 aa  63.5  0.0000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2140  cold-shock DNA-binding protein family protein  43.94 
 
 
67 aa  63.5  0.0000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000000648799  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5227  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  47.76 
 
 
67 aa  63.5  0.0000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.54507  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3605  putative cold-shock DNA-binding domain protein  47.76 
 
 
67 aa  63.5  0.0000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.439248 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2426  cold-shock DNA-binding domain protein  49.25 
 
 
67 aa  63.2  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.386206  normal  0.184038 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0368  cold-shock DNA-binding domain protein  51.56 
 
 
68 aa  63.2  0.000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  2.16983e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0103  cold-shock DNA-binding domain protein  50.75 
 
 
67 aa  62.8  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0174  cold-shock DNA-binding protein family protein  46.97 
 
 
65 aa  63.2  0.000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000215085  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2681  cold-shock DNA-binding domain protein  47.69 
 
 
67 aa  62.8  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0114675  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2494  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  47.69 
 
 
67 aa  62.8  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.170049  decreased coverage  0.000196654 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3093  cold-shock DNA-binding protein family protein  43.94 
 
 
72 aa  62.4  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.475725  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0855  cold-shock DNA-binding protein family protein  46.15 
 
 
68 aa  62.4  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.563444  normal  0.445485 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5269  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  43.28 
 
 
67 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0859722 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0201  cold shock protein  47.76 
 
 
66 aa  62.4  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000435671  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1291  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  46.15 
 
 
67 aa  62.4  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.515471  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1274  cold-shock DNA-binding protein family protein  47.69 
 
 
67 aa  62.8  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0208  cold-shock DNA-binding domain protein  47.76 
 
 
66 aa  62.4  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000000807689  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0573  Cold-shock protein DNA-binding protein  47.76 
 
 
67 aa  62.4  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02480  cold-shock DNA-binding protein family  49.25 
 
 
67 aa  62.4  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.181166  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4276  cold-shock DNA-binding domain protein  46.88 
 
 
67 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4386  cold-shock DNA-binding domain protein  46.88 
 
 
67 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.490734 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0191  cold-shock DNA-binding domain protein  47.76 
 
 
66 aa  62.4  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  8.97537e-36 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0733  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  47.76 
 
 
67 aa  62.4  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.0000585148  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3214  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  47.76 
 
 
67 aa  62.8  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0979697  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2588  cold-shock DNA-binding domain protein  47.69 
 
 
67 aa  62.8  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.110334  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0273  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  45.45 
 
 
67 aa  62  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.355642 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0744  cold shock protein CspE  49.23 
 
 
69 aa  61.6  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.231158  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1053  cold shock-like transcription regulator protein  46.15 
 
 
67 aa  62  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.470883  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0521  Cold-shock protein DNA-binding protein  47.76 
 
 
79 aa  62  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.49245  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0117  cold-shock DNA-binding domain protein  46.97 
 
 
76 aa  61.6  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2146  cold-shock DNA-binding domain protein  50.75 
 
 
66 aa  62  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6907  cold-shock DNA-binding domain protein  43.08 
 
 
67 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.240211  normal  0.394944 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0684  cold shock protein CspE  49.23 
 
 
69 aa  61.6  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0788  cold shock protein CspE  49.23 
 
 
69 aa  61.6  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0838453  normal  0.873226 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1159  cold shock protein CspE  49.23 
 
 
69 aa  61.6  0.000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.752683 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2951  cold-shock DNA-binding protein family protein  43.08 
 
 
77 aa  62  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.15288  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2295  cold-shock DNA-binding protein family protein  47.76 
 
 
67 aa  61.6  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.904352  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0668  cold-shock DNA-binding domain protein  47.76 
 
 
67 aa  62  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.16024  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2129  cold-shock DNA-binding domain protein  50.75 
 
 
69 aa  62  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2342  cold-shock DNA-binding protein family protein  47.76 
 
 
67 aa  61.6  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.432439 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2064  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  49.25 
 
 
67 aa  62  0.000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000424325  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2974  cold shock protein CspE  50 
 
 
69 aa  61.6  0.000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0637761  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4169  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  49.25 
 
 
67 aa  61.6  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.206868  normal  0.740799 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2334  cold-shock DNA-binding protein family protein  47.76 
 
 
67 aa  61.6  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.213577  normal  0.0207687 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0670  cold shock protein CspE  49.23 
 
 
69 aa  61.6  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00211319  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0730  cold shock protein CspE  49.23 
 
 
69 aa  61.6  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>