More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_0554 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_0554  cold-shock DNA-binding domain protein  100 
 
 
64 aa  129  2.0000000000000002e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0647  cold-shock DNA-binding domain protein  96.88 
 
 
69 aa  126  1.0000000000000001e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1585  cold-shock DNA-binding domain protein  95.31 
 
 
64 aa  122  1e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2129  cold-shock DNA-binding domain protein  93.75 
 
 
64 aa  122  2e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0301  cold-shock DNA-binding domain protein  93.75 
 
 
64 aa  122  2e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0430  cold-shock DNA-binding domain protein  90.62 
 
 
64 aa  118  1.9999999999999998e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1986  cold-shock DNA-binding domain protein  89.06 
 
 
64 aa  119  1.9999999999999998e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.320623 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2592  cold-shock DNA-binding domain protein  92.06 
 
 
64 aa  119  1.9999999999999998e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.00103043  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1550  cold-shock DNA-binding domain protein  89.06 
 
 
64 aa  118  3e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0339  cold-shock DNA-binding domain protein  92.06 
 
 
64 aa  118  3e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.219193 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1326  cold-shock DNA-binding domain protein  90.48 
 
 
64 aa  117  7e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.706189  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1312  cold-shock DNA-binding domain protein  87.5 
 
 
64 aa  116  7.999999999999999e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.632587 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1549  cold-shock DNA-binding domain protein  87.5 
 
 
64 aa  115  9.999999999999999e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1855  cold-shock DNA-binding domain protein  87.3 
 
 
64 aa  114  5e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2850  cold-shock DNA-binding domain protein  87.3 
 
 
65 aa  114  5e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1421  cold-shock DNA-binding domain protein  88.89 
 
 
64 aa  112  2.0000000000000002e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0661  cold-shock DNA-binding domain protein  85.71 
 
 
64 aa  112  2.0000000000000002e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.90481  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0048  cold-shock DNA-binding domain protein  85.71 
 
 
64 aa  110  5e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.152198  hitchhiker  0.00109076 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3545  cold-shock DNA-binding domain protein  84.13 
 
 
64 aa  107  4.0000000000000004e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2827  cold-shock DNA-binding domain protein  89.06 
 
 
64 aa  102  2e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.433406  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2828  cold-shock DNA-binding domain protein  87.5 
 
 
64 aa  100  8e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.272905  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3576  cold-shock DNA-binding domain protein  84.38 
 
 
64 aa  96.7  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1630  cold-shock DNA-binding domain protein  77.61 
 
 
68 aa  96.7  1e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.686511  normal  0.327142 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0386  cold-shock DNA-binding domain protein  70.15 
 
 
78 aa  86.3  1e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.659141  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0493  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  51.52 
 
 
66 aa  72.4  0.000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.156279  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1440  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  44.78 
 
 
67 aa  69.3  0.00000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2053  cold-shock DNA-binding domain protein  49.23 
 
 
67 aa  67  0.00000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.203977  normal  0.0111256 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1584  cold-shock DNA-binding protein family  47.76 
 
 
67 aa  65.9  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000297873  unclonable  9.08249e-24 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5230  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  44.78 
 
 
67 aa  64.3  0.0000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.244858  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0555  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  50.75 
 
 
66 aa  64.3  0.0000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000000705321  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3605  putative cold-shock DNA-binding domain protein  46.27 
 
 
67 aa  63.9  0.0000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.439248 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2200  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  52.24 
 
 
66 aa  63.9  0.0000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000689795  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1131  cold-shock DNA-binding domain protein  47.76 
 
 
67 aa  63.5  0.0000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.294478 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3052  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  46.27 
 
 
70 aa  63.2  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0368  cold-shock DNA-binding domain protein  48.44 
 
 
68 aa  63.2  0.000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  2.16983e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3880  cold-shock DNA-binding domain protein  47.76 
 
 
67 aa  63.2  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.902071  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3637  putative cold-shock DNA-binding domain protein  47.76 
 
 
67 aa  63.2  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2146  cold-shock DNA-binding domain protein  47.76 
 
 
66 aa  62.8  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07120  cold-shock DNA-binding protein family  51.56 
 
 
67 aa  62.8  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.976007  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0567  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  47.76 
 
 
67 aa  62.8  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000164882  normal  0.415354 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_5000  cold shock protein  46.27 
 
 
70 aa  63.2  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1740  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  46.27 
 
 
70 aa  63.2  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.183326  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0521  Cold-shock protein DNA-binding protein  47.76 
 
 
79 aa  63.2  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.49245  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0972  CSD family cold shock protein  46.27 
 
 
77 aa  62.4  0.000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6014  cold-shock DNA-binding protein family protein  44.78 
 
 
67 aa  62  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2370  cold shock proteins  47.76 
 
 
66 aa  62.4  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  6.71289e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0218  putative cold-shock DNA-binding domain protein  47.76 
 
 
67 aa  62.4  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.230692  hitchhiker  0.00399283 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1189  cold shock protein CspE  46.15 
 
 
69 aa  62.4  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4269  cold-shock DNA-binding protein family protein  47.76 
 
 
67 aa  62.8  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2963  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  45.31 
 
 
70 aa  62.8  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.711924 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0036  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  47.76 
 
 
66 aa  62  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0320  cold-shock DNA-binding protein family  49.23 
 
 
68 aa  62.4  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.673011 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5227  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  44.78 
 
 
67 aa  62  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.54507  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1720  cold shock protein CspB  49.23 
 
 
65 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.146917  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1512  cold shock protein CspB  49.23 
 
 
65 aa  61.6  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0532666  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1463  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  46.27 
 
 
66 aa  62  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.302037  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1484  cold shock protein  49.23 
 
 
65 aa  61.6  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00463121  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1474  cold shock protein  49.23 
 
 
65 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.259968  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1492  cold-shock protein DNA-binding  46.27 
 
 
66 aa  62  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000192979  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0191  cold-shock DNA-binding domain protein  47.76 
 
 
66 aa  61.6  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  8.97537e-36 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1629  cold shock protein CspB  49.23 
 
 
65 aa  61.6  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1264  cold-shock DNA-binding domain protein  47.76 
 
 
66 aa  61.6  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000176373  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0744  cold shock protein CspE  47.69 
 
 
69 aa  62  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.231158  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0670  cold shock protein CspE  47.69 
 
 
69 aa  62  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00211319  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2503  cold-shock DNA-binding protein family protein  45.31 
 
 
68 aa  61.6  0.000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00000079429  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2295  cold-shock DNA-binding protein family protein  46.27 
 
 
67 aa  62  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.904352  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0684  cold shock protein CspE  47.69 
 
 
69 aa  62  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2904  cold-shock DNA-binding protein family protein  44.62 
 
 
71 aa  61.6  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0532076  normal  0.608581 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2342  cold-shock DNA-binding protein family protein  46.27 
 
 
67 aa  62  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.432439 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2334  cold-shock DNA-binding protein family protein  46.27 
 
 
67 aa  62  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.213577  normal  0.0207687 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0788  cold shock protein CspE  47.69 
 
 
69 aa  62  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0838453  normal  0.873226 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1159  cold shock protein CspE  47.69 
 
 
69 aa  62  0.000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.752683 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0730  cold shock protein CspE  47.69 
 
 
69 aa  62  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1771  cold shock protein CspB  49.23 
 
 
65 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.674817  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3670  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  48.48 
 
 
66 aa  62  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000000254143  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1666  cold shock protein CspB  49.23 
 
 
65 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0208  cold-shock DNA-binding domain protein  47.76 
 
 
66 aa  61.6  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000000807689  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1668  cold-shock DNA-binding protein family protein  45.31 
 
 
67 aa  61.2  0.000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.0000281076  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3679  cold shock protein CspB  49.23 
 
 
65 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.844549  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1055  cold-shock DNA-binding protein family protein  44.78 
 
 
67 aa  61.2  0.000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.481948  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1250  cold-shock DNA-binding protein family protein  44.62 
 
 
71 aa  61.2  0.000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.124236  normal  0.203788 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1040  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  44.78 
 
 
67 aa  61.2  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.366618  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1327  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  49.23 
 
 
65 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00843058  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0273  cold-shock DNA-binding domain protein  44.78 
 
 
67 aa  61.2  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0581  cold-shock domain-contain protein  48.48 
 
 
66 aa  60.8  0.000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3548  cold shock protein CspB  46.97 
 
 
66 aa  60.8  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  4.8624399999999996e-45 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3553  cold shock protein CspB  46.97 
 
 
66 aa  60.8  0.000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000960966  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4566  putative cold-shock DNA-binding domain protein  44.78 
 
 
67 aa  61.2  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.55888  normal  0.0641574 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3333  cold shock protein CspB  46.97 
 
 
66 aa  60.8  0.000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000000000736097  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3297  cold shock protein  46.97 
 
 
66 aa  60.8  0.000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.0310600000000001e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0262  cold-shock DNA-binding domain protein  44.78 
 
 
67 aa  61.2  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3248  cold shock protein  46.97 
 
 
66 aa  60.8  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000222014  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3557  cold shock protein CspB  46.97 
 
 
66 aa  60.8  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000616269  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3594  cold shock protein CspB  46.97 
 
 
66 aa  60.8  0.000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000632893  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3647  cold shock protein CspB  46.97 
 
 
66 aa  60.8  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000702498  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0252  cold-shock DNA-binding protein family protein  44.78 
 
 
67 aa  61.2  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.994476  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01731  hypothetical protein  43.28 
 
 
68 aa  60.8  0.000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1670  cold shock protein CspB  46.97 
 
 
66 aa  60.8  0.000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000143673  decreased coverage  2.4479999999999998e-23 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02480  cold-shock DNA-binding protein family  47.76 
 
 
67 aa  60.8  0.000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.181166  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3621  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  49.25 
 
 
69 aa  60.8  0.000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0652324  hitchhiker  0.000182164 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>