More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3605 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3605  putative cold-shock DNA-binding domain protein  100 
 
 		 67 aa  139  9.999999999999999e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.439248 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3652  cold-shock DNA-binding domain protein  77.61 
 
 		 67 aa  111  3e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3880  cold-shock DNA-binding domain protein  77.61 
 
 		 67 aa  108  3e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.902071  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0587  cold-shock DNA-binding domain protein  74.63 
 
 		 67 aa  107  4.0000000000000004e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0013  cold-shock DNA-binding domain protein  74.63 
 
 		 67 aa  106  9.000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0521  Cold-shock protein DNA-binding protein  74.63 
 
 		 79 aa  106  9.000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.49245  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1040  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  74.63 
 
 		 67 aa  106  9.000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.366618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0384  cold-shock DNA-binding protein family protein  76.12 
 
 		 67 aa  106  1e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0218  putative cold-shock DNA-binding domain protein  74.63 
 
 		 67 aa  106  1e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.230692  hitchhiker  0.00399283 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5230  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  73.13 
 
 		 67 aa  105  2e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.244858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6800  cold-shock DNA-binding domain protein  75 
 
 		 67 aa  105  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0668  cold-shock DNA-binding domain protein  71.64 
 
 		 67 aa  103  5e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.16024  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0641  cold-shock DNA-binding domain protein  70.15 
 
 		 67 aa  103  7e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2129  cold-shock DNA-binding domain protein  73.13 
 
 		 69 aa  103  7e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0143  putative cold-shock DNA-binding domain protein  73.44 
 
 		 67 aa  102  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.113975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2295  cold-shock DNA-binding protein family protein  71.64 
 
 		 67 aa  102  1e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.904352  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0472  cold-shock DNA-binding protein family protein  70.15 
 
 		 67 aa  103  1e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.16014  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2342  cold-shock DNA-binding protein family protein  71.64 
 
 		 67 aa  102  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.432439 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2334  cold-shock DNA-binding protein family protein  71.64 
 
 		 67 aa  102  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.213577  normal  0.0207687 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0560  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  76.56 
 
 		 67 aa  102  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1466  cold-shock DNA-binding domain protein  73.44 
 
 		 67 aa  102  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00122582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4023  cold-shock DNA-binding domain protein  68.66 
 
 		 67 aa  102  2e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00477592 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0573  Cold-shock protein DNA-binding protein  75 
 
 		 67 aa  101  3e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3141  cold-shock DNA-binding domain protein  72.31 
 
 		 67 aa  101  3e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0244532  hitchhiker  0.00153434 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5227  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  67.16 
 
 		 67 aa  101  4e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.54507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4269  cold-shock DNA-binding protein family protein  70.15 
 
 		 67 aa  100  6e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02480  cold-shock DNA-binding protein family  67.16 
 
 		 67 aa  100  6e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.181166  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19390  cold-shock DNA-binding protein family  68.66 
 
 		 67 aa  100  9e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.704539  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4077  cold-shock DNA-binding domain protein  68.66 
 
 		 67 aa  99.8  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.742445 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1900  cold-shock DNA-binding domain protein  71.64 
 
 		 67 aa  99.8  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.030523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2869  cold-shock DNA-binding protein family protein  71.88 
 
 		 67 aa  99.8  1e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0181409  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0948  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  65.67 
 
 		 67 aa  99.4  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.360484  normal  0.128926 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3637  putative cold-shock DNA-binding domain protein  68.66 
 
 		 67 aa  98.6  2e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4798  cold-shock DNA-binding protein family protein  68.66 
 
 		 67 aa  99  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4884  cold-shock DNA-binding protein family protein  68.66 
 
 		 67 aa  99  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.71911  normal  0.101787 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5398  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  68.66 
 
 		 67 aa  98.6  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.262283  normal  0.0908383 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5184  cold-shock DNA-binding protein family protein  68.66 
 
 		 67 aa  99  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00427326 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1267  cold-shock DNA-binding domain protein  68.66 
 
 		 67 aa  98.6  3e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.922504  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1392  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  71.88 
 
 		 67 aa  98.6  3e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.124556  normal  0.329269 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1580  cold-shock DNA-binding domain protein  68.66 
 
 		 67 aa  98.2  4e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.507056  normal  0.495998 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13677  cold shock protein A cspA  67.16 
 
 		 67 aa  97.4  5e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0108357  normal  0.108106 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8123  cold-shock DNA-binding domain protein  71.88 
 
 		 67 aa  97.4  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2426  cold-shock DNA-binding domain protein  70.31 
 
 		 67 aa  97.8  5e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.386206  normal  0.184038 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2415  cold-shock DNA-binding domain protein  65.67 
 
 		 67 aa  97.4  6e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.751848  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37160  cold-shock DNA-binding protein family  71.64 
 
 		 67 aa  97.1  8e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0943216 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1055  cold-shock DNA-binding protein family protein  64.18 
 
 		 67 aa  97.1  8e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.481948  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0073  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  68.75 
 
 		 67 aa  96.7  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.621224  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1131  cold-shock DNA-binding domain protein  64.18 
 
 		 67 aa  96.7  1e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.294478 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0628  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  64.18 
 
 		 67 aa  96.3  1e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5929  putative cold-shock DNA-binding domain protein  68.75 
 
 		 67 aa  95.5  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.380899  normal  0.0156128 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0301  cold-shock DNA-binding domain protein  70.31 
 
 		 67 aa  95.9  2e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00253542  normal  0.0688177 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2053  cold-shock DNA-binding domain protein  66.15 
 
 		 67 aa  95.5  2e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.203977  normal  0.0111256 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29050  cold-shock DNA-binding protein family  68.66 
 
 		 67 aa  95.5  2e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.415515  normal  0.771728 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1189  cold shock protein CspE  64.62 
 
 		 69 aa  95.1  3e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1263  cold-shock DNA-binding domain protein  67.16 
 
 		 67 aa  94.7  3e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02500  cold-shock DNA-binding protein family  67.74 
 
 		 62 aa  95.1  3e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.169268  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2333  cold-shock DNA-binding domain protein  65.67 
 
 		 67 aa  94.7  3e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000675435 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2600  cold-shock DNA-binding protein family protein  65.67 
 
 		 67 aa  94.7  3e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.612278  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2880  cold-shock DNA-binding domain protein  67.69 
 
 		 68 aa  95.1  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000807571  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1465  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  64.18 
 
 		 67 aa  94.7  4e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.359616  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1522  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  64.18 
 
 		 67 aa  94.7  4e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4469  cold-shock DNA-binding protein family protein  65.62 
 
 		 67 aa  94.7  4e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26130  cold-shock DNA-binding protein family  70.31 
 
 		 67 aa  94.4  4e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1042  cold-shock DNA-binding domain protein  69.84 
 
 		 68 aa  94.4  4e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0172  cold-shock DNA-binding domain protein  66.15 
 
 		 67 aa  94.4  5e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0000163048  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1892  cold-shock DNA-binding domain protein  62.69 
 
 		 67 aa  94  6e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2017  cold-shock DNA-binding protein family protein  72.58 
 
 		 65 aa  94  6e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.679038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1762  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  65.67 
 
 		 67 aa  94  7e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00760021 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0290  cold-shock DNA-binding protein family protein  64.18 
 
 		 67 aa  94  7e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1775  cold-shock protein, DNA-binding  65.67 
 
 		 67 aa  94  7e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8911  putative cold-shock DNA-binding domain protein  68.75 
 
 		 66 aa  93.6  8e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6575  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  68.75 
 
 		 67 aa  92.8  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.513102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3353  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  64.18 
 
 		 67 aa  93.2  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0827794  hitchhiker  0.00618792 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3031  cold shock protein CspE  63.08 
 
 		 69 aa  92.8  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.036334  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0103  cold-shock DNA-binding domain protein  64.18 
 
 		 67 aa  93.2  1e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5134  cold-shock DNA-binding protein family protein  61.19 
 
 		 67 aa  92.8  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.984065  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1858  cold shock protein CspE  63.08 
 
 		 69 aa  92.8  1e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0644498  normal  0.32354 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0260  cold-shock DNA-binding protein family protein  68.75 
 
 		 67 aa  92.8  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0175  cold-shock DNA-binding protein family protein  61.19 
 
 		 67 aa  92.8  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2958  cold shock protein CspE  63.08 
 
 		 69 aa  92.8  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0282333  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0220  cold-shock DNA-binding domain protein  68.75 
 
 		 67 aa  92.8  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1896  cold-shock DNA-binding domain protein  61.19 
 
 		 67 aa  92.8  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.385975  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3123  cold-shock protein, DNA-binding  64.18 
 
 		 67 aa  93.2  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0870951  normal  0.605091 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1947  Cold-shock protein DNA-binding  65.62 
 
 		 68 aa  92.4  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.711231  hitchhiker  0.00117492 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0788  cold shock protein CspE  64.62 
 
 		 69 aa  92  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0838453  normal  0.873226 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0670  cold shock protein CspE  64.62 
 
 		 69 aa  92  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00211319  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1407  cold-shock DNA-binding protein family protein  59.09 
 
 		 67 aa  92  3e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00627672  normal  0.763521 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0744  cold shock protein CspE  64.62 
 
 		 69 aa  92  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.231158  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0730  cold shock protein CspE  64.62 
 
 		 69 aa  92  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1159  cold shock protein CspE  64.62 
 
 		 69 aa  92  3e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.752683 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0684  cold shock protein CspE  64.62 
 
 		 69 aa  92  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01731  hypothetical protein  64.62 
 
 		 68 aa  90.9  5e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0372  cold shock protein  62.69 
 
 		 66 aa  90.9  5e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.69681e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2974  cold shock protein CspE  61.54 
 
 		 69 aa  90.9  5e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0637761  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1251  cold-shock DNA-binding domain protein  60.61 
 
 		 67 aa  90.9  6e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.791861  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2965  cold-shock DNA-binding domain protein  64.62 
 
 		 68 aa  90.5  6e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000138264 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6113  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  64.06 
 
 		 66 aa  90.5  6e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0201  cold shock protein  62.69 
 
 		 66 aa  90.5  7e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000435671  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1172  cold shock protein CspE  61.54 
 
 		 69 aa  90.5  8e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000586616  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4169  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  65.67 
 
 		 67 aa  90.1  8e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.206868  normal  0.740799 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>