More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2600 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_2333  cold-shock DNA-binding domain protein  100 
 
 		 67 aa  137  4.999999999999999e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000675435 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2600  cold-shock DNA-binding protein family protein  100 
 
 		 67 aa  137  4.999999999999999e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.612278  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0573  Cold-shock protein DNA-binding protein  79.1 
 
 		 67 aa  113  8.999999999999998e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2295  cold-shock DNA-binding protein family protein  77.61 
 
 		 67 aa  112  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.904352  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2342  cold-shock DNA-binding protein family protein  77.61 
 
 		 67 aa  112  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.432439 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2334  cold-shock DNA-binding protein family protein  77.61 
 
 		 67 aa  112  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.213577  normal  0.0207687 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3880  cold-shock DNA-binding domain protein  76.12 
 
 		 67 aa  108  2.0000000000000002e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.902071  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1392  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  73.13 
 
 		 67 aa  107  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.124556  normal  0.329269 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4798  cold-shock DNA-binding protein family protein  71.64 
 
 		 67 aa  107  6e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4884  cold-shock DNA-binding protein family protein  71.64 
 
 		 67 aa  107  6e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.71911  normal  0.101787 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5398  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  71.64 
 
 		 67 aa  107  6e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.262283  normal  0.0908383 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5184  cold-shock DNA-binding protein family protein  71.64 
 
 		 67 aa  107  6e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00427326 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1042  cold-shock DNA-binding domain protein  75.38 
 
 		 68 aa  106  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5227  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  73.13 
 
 		 67 aa  106  1e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.54507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13677  cold shock protein A cspA  75 
 
 		 67 aa  105  3e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0108357  normal  0.108106 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37160  cold-shock DNA-binding protein family  73.13 
 
 		 67 aa  104  4e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0943216 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0587  cold-shock DNA-binding domain protein  72.31 
 
 		 67 aa  102  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2053  cold-shock DNA-binding domain protein  72.31 
 
 		 67 aa  103  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.203977  normal  0.0111256 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1055  cold-shock DNA-binding protein family protein  67.16 
 
 		 67 aa  102  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.481948  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5230  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  68.66 
 
 		 67 aa  102  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.244858  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1131  cold-shock DNA-binding domain protein  68.75 
 
 		 67 aa  99.8  1e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.294478 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5929  putative cold-shock DNA-binding domain protein  67.16 
 
 		 67 aa  99.4  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.380899  normal  0.0156128 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6800  cold-shock DNA-binding domain protein  73.44 
 
 		 67 aa  100  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0521  Cold-shock protein DNA-binding protein  67.16 
 
 		 79 aa  98.6  2e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.49245  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29050  cold-shock DNA-binding protein family  71.88 
 
 		 67 aa  98.6  2e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.415515  normal  0.771728 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02480  cold-shock DNA-binding protein family  67.19 
 
 		 67 aa  99  2e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.181166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0472  cold-shock DNA-binding protein family protein  67.19 
 
 		 67 aa  99.4  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.16014  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4023  cold-shock DNA-binding domain protein  67.19 
 
 		 67 aa  99.4  2e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00477592 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1775  cold-shock protein, DNA-binding  73.44 
 
 		 67 aa  98.6  3e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0641  cold-shock DNA-binding domain protein  65.62 
 
 		 67 aa  98.2  3e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1762  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  73.44 
 
 		 67 aa  98.6  3e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00760021 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1040  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  68.66 
 
 		 67 aa  98.6  3e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.366618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4269  cold-shock DNA-binding protein family protein  68.66 
 
 		 67 aa  97.8  4e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3141  cold-shock DNA-binding domain protein  67.69 
 
 		 67 aa  97.1  8e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0244532  hitchhiker  0.00153434 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3637  putative cold-shock DNA-binding domain protein  65.67 
 
 		 67 aa  97.1  8e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0143  putative cold-shock DNA-binding domain protein  68.66 
 
 		 67 aa  97.1  8e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.113975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0301  cold-shock DNA-binding domain protein  67.19 
 
 		 67 aa  96.3  1e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00253542  normal  0.0688177 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1580  cold-shock DNA-binding domain protein  71.88 
 
 		 67 aa  95.5  2e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.507056  normal  0.495998 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1896  cold-shock DNA-binding domain protein  65.67 
 
 		 67 aa  95.1  3e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.385975  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3652  cold-shock DNA-binding domain protein  65.67 
 
 		 67 aa  94.7  3e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3605  putative cold-shock DNA-binding domain protein  65.67 
 
 		 67 aa  94.7  3e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.439248 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0670  cold shock protein CspE  67.69 
 
 		 69 aa  94  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00211319  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0684  cold shock protein CspE  67.69 
 
 		 69 aa  94  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0744  cold shock protein CspE  67.69 
 
 		 69 aa  94  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.231158  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0788  cold shock protein CspE  67.69 
 
 		 69 aa  94  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0838453  normal  0.873226 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0730  cold shock protein CspE  67.69 
 
 		 69 aa  94  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8123  cold-shock DNA-binding domain protein  67.16 
 
 		 67 aa  94  6e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0668  cold-shock DNA-binding domain protein  64.06 
 
 		 67 aa  94  6e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.16024  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1159  cold shock protein CspE  67.69 
 
 		 69 aa  94  6e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.752683 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0013  cold-shock DNA-binding domain protein  65.62 
 
 		 67 aa  94  7e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0260  cold-shock DNA-binding protein family protein  65.67 
 
 		 67 aa  93.6  8e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6575  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  65.67 
 
 		 67 aa  93.6  8e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.513102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2880  cold-shock DNA-binding domain protein  69.35 
 
 		 68 aa  93.6  8e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000807571  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1267  cold-shock DNA-binding domain protein  66.15 
 
 		 67 aa  93.2  9e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.922504  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2426  cold-shock DNA-binding domain protein  64.18 
 
 		 67 aa  93.6  9e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.386206  normal  0.184038 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0777  cold-shock DNA-binding protein family protein  68.75 
 
 		 67 aa  93.6  9e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0948  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  65.62 
 
 		 67 aa  93.6  9e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.360484  normal  0.128926 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0560  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  67.16 
 
 		 67 aa  93.2  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00593  cold shock protein E  69.35 
 
 		 69 aa  92  2e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.337159  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3021  cold shock protein CspE  69.35 
 
 		 69 aa  92  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0130834  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00582  hypothetical protein  69.35 
 
 		 69 aa  92  2e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.287726  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3002  cold-shock DNA-binding domain protein  69.35 
 
 		 69 aa  92  2e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0574427  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0712  cold shock protein CspE  69.35 
 
 		 69 aa  92  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0018015  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2974  cold shock protein CspE  64.62 
 
 		 69 aa  92.4  2e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0637761  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0648  cold shock protein CspE  69.35 
 
 		 69 aa  92  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00594526  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0538  cold shock protein CspE  69.35 
 
 		 69 aa  92  2e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0675  cold shock protein CspE  69.35 
 
 		 69 aa  92  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000392249  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3333  cold-shock DNA-binding protein family protein  67.19 
 
 		 70 aa  92  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.437112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0628  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  65.62 
 
 		 67 aa  92.4  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1189  cold shock protein CspE  64.62 
 
 		 69 aa  92  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0644  cold shock protein CspE  69.35 
 
 		 69 aa  92  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0784428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0368  cold-shock DNA-binding domain protein  67.19 
 
 		 68 aa  91.7  3e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  2.16983e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1466  cold-shock DNA-binding domain protein  62.69 
 
 		 67 aa  91.7  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00122582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4469  cold-shock DNA-binding protein family protein  70.15 
 
 		 67 aa  91.7  3e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1172  cold shock protein CspE  64.62 
 
 		 69 aa  92  3e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000586616  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3159  cold shock protein CspE  64.62 
 
 		 69 aa  92  3e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000139034  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1083  cold-shock DNA-binding domain protein  64.62 
 
 		 69 aa  91.7  3e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0392  cold-shock DNA-binding protein family protein  71.88 
 
 		 92 aa  91.7  3e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0103  cold-shock DNA-binding domain protein  61.19 
 
 		 67 aa  91.3  4e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1407  cold-shock DNA-binding protein family protein  65.62 
 
 		 67 aa  91.3  4e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00627672  normal  0.763521 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0261  cold shock protein CspE  64.62 
 
 		 69 aa  90.9  6e-18  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5269  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  59.7 
 
 		 67 aa  90.5  6e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0859722 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1097  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  60 
 
 		 67 aa  90.5  6e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.24529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3031  cold shock protein CspE  63.08 
 
 		 69 aa  90.5  7e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.036334  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2958  cold shock protein CspE  63.08 
 
 		 69 aa  90.5  7e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0282333  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26130  cold-shock DNA-binding protein family  68.75 
 
 		 67 aa  90.5  7e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0782  cold-shock DNA-binding domain protein  71.88 
 
 		 66 aa  90.5  7e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.733249  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0892  cold-shock DNA-binding domain protein  65.62 
 
 		 68 aa  90.5  7e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0218  putative cold-shock DNA-binding domain protein  64.18 
 
 		 67 aa  90.5  7e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.230692  hitchhiker  0.00399283 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1858  cold shock protein CspE  63.08 
 
 		 69 aa  90.5  7e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0644498  normal  0.32354 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0172  cold-shock DNA-binding domain protein  67.19 
 
 		 67 aa  90.1  9e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0000163048  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5342  cold-shock DNA-binding protein family protein  65.62 
 
 		 67 aa  89.4  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2498  cold-shock DNA-binding protein family protein  64.06 
 
 		 70 aa  89.4  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000241121  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19390  cold-shock DNA-binding protein family  66.15 
 
 		 67 aa  89.7  1e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.704539  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5818  cold-shock DNA-binding protein family  65.62 
 
 		 67 aa  89.4  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2326  cold shock protein CspG  60.94 
 
 		 70 aa  89  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000227415  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3877  major cold shock protein  67.74 
 
 		 70 aa  89  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.76351  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2607  cold shock protein CspG  60.94 
 
 		 70 aa  89  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.286712  normal  0.273161 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3845  major cold shock protein  67.74 
 
 		 70 aa  89  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.644384  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3929  major cold shock protein  67.74 
 
 		 70 aa  89  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>