More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_3333 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_3333  cold-shock DNA-binding protein family protein  100 
 
 		 70 aa  143  9e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.437112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2202  cold-shock DNA-binding protein family protein  76.12 
 
 		 69 aa  107  7.000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.532688 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1681  cold-shock DNA-binding domain protein  69.57 
 
 		 69 aa  101  4e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.248337  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0679  cold-shock DNA-binding protein family protein  70.15 
 
 		 68 aa  99.8  1e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.233328  normal  0.774201 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2503  cold-shock DNA-binding protein family protein  72.31 
 
 		 68 aa  99.4  1e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00000079429  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6907  cold-shock DNA-binding domain protein  73.02 
 
 		 67 aa  99  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.240211  normal  0.394944 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2951  cold-shock DNA-binding protein family protein  73.02 
 
 		 77 aa  99.4  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.15288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0172  cold-shock DNA-binding domain protein  72.58 
 
 		 67 aa  98.2  3e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0000163048  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1093  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  70.59 
 
 		 72 aa  98.6  3e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1151  cold-shock DNA-binding protein family protein  70.77 
 
 		 67 aa  97.8  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0114699  normal  0.306384 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4995  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  69.7 
 
 		 67 aa  97.8  4e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.833631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2622  cold-shock DNA-binding protein family protein  66.67 
 
 		 69 aa  97.8  4e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00345453 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2689  cold-shock DNA-binding protein family protein  66.67 
 
 		 69 aa  97.8  4e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000312687 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4064  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  70.77 
 
 		 67 aa  97.8  4e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.325578  normal  0.535982 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4522  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  70.77 
 
 		 67 aa  97.8  4e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.044588  normal  0.193224 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1648  cold shock domain-contain protein  65.22 
 
 		 69 aa  97.4  5e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5134  cold-shock DNA-binding protein family protein  74.6 
 
 		 67 aa  97.4  6e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.984065  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1407  cold-shock DNA-binding protein family protein  70.97 
 
 		 67 aa  97.1  7e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00627672  normal  0.763521 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6397  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  70.77 
 
 		 67 aa  97.1  8e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.257839 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5524  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  70.77 
 
 		 67 aa  97.1  8e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.337597  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5888  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  70.77 
 
 		 67 aa  97.1  8e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.232235  normal  0.225892 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6765  cold-shock DNA-binding domain protein  70.77 
 
 		 67 aa  96.3  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.929729  normal  0.307986 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3159  cold shock protein CspE  62.32 
 
 		 69 aa  96.3  1e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000139034  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2780  cold-shock DNA-binding protein family protein  70.77 
 
 		 67 aa  96.3  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000626517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0927  cold-shock protein, DNA-binding  67.69 
 
 		 70 aa  96.3  1e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000650584  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1172  cold shock protein CspE  62.32 
 
 		 69 aa  96.3  1e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000586616  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1464  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  62.32 
 
 		 69 aa  95.5  2e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5342  cold-shock DNA-binding protein family protein  74.6 
 
 		 67 aa  95.5  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1189  cold shock protein CspE  62.32 
 
 		 69 aa  95.5  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5838  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  75.81 
 
 		 67 aa  95.9  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.284132  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1449  cold-shock DNA-binding protein family protein  75.81 
 
 		 67 aa  95.9  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2061  cold-shock DNA-binding protein family protein  67.69 
 
 		 67 aa  95.5  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.131927 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2883  cold-shock DNA-binding domain protein  62.32 
 
 		 69 aa  95.5  2e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00808952 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5818  cold-shock DNA-binding protein family  74.6 
 
 		 67 aa  95.5  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3904  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  75.81 
 
 		 67 aa  95.9  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4166  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  71.43 
 
 		 67 aa  95.9  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.745487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2202  cold-shock DNA-binding domain protein  67.69 
 
 		 67 aa  95.5  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1500  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  62.32 
 
 		 69 aa  95.5  2e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4464  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  75.81 
 
 		 67 aa  95.9  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5764  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  66.67 
 
 		 170 aa  95.5  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.008002 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2974  cold shock protein CspE  62.32 
 
 		 69 aa  95.9  2e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0637761  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4361  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  74.19 
 
 		 67 aa  95.1  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1083  cold-shock DNA-binding domain protein  62.32 
 
 		 69 aa  95.1  3e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3900  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  74.19 
 
 		 67 aa  95.1  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.878106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0744  cold shock protein CspE  62.32 
 
 		 69 aa  94.4  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.231158  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0730  cold shock protein CspE  62.32 
 
 		 69 aa  94.4  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0670  cold shock protein CspE  62.32 
 
 		 69 aa  94.4  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00211319  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2345  cold-shock DNA-binding domain protein  68.75 
 
 		 67 aa  94.7  4e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.574294  normal  0.405321 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1159  cold shock protein CspE  62.32 
 
 		 69 aa  94.4  4e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.752683 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2735  cold-shock DNA-binding domain protein  68.75 
 
 		 67 aa  94.7  4e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.723886  normal  0.792546 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0788  cold shock protein CspE  62.32 
 
 		 69 aa  94.4  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0838453  normal  0.873226 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0573  Cold-shock protein DNA-binding protein  67.19 
 
 		 67 aa  94.7  4e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0641  cold-shock DNA-binding domain protein  64.62 
 
 		 67 aa  94.7  4e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0735  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  67.69 
 
 		 70 aa  94.7  4e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0684  cold shock protein CspE  62.32 
 
 		 69 aa  94.4  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00593  cold shock protein E  65.15 
 
 		 69 aa  94.4  5e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.337159  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3002  cold-shock DNA-binding domain protein  65.15 
 
 		 69 aa  94.4  5e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0574427  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1034  cold shock-like protein CspG  68.18 
 
 		 69 aa  94.4  5e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4386  cold-shock DNA-binding domain protein  72.58 
 
 		 67 aa  94.4  5e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.490734 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3392  cold-shock DNA-binding protein family protein  69.84 
 
 		 68 aa  94.4  5e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6028  cold-shock DNA-binding protein family protein  67.69 
 
 		 67 aa  94.4  5e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0712  cold shock protein CspE  65.15 
 
 		 69 aa  94.4  5e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0018015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3021  cold shock protein CspE  65.15 
 
 		 69 aa  94.4  5e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0130834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0538  cold shock protein CspE  65.15 
 
 		 69 aa  94.4  5e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00582  hypothetical protein  65.15 
 
 		 69 aa  94.4  5e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.287726  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4276  cold-shock DNA-binding domain protein  72.58 
 
 		 67 aa  94.4  5e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0644  cold shock protein CspE  65.15 
 
 		 69 aa  94.4  5e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0784428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0648  cold shock protein CspE  65.15 
 
 		 69 aa  94.4  5e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00594526  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0675  cold shock protein CspE  65.15 
 
 		 69 aa  94.4  5e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000392249  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1469  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  62.32 
 
 		 69 aa  94.4  5e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5169  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  69.84 
 
 		 67 aa  94  6e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6014  cold-shock DNA-binding protein family protein  67.69 
 
 		 67 aa  94  6e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7382  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  67.69 
 
 		 67 aa  94  6e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0708981 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0840  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  68.66 
 
 		 69 aa  94  6e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0431891  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0948  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  66.15 
 
 		 67 aa  94  6e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.360484  normal  0.128926 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0472  cold-shock DNA-binding protein family protein  64.62 
 
 		 67 aa  94  6e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.16014  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0167  cold-shock domain-contain protein  67.69 
 
 		 67 aa  94  7e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1853  cold-shock domain-contain protein  67.69 
 
 		 67 aa  94  7e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.537737  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1442  cold-shock domain-contain protein  67.69 
 
 		 67 aa  94  7e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0899  cold-shock domain-contain protein  67.69 
 
 		 67 aa  94  7e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0388  cold shock transcription regulator protein  67.69 
 
 		 67 aa  94  7e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1668  cold-shock DNA-binding protein family protein  69.84 
 
 		 67 aa  94  7e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.0000281076  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1944  hypothetical protein  67.69 
 
 		 67 aa  94  7e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4023  cold-shock DNA-binding domain protein  64.62 
 
 		 67 aa  94  7e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00477592 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3782  cold-shock DNA-binding domain protein  74.6 
 
 		 67 aa  94  7e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0399631  normal  0.208523 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3895  cold-shock DNA-binding domain protein  74.6 
 
 		 67 aa  94  7e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0482  cold-shock domain-contain protein  67.69 
 
 		 67 aa  94  7e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5340  cold-shock DNA-binding protein family protein  71.43 
 
 		 83 aa  93.6  8e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1366  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  62.32 
 
 		 69 aa  93.6  8e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2958  cold shock protein CspE  60.87 
 
 		 69 aa  93.6  8e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0282333  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1858  cold shock protein CspE  60.87 
 
 		 69 aa  93.6  8e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0644498  normal  0.32354 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3031  cold shock protein CspE  60.87 
 
 		 69 aa  93.6  8e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.036334  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1112  cold shock transcription regulator protein  71.43 
 
 		 81 aa  93.6  9e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000000170415  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2246  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  71.43 
 
 		 67 aa  93.6  9e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.000000157436  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0761  cold-shock domain-contain protein  71.43 
 
 		 81 aa  93.6  9e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  unclonable  0.00000000000025188  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0877  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  69.23 
 
 		 67 aa  93.6  9e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.351907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0865  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  69.23 
 
 		 67 aa  93.6  9e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000000217633  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0567  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  71.43 
 
 		 68 aa  93.6  9e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  unclonable  0.0000000000101913  hitchhiker  0.000143899 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0051  cold shock protein  68.18 
 
 		 69 aa  93.2  1e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.86437  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2133  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  68.66 
 
 		 69 aa  93.2  1e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.415341  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>