More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3652 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_3652  cold-shock DNA-binding domain protein  100 
 
 		 67 aa  137  4.999999999999999e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0384  cold-shock DNA-binding protein family protein  80.6 
 
 		 67 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0218  putative cold-shock DNA-binding domain protein  79.1 
 
 		 67 aa  112  2.0000000000000002e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.230692  hitchhiker  0.00399283 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3605  putative cold-shock DNA-binding domain protein  77.61 
 
 		 67 aa  111  3e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.439248 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2129  cold-shock DNA-binding domain protein  76.12 
 
 		 69 aa  110  6e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1040  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  76.12 
 
 		 67 aa  110  9e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.366618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0560  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  79.69 
 
 		 67 aa  109  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1466  cold-shock DNA-binding domain protein  79.69 
 
 		 67 aa  108  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00122582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2334  cold-shock DNA-binding protein family protein  74.63 
 
 		 67 aa  107  5e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.213577  normal  0.0207687 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2295  cold-shock DNA-binding protein family protein  74.63 
 
 		 67 aa  107  5e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.904352  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2342  cold-shock DNA-binding protein family protein  74.63 
 
 		 67 aa  107  5e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.432439 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0573  Cold-shock protein DNA-binding protein  77.61 
 
 		 67 aa  107  5e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6800  cold-shock DNA-binding domain protein  74.63 
 
 		 67 aa  107  6e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2869  cold-shock DNA-binding protein family protein  74.24 
 
 		 67 aa  107  7.000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0181409  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1267  cold-shock DNA-binding domain protein  73.13 
 
 		 67 aa  106  9.000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.922504  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2415  cold-shock DNA-binding domain protein  71.64 
 
 		 67 aa  106  1e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.751848  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5230  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  74.63 
 
 		 67 aa  106  1e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.244858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0143  putative cold-shock DNA-binding domain protein  71.64 
 
 		 67 aa  106  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.113975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0948  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  70.15 
 
 		 67 aa  106  1e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.360484  normal  0.128926 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0521  Cold-shock protein DNA-binding protein  74.63 
 
 		 79 aa  106  1e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.49245  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4077  cold-shock DNA-binding domain protein  71.64 
 
 		 67 aa  106  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.742445 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2880  cold-shock DNA-binding domain protein  73.85 
 
 		 68 aa  105  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000807571  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1762  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  73.13 
 
 		 67 aa  105  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00760021 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2426  cold-shock DNA-binding domain protein  71.64 
 
 		 67 aa  105  2e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.386206  normal  0.184038 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1900  cold-shock DNA-binding domain protein  74.63 
 
 		 67 aa  105  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.030523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1775  cold-shock protein, DNA-binding  73.13 
 
 		 67 aa  105  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37160  cold-shock DNA-binding protein family  76.12 
 
 		 67 aa  103  6e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0943216 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3880  cold-shock DNA-binding domain protein  76.12 
 
 		 67 aa  103  7e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.902071  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3637  putative cold-shock DNA-binding domain protein  73.13 
 
 		 67 aa  102  1e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0587  cold-shock DNA-binding domain protein  70.15 
 
 		 67 aa  103  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26130  cold-shock DNA-binding protein family  73.85 
 
 		 67 aa  102  1e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5227  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  68.66 
 
 		 67 aa  102  1e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.54507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0641  cold-shock DNA-binding domain protein  67.16 
 
 		 67 aa  102  1e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0628  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  65.67 
 
 		 67 aa  102  2e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4469  cold-shock DNA-binding protein family protein  71.88 
 
 		 67 aa  102  2e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0073  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  71.88 
 
 		 67 aa  102  2e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.621224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0472  cold-shock DNA-binding protein family protein  67.16 
 
 		 67 aa  102  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.16014  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1896  cold-shock DNA-binding domain protein  67.16 
 
 		 67 aa  101  3e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.385975  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0260  cold-shock DNA-binding protein family protein  75 
 
 		 67 aa  101  3e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4023  cold-shock DNA-binding domain protein  65.67 
 
 		 67 aa  101  3e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00477592 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02480  cold-shock DNA-binding protein family  65.67 
 
 		 67 aa  101  3e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.181166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6575  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  75 
 
 		 67 aa  101  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.513102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4269  cold-shock DNA-binding protein family protein  71.88 
 
 		 67 aa  100  5e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1131  cold-shock DNA-binding domain protein  67.16 
 
 		 67 aa  100  8e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.294478 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1055  cold-shock DNA-binding protein family protein  67.16 
 
 		 67 aa  100  9e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.481948  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1042  cold-shock DNA-binding domain protein  75.81 
 
 		 68 aa  99.4  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0220  cold-shock DNA-binding domain protein  71.88 
 
 		 67 aa  99.8  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3141  cold-shock DNA-binding domain protein  69.23 
 
 		 67 aa  99  2e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0244532  hitchhiker  0.00153434 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8123  cold-shock DNA-binding domain protein  73.44 
 
 		 67 aa  99  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1580  cold-shock DNA-binding domain protein  68.66 
 
 		 67 aa  99  2e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.507056  normal  0.495998 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2053  cold-shock DNA-binding domain protein  71.21 
 
 		 67 aa  99.4  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.203977  normal  0.0111256 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4477  cold-shock DNA-binding domain protein  67.16 
 
 		 67 aa  99  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3353  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  65.67 
 
 		 67 aa  98.2  3e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0827794  hitchhiker  0.00618792 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0668  cold-shock DNA-binding domain protein  67.16 
 
 		 67 aa  98.2  3e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.16024  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4169  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  70.15 
 
 		 67 aa  98.2  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.206868  normal  0.740799 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3123  cold-shock protein, DNA-binding  65.67 
 
 		 67 aa  98.2  3e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0870951  normal  0.605091 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5398  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  68.66 
 
 		 67 aa  98.2  3e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.262283  normal  0.0908383 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0172  cold-shock DNA-binding domain protein  68.18 
 
 		 67 aa  97.8  4e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0000163048  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29050  cold-shock DNA-binding protein family  70.15 
 
 		 67 aa  98.2  4e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.415515  normal  0.771728 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1392  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  68.66 
 
 		 67 aa  97.8  4e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.124556  normal  0.329269 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0301  cold-shock DNA-binding domain protein  70.31 
 
 		 67 aa  97.4  5e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00253542  normal  0.0688177 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13677  cold shock protein A cspA  67.16 
 
 		 67 aa  97.4  5e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0108357  normal  0.108106 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1263  cold-shock DNA-binding domain protein  65.67 
 
 		 67 aa  97.1  7e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4798  cold-shock DNA-binding protein family protein  67.16 
 
 		 67 aa  96.7  9e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5184  cold-shock DNA-binding protein family protein  67.16 
 
 		 67 aa  96.7  9e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00427326 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4884  cold-shock DNA-binding protein family protein  67.16 
 
 		 67 aa  96.7  9e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.71911  normal  0.101787 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0103  cold-shock DNA-binding domain protein  65.67 
 
 		 67 aa  96.3  1e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5929  putative cold-shock DNA-binding domain protein  64.18 
 
 		 67 aa  95.9  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.380899  normal  0.0156128 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0013  cold-shock DNA-binding domain protein  65.67 
 
 		 67 aa  95.5  2e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2333  cold-shock DNA-binding domain protein  65.67 
 
 		 67 aa  94.7  3e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000675435 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2600  cold-shock DNA-binding protein family protein  65.67 
 
 		 67 aa  94.7  3e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.612278  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0782  cold-shock DNA-binding domain protein  71.88 
 
 		 66 aa  94.4  4e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.733249  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6113  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  67.19 
 
 		 66 aa  94.7  4e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10670  cold-shock DNA-binding protein family  67.16 
 
 		 67 aa  94.7  4e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00582905  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8911  putative cold-shock DNA-binding domain protein  67.16 
 
 		 66 aa  94.7  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0392  cold-shock DNA-binding protein family protein  67.16 
 
 		 92 aa  94.7  4e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4566  putative cold-shock DNA-binding domain protein  62.69 
 
 		 67 aa  94  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.55888  normal  0.0641574 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2017  cold-shock DNA-binding protein family protein  72.58 
 
 		 65 aa  94  6e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.679038  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0521  cold-shock DNA-binding domain protein  68.66 
 
 		 67 aa  93.6  7e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0892  cold-shock DNA-binding domain protein  68.75 
 
 		 68 aa  93.6  7e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3245  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  69.23 
 
 		 65 aa  93.6  9e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.370321  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0803  cold-shock DNA-binding domain protein  67.16 
 
 		 66 aa  92.8  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5449  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  62.69 
 
 		 94 aa  93.2  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.265568  normal  0.248856 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1083  cold-shock DNA-binding domain protein  61.54 
 
 		 69 aa  93.2  1e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2345  cold-shock DNA-binding domain protein  66.67 
 
 		 67 aa  92.8  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.574294  normal  0.405321 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2735  cold-shock DNA-binding domain protein  66.67 
 
 		 67 aa  92.8  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.723886  normal  0.792546 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3612  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  71.88 
 
 		 68 aa  92.8  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00000433441  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00992  DNA-binding transcriptional regulator  64.06 
 
 		 70 aa  92  2e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2653  cold-shock DNA-binding domain protein  64.06 
 
 		 70 aa  92  2e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000496106  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1105  cold shock protein CspG  64.06 
 
 		 70 aa  92  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000233553  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1099  cold shock protein CspG  64.06 
 
 		 70 aa  92  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2135  cold shock protein CspG  64.06 
 
 		 70 aa  92  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6907  cold-shock DNA-binding domain protein  64.06 
 
 		 67 aa  92  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.240211  normal  0.394944 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1225  cold shock protein CspG  64.06 
 
 		 70 aa  92  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000203795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2326  cold shock protein CspG  64.06 
 
 		 70 aa  92  2e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000227415  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2607  cold shock protein CspG  64.06 
 
 		 70 aa  92  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.286712  normal  0.273161 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2951  cold-shock DNA-binding protein family protein  64.06 
 
 		 77 aa  92.4  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.15288  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02500  cold-shock DNA-binding protein family  62.9 
 
 		 62 aa  92  2e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.169268  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00999  hypothetical protein  64.06 
 
 		 70 aa  92  2e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0777  cold-shock DNA-binding protein family protein  67.19 
 
 		 67 aa  92.4  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>