More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_1585 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_1585  cold-shock DNA-binding domain protein  100 
 
 
64 aa  129  2.0000000000000002e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0554  cold-shock DNA-binding domain protein  95.31 
 
 
64 aa  122  1e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0301  cold-shock DNA-binding domain protein  95.31 
 
 
64 aa  123  1e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0647  cold-shock DNA-binding domain protein  92.19 
 
 
69 aa  120  6e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2129  cold-shock DNA-binding domain protein  92.19 
 
 
64 aa  120  8e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2592  cold-shock DNA-binding domain protein  92.06 
 
 
64 aa  116  7.999999999999999e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.00103043  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1986  cold-shock DNA-binding domain protein  87.5 
 
 
64 aa  115  1.9999999999999998e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.320623 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0430  cold-shock DNA-binding domain protein  89.06 
 
 
64 aa  115  1.9999999999999998e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0339  cold-shock DNA-binding domain protein  88.89 
 
 
64 aa  114  6e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.219193 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1549  cold-shock DNA-binding domain protein  85.94 
 
 
64 aa  113  1.0000000000000001e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1326  cold-shock DNA-binding domain protein  87.3 
 
 
64 aa  112  1.0000000000000001e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.706189  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1550  cold-shock DNA-binding domain protein  84.38 
 
 
64 aa  112  2.0000000000000002e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2850  cold-shock DNA-binding domain protein  87.3 
 
 
65 aa  112  3e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1312  cold-shock DNA-binding domain protein  82.81 
 
 
64 aa  110  5e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.632587 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1855  cold-shock DNA-binding domain protein  84.13 
 
 
64 aa  109  1.0000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1421  cold-shock DNA-binding domain protein  85.71 
 
 
64 aa  107  5e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0661  cold-shock DNA-binding domain protein  82.54 
 
 
64 aa  107  6e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.90481  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0048  cold-shock DNA-binding domain protein  82.54 
 
 
64 aa  105  2e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.152198  hitchhiker  0.00109076 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3545  cold-shock DNA-binding domain protein  80.95 
 
 
64 aa  103  9e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3576  cold-shock DNA-binding domain protein  89.06 
 
 
64 aa  102  1e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2828  cold-shock DNA-binding domain protein  85.94 
 
 
64 aa  97.1  7e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.272905  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2827  cold-shock DNA-binding domain protein  84.38 
 
 
64 aa  96.7  9e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.433406  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1630  cold-shock DNA-binding domain protein  74.63 
 
 
68 aa  91.7  3e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.686511  normal  0.327142 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0386  cold-shock DNA-binding domain protein  68.66 
 
 
78 aa  82.4  0.000000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.659141  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0493  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  51.52 
 
 
66 aa  73.2  0.000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.156279  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1440  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  44.78 
 
 
67 aa  69.3  0.00000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2053  cold-shock DNA-binding domain protein  49.23 
 
 
67 aa  65.5  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.203977  normal  0.0111256 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1131  cold-shock DNA-binding domain protein  47.76 
 
 
67 aa  65.5  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.294478 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1584  cold-shock DNA-binding protein family  47.76 
 
 
67 aa  65.1  0.0000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000297873  unclonable  9.08249e-24 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5230  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  44.78 
 
 
67 aa  63.9  0.0000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.244858  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2200  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  52.24 
 
 
66 aa  63.9  0.0000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000689795  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0273  cold-shock DNA-binding domain protein  46.27 
 
 
67 aa  63.2  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3637  putative cold-shock DNA-binding domain protein  47.76 
 
 
67 aa  63.2  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0320  cold-shock DNA-binding protein family  53.23 
 
 
68 aa  63.2  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.673011 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0252  cold-shock DNA-binding protein family protein  46.27 
 
 
67 aa  63.2  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.994476  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07120  cold-shock DNA-binding protein family  50.77 
 
 
67 aa  63.5  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.976007  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1251  cold-shock DNA-binding domain protein  43.94 
 
 
67 aa  63.2  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.791861  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0262  cold-shock DNA-binding domain protein  46.27 
 
 
67 aa  63.2  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3670  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  50 
 
 
66 aa  62.4  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000000254143  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0521  Cold-shock protein DNA-binding protein  47.76 
 
 
79 aa  62.4  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.49245  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1055  cold-shock DNA-binding protein family protein  44.78 
 
 
67 aa  62.8  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.481948  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0567  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  47.76 
 
 
67 aa  62.4  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000164882  normal  0.415354 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5227  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  46.27 
 
 
67 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.54507  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0555  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  49.25 
 
 
66 aa  61.6  0.000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000000705321  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0218  putative cold-shock DNA-binding domain protein  47.76 
 
 
67 aa  62  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.230692  hitchhiker  0.00399283 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1189  cold shock protein CspE  48.39 
 
 
69 aa  61.6  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0581  cold-shock domain-contain protein  50 
 
 
66 aa  61.2  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0368  cold-shock DNA-binding domain protein  48.44 
 
 
68 aa  61.6  0.000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  2.16983e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3553  cold shock protein CspB  48.48 
 
 
66 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000960966  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3333  cold shock protein CspB  48.48 
 
 
66 aa  61.2  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000000000736097  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3297  cold shock protein  48.48 
 
 
66 aa  61.2  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.0310600000000001e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3248  cold shock protein  48.48 
 
 
66 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000222014  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2095  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  47.69 
 
 
68 aa  61.2  0.000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00070927  normal  0.594986 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2370  cold shock proteins  47.76 
 
 
66 aa  61.2  0.000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  6.71289e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3605  putative cold-shock DNA-binding domain protein  44.78 
 
 
67 aa  61.2  0.000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.439248 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3594  cold shock protein CspB  48.48 
 
 
66 aa  61.2  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000632893  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3647  cold shock protein CspB  48.48 
 
 
66 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000702498  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3548  cold shock protein CspB  48.48 
 
 
66 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  4.8624399999999996e-45 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3557  cold shock protein CspB  48.48 
 
 
66 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000616269  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1670  cold shock protein CspB  48.48 
 
 
66 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000143673  decreased coverage  2.4479999999999998e-23 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3052  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  44.78 
 
 
70 aa  61.2  0.000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2146  cold-shock DNA-binding domain protein  47.76 
 
 
66 aa  61.2  0.000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3093  cold-shock DNA-binding protein family protein  43.94 
 
 
72 aa  61.2  0.000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.475725  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6014  cold-shock DNA-binding protein family protein  43.28 
 
 
67 aa  60.8  0.000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1740  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  44.78 
 
 
70 aa  61.2  0.000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.183326  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0103  cold-shock DNA-binding domain protein  49.25 
 
 
67 aa  60.8  0.000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02480  cold-shock DNA-binding protein family  47.76 
 
 
67 aa  61.2  0.000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.181166  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4269  cold-shock DNA-binding protein family protein  46.27 
 
 
67 aa  60.8  0.000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_5000  cold shock protein  44.78 
 
 
70 aa  61.2  0.000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3242  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  48.48 
 
 
66 aa  60.8  0.000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000134861  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2503  cold-shock DNA-binding protein family protein  43.08 
 
 
68 aa  60.8  0.000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00000079429  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3880  cold-shock DNA-binding domain protein  46.27 
 
 
67 aa  60.8  0.000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.902071  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4566  putative cold-shock DNA-binding domain protein  46.88 
 
 
67 aa  60.5  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.55888  normal  0.0641574 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4169  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  46.27 
 
 
67 aa  60.5  0.000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.206868  normal  0.740799 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0174  cold-shock DNA-binding protein family protein  45.45 
 
 
65 aa  60.5  0.000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000215085  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0036  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  47.76 
 
 
66 aa  60.5  0.000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0191  cold-shock DNA-binding domain protein  47.76 
 
 
66 aa  60.5  0.000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  8.97537e-36 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0201  cold shock protein  44.78 
 
 
66 aa  60.5  0.000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000435671  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0208  cold-shock DNA-binding domain protein  47.76 
 
 
66 aa  60.5  0.000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000000807689  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4798  cold-shock DNA-binding protein family protein  44.78 
 
 
67 aa  60.5  0.000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0073  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  44.78 
 
 
67 aa  60.5  0.000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.621224  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0668  cold-shock DNA-binding domain protein  46.27 
 
 
67 aa  60.5  0.000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.16024  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2963  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  43.75 
 
 
70 aa  60.5  0.000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.711924 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4884  cold-shock DNA-binding protein family protein  44.78 
 
 
67 aa  60.5  0.000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.71911  normal  0.101787 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5184  cold-shock DNA-binding protein family protein  44.78 
 
 
67 aa  60.5  0.000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00427326 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1720  cold shock protein CspB  49.23 
 
 
65 aa  60.1  0.000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.146917  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1474  cold shock protein  49.23 
 
 
65 aa  60.1  0.000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.259968  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2246  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  42.42 
 
 
67 aa  60.1  0.000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.000000157436  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1668  cold-shock DNA-binding protein family protein  43.08 
 
 
67 aa  60.1  0.000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.0000281076  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1083  cold-shock DNA-binding domain protein  46.77 
 
 
69 aa  60.1  0.000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1771  cold shock protein CspB  49.23 
 
 
65 aa  60.1  0.000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.674817  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5398  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  44.78 
 
 
67 aa  60.5  0.000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.262283  normal  0.0908383 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1512  cold shock protein CspB  49.23 
 
 
65 aa  60.1  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0532666  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13677  cold shock protein A cspA  46.27 
 
 
67 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0108357  normal  0.108106 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5134  cold-shock DNA-binding protein family protein  41.79 
 
 
67 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.984065  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2221  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  50 
 
 
66 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000348612  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1666  cold shock protein CspB  49.23 
 
 
65 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10670  cold-shock DNA-binding protein family  46.27 
 
 
67 aa  60.1  0.00000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00582905  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2064  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  46.27 
 
 
67 aa  59.7  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000424325  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5449  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  44.78 
 
 
94 aa  59.7  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.265568  normal  0.248856 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>