More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_0386 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_0386  cold-shock DNA-binding domain protein  100 
 
 
78 aa  157  4e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.659141  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3545  cold-shock DNA-binding domain protein  80.88 
 
 
64 aa  111  4.0000000000000004e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1421  cold-shock DNA-binding domain protein  79.1 
 
 
64 aa  107  4.0000000000000004e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2850  cold-shock DNA-binding domain protein  76.47 
 
 
65 aa  104  4e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0048  cold-shock DNA-binding domain protein  77.94 
 
 
64 aa  104  4e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.152198  hitchhiker  0.00109076 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1630  cold-shock DNA-binding domain protein  89.71 
 
 
68 aa  103  6e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.686511  normal  0.327142 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1855  cold-shock DNA-binding domain protein  75 
 
 
64 aa  103  1e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0430  cold-shock DNA-binding domain protein  74.63 
 
 
64 aa  100  5e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0339  cold-shock DNA-binding domain protein  75 
 
 
64 aa  100  7e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.219193 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2592  cold-shock DNA-binding domain protein  75 
 
 
64 aa  100  1e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.00103043  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1312  cold-shock DNA-binding domain protein  76.12 
 
 
64 aa  98.6  3e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.632587 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1986  cold-shock DNA-binding domain protein  74.63 
 
 
64 aa  98.6  3e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.320623 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0301  cold-shock DNA-binding domain protein  71.64 
 
 
64 aa  97.4  6e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0647  cold-shock DNA-binding domain protein  66.67 
 
 
69 aa  97.4  6e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1326  cold-shock DNA-binding domain protein  72.06 
 
 
64 aa  96.7  9e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.706189  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2129  cold-shock DNA-binding domain protein  68.66 
 
 
64 aa  94.4  5e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0661  cold-shock DNA-binding domain protein  70.15 
 
 
64 aa  94  6e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.90481  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1549  cold-shock DNA-binding domain protein  71.64 
 
 
64 aa  92.8  1e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0554  cold-shock DNA-binding domain protein  70.15 
 
 
64 aa  92.8  1e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1550  cold-shock DNA-binding domain protein  70.15 
 
 
64 aa  91.7  3e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1585  cold-shock DNA-binding domain protein  70.15 
 
 
64 aa  91.3  4e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2828  cold-shock DNA-binding domain protein  73.13 
 
 
64 aa  80.1  0.00000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.272905  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2827  cold-shock DNA-binding domain protein  73.13 
 
 
64 aa  80.1  0.00000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.433406  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3576  cold-shock DNA-binding domain protein  73.13 
 
 
64 aa  78.2  0.00000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0493  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  48.57 
 
 
66 aa  66.6  0.0000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.156279  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1440  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  44.29 
 
 
67 aa  64.3  0.0000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0172  cold-shock DNA-binding domain protein  45.07 
 
 
67 aa  63.2  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0000163048  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0557  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  50 
 
 
67 aa  63.5  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0146749  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1077  cold-shock DNA-binding domain protein  47.89 
 
 
66 aa  62.8  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.27833e-32 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3185  cold-shock DNA-binding domain protein  47.89 
 
 
66 aa  62.8  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000000997397  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3711  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  48.57 
 
 
66 aa  62.4  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000509741  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0273  cold-shock DNA-binding domain protein  47.14 
 
 
67 aa  61.6  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0252  cold-shock DNA-binding protein family protein  47.14 
 
 
67 aa  61.6  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.994476  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0262  cold-shock DNA-binding domain protein  47.14 
 
 
67 aa  61.6  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3186  cold-shock DNA-binding domain protein  48.57 
 
 
67 aa  61.2  0.000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000014796  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0226  cold-shock DNA-binding protein family protein  47.06 
 
 
65 aa  61.2  0.000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000017804  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2951  cold-shock DNA-binding protein family protein  41.03 
 
 
77 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.15288  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0340  cold-shock DNA-binding protein family protein  45.71 
 
 
66 aa  60.5  0.000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  3.6796e-20  unclonable  6.2466300000000005e-24 
 
 
 
NC_012918  GM21_1502  cold-shock DNA-binding domain protein  45.71 
 
 
68 aa  59.7  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.683183 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2806  cold shock proteins  46.48 
 
 
85 aa  59.7  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  5.72104e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0237  cold-shock DNA-binding protein family protein  44.29 
 
 
66 aa  59.7  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000692047  hitchhiker  0.0000000000000296416 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3670  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  45.71 
 
 
66 aa  59.7  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000000254143  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0191  cold-shock DNA-binding domain protein  45.71 
 
 
66 aa  59.7  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  8.97537e-36 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2739  cold-shock DNA-binding domain protein  45.71 
 
 
68 aa  59.7  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000080188  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0273  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  45.71 
 
 
67 aa  59.7  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.355642 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1251  cold-shock DNA-binding domain protein  44.29 
 
 
67 aa  59.7  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.791861  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4380  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  45.71 
 
 
66 aa  59.7  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000149248  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2200  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  47.14 
 
 
66 aa  59.7  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000689795  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3214  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  44.29 
 
 
67 aa  59.7  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0979697  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2370  cold shock proteins  45.71 
 
 
66 aa  58.9  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  6.71289e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2053  cold-shock DNA-binding domain protein  47.06 
 
 
67 aa  59.3  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.203977  normal  0.0111256 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1391  cold-shock DNA-binding domain protein  45.71 
 
 
66 aa  59.3  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000000857842  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4386  cold-shock DNA-binding domain protein  43.66 
 
 
67 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.490734 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4020  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  44.29 
 
 
66 aa  58.9  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000184454  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4117  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  47.06 
 
 
67 aa  58.9  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.327381  normal  0.21845 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4276  cold-shock DNA-binding domain protein  43.66 
 
 
67 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0191  cold-shock domain-contain protein  44.29 
 
 
66 aa  58.5  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0658  cold-shock DNA-binding domain protein  45.71 
 
 
66 aa  58.5  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.18008e-25 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0208  cold-shock DNA-binding domain protein  44.29 
 
 
66 aa  58.2  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000000807689  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0174  cold-shock DNA-binding protein family protein  42.86 
 
 
65 aa  58.5  0.00000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000215085  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0645  cold-shock DNA-binding domain protein  45.71 
 
 
66 aa  58.5  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000000155303  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3948  cold-shock DNA-binding domain protein  43.48 
 
 
67 aa  58.5  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2891  cold-shock DNA-binding domain protein  44.29 
 
 
66 aa  58.2  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.87323e-28 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16470  putative cold-shock DNA-binding domain protein  45.07 
 
 
67 aa  58.2  0.00000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  8.463030000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2724  cold-shock DNA-binding domain protein  48.57 
 
 
66 aa  58.2  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.720009  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2221  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  43.66 
 
 
66 aa  57.8  0.00000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000348612  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0073  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  47.06 
 
 
67 aa  58.2  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.621224  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1235  cold-shock DNA-binding protein family protein  48.57 
 
 
66 aa  58.2  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1274  cold-shock DNA-binding protein family protein  47.06 
 
 
67 aa  58.2  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2197  cold-shock DNA-binding domain protein  45.71 
 
 
66 aa  58.2  0.00000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000106738  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2588  cold-shock DNA-binding domain protein  47.06 
 
 
67 aa  58.2  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.110334  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2630  cold-shock DNA-binding domain protein  48.57 
 
 
66 aa  58.2  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.681724  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2681  cold-shock DNA-binding domain protein  47.06 
 
 
67 aa  58.2  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0114675  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1388  cold-shock DNA-binding protein family protein  44.12 
 
 
67 aa  57.8  0.00000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000202704  normal  0.239262 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2532  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  47.14 
 
 
65 aa  57.8  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.19716  normal  0.287944 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3292  cold-shock DNA-binding domain protein  47.06 
 
 
67 aa  57.8  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.0070619  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0387  cold-shock DNA-binding domain protein  45.59 
 
 
67 aa  57.8  0.00000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000000327706  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3052  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  43.48 
 
 
70 aa  57.4  0.00000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1905  cold shock domain-contain protein  44.29 
 
 
66 aa  57.4  0.00000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00000974395  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3093  cold-shock DNA-binding protein family protein  41.1 
 
 
72 aa  57.4  0.00000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.475725  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6014  cold-shock DNA-binding protein family protein  44.12 
 
 
67 aa  57.4  0.00000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_5000  cold shock protein  43.48 
 
 
70 aa  57.4  0.00000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3366  cold-shock DNA-binding domain protein  47.06 
 
 
67 aa  57.8  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1740  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  43.48 
 
 
70 aa  57.4  0.00000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.183326  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2494  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  45.59 
 
 
67 aa  57.4  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.170049  decreased coverage  0.000196654 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2222  cold-shock DNA-binding domain protein  44.29 
 
 
66 aa  57  0.00000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000000977172  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2005  cold-shock DNA-binding domain protein  44.29 
 
 
66 aa  57  0.00000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.1727900000000003e-24 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1266  cold-shock DNA-binding protein family protein  44.29 
 
 
66 aa  57  0.00000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  2.7573e-18  decreased coverage  0.00000000000100442 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6907  cold-shock DNA-binding domain protein  44.12 
 
 
67 aa  57  0.00000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.240211  normal  0.394944 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1715  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  43.28 
 
 
69 aa  57  0.00000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0880  cold shock protein  41.43 
 
 
66 aa  57  0.00000009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000035682  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0207  cold-shock domain-contain protein  41.43 
 
 
66 aa  56.2  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000092661  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5298  cold shock protein CspC  44.12 
 
 
67 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5356  cold shock protein CspC  44.12 
 
 
67 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0958  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  41.67 
 
 
68 aa  56.6  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000177063  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3013  cold-shock DNA-binding domain protein  44.12 
 
 
65 aa  56.6  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000213425  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2246  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  42.65 
 
 
67 aa  56.2  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.000000157436  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3176  cold-shock DNA-binding protein family protein  45.59 
 
 
67 aa  56.6  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7382  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  44.12 
 
 
67 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0708981 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4042  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  45.59 
 
 
67 aa  56.6  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>