More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_3576 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_3576  cold-shock DNA-binding domain protein  100 
 
 
64 aa  127  4.0000000000000003e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1585  cold-shock DNA-binding domain protein  89.06 
 
 
64 aa  119  1.9999999999999998e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1312  cold-shock DNA-binding domain protein  89.06 
 
 
64 aa  115  9.999999999999999e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.632587 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1986  cold-shock DNA-binding domain protein  89.06 
 
 
64 aa  116  9.999999999999999e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.320623 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0301  cold-shock DNA-binding domain protein  85.94 
 
 
64 aa  114  3e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2129  cold-shock DNA-binding domain protein  85.94 
 
 
64 aa  114  3e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0647  cold-shock DNA-binding domain protein  84.38 
 
 
69 aa  113  6.9999999999999995e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2592  cold-shock DNA-binding domain protein  88.89 
 
 
64 aa  113  7.999999999999999e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.00103043  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0554  cold-shock DNA-binding domain protein  84.38 
 
 
64 aa  113  8.999999999999998e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1550  cold-shock DNA-binding domain protein  82.81 
 
 
64 aa  110  6e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1549  cold-shock DNA-binding domain protein  82.81 
 
 
64 aa  109  1.0000000000000001e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0430  cold-shock DNA-binding domain protein  81.25 
 
 
64 aa  109  2.0000000000000002e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0339  cold-shock DNA-binding domain protein  82.54 
 
 
64 aa  108  3e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.219193 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1855  cold-shock DNA-binding domain protein  80.95 
 
 
64 aa  108  3e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1326  cold-shock DNA-binding domain protein  80.95 
 
 
64 aa  107  6e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.706189  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2850  cold-shock DNA-binding domain protein  80.95 
 
 
65 aa  107  8.000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0661  cold-shock DNA-binding domain protein  79.37 
 
 
64 aa  104  3e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.90481  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0048  cold-shock DNA-binding domain protein  79.37 
 
 
64 aa  103  7e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.152198  hitchhiker  0.00109076 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1421  cold-shock DNA-binding domain protein  79.37 
 
 
64 aa  102  2e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3545  cold-shock DNA-binding domain protein  77.78 
 
 
64 aa  101  3e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2827  cold-shock DNA-binding domain protein  93.75 
 
 
64 aa  100  8e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.433406  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2828  cold-shock DNA-binding domain protein  92.19 
 
 
64 aa  97.4  6e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.272905  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1630  cold-shock DNA-binding domain protein  77.61 
 
 
68 aa  92.8  2e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.686511  normal  0.327142 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0386  cold-shock DNA-binding domain protein  71.64 
 
 
78 aa  83.2  0.000000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.659141  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2053  cold-shock DNA-binding domain protein  52.31 
 
 
67 aa  68.9  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.203977  normal  0.0111256 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1440  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  44.78 
 
 
67 aa  69.3  0.00000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0493  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  46.97 
 
 
66 aa  68.6  0.00000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.156279  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3637  putative cold-shock DNA-binding domain protein  50.75 
 
 
67 aa  67  0.00000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5227  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  49.25 
 
 
67 aa  66.2  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.54507  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5230  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  47.76 
 
 
67 aa  66.2  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.244858  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1055  cold-shock DNA-binding protein family protein  47.76 
 
 
67 aa  65.5  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.481948  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2200  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  53.73 
 
 
66 aa  65.5  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000689795  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0218  putative cold-shock DNA-binding domain protein  50.75 
 
 
67 aa  65.9  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.230692  hitchhiker  0.00399283 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1131  cold-shock DNA-binding domain protein  47.76 
 
 
67 aa  65.1  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.294478 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0368  cold-shock DNA-binding domain protein  51.56 
 
 
68 aa  64.7  0.0000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  2.16983e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2503  cold-shock DNA-binding protein family protein  46.15 
 
 
68 aa  64.7  0.0000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00000079429  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1584  cold-shock DNA-binding protein family  47.76 
 
 
67 aa  64.3  0.0000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000297873  unclonable  9.08249e-24 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6014  cold-shock DNA-binding protein family protein  46.27 
 
 
67 aa  64.3  0.0000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0521  Cold-shock protein DNA-binding protein  47.76 
 
 
79 aa  62.8  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.49245  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1251  cold-shock DNA-binding domain protein  43.94 
 
 
67 aa  63.5  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.791861  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0262  cold-shock DNA-binding domain protein  46.27 
 
 
67 aa  63.5  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0201  cold shock protein  46.27 
 
 
66 aa  63.2  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000435671  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0273  cold-shock DNA-binding domain protein  46.27 
 
 
67 aa  63.5  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2246  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  45.45 
 
 
67 aa  63.2  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.000000157436  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0252  cold-shock DNA-binding protein family protein  46.27 
 
 
67 aa  63.5  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.994476  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4469  cold-shock DNA-binding protein family protein  46.27 
 
 
67 aa  63.2  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4169  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  47.76 
 
 
67 aa  62.8  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.206868  normal  0.740799 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3605  putative cold-shock DNA-binding domain protein  46.27 
 
 
67 aa  63.2  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.439248 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2140  cold-shock DNA-binding protein family protein  43.94 
 
 
67 aa  62.4  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000000648799  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0073  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  46.27 
 
 
67 aa  62.4  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.621224  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1452  cold shock protein  52.31 
 
 
69 aa  62.8  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00528727  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0367  cold-shock DNA-binding domain protein  48.44 
 
 
68 aa  62.8  0.000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  2.12569e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4276  cold-shock DNA-binding domain protein  46.88 
 
 
67 aa  61.6  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6028  cold-shock DNA-binding protein family protein  44.78 
 
 
67 aa  62  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2333  cold-shock DNA-binding domain protein  50 
 
 
67 aa  62  0.000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000675435 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4386  cold-shock DNA-binding domain protein  46.88 
 
 
67 aa  61.6  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.490734 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4008  cold-shock DNA-binding domain protein  42.19 
 
 
64 aa  62  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2951  cold-shock DNA-binding protein family protein  46.15 
 
 
77 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.15288  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2600  cold-shock DNA-binding protein family protein  50 
 
 
67 aa  62  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.612278  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0567  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  47.76 
 
 
67 aa  62  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000164882  normal  0.415354 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3880  cold-shock DNA-binding domain protein  47.76 
 
 
67 aa  62  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.902071  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0143  putative cold-shock DNA-binding domain protein  46.27 
 
 
67 aa  62  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.113975  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1580  cold-shock DNA-binding domain protein  47.76 
 
 
67 aa  61.2  0.000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.507056  normal  0.495998 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16470  putative cold-shock DNA-binding domain protein  50.75 
 
 
67 aa  61.2  0.000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  8.463030000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3093  cold-shock DNA-binding protein family protein  44.62 
 
 
72 aa  61.2  0.000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.475725  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0855  cold-shock DNA-binding protein family protein  46.15 
 
 
68 aa  61.2  0.000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.563444  normal  0.445485 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0260  cold-shock DNA-binding protein family protein  49.18 
 
 
67 aa  61.2  0.000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0555  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  47.76 
 
 
66 aa  61.2  0.000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000000705321  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6575  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  49.18 
 
 
67 aa  61.2  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.513102  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13677  cold shock protein A cspA  47.76 
 
 
67 aa  61.2  0.000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0108357  normal  0.108106 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0174  cold-shock DNA-binding protein family protein  46.97 
 
 
65 aa  61.2  0.000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000215085  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6907  cold-shock DNA-binding domain protein  46.15 
 
 
67 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.240211  normal  0.394944 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0777  cold-shock DNA-binding protein family protein  49.23 
 
 
67 aa  61.2  0.000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10670  cold-shock DNA-binding protein family  47.76 
 
 
67 aa  61.6  0.000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00582905  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0573  Cold-shock protein DNA-binding protein  46.27 
 
 
67 aa  61.2  0.000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2426  cold-shock DNA-binding domain protein  49.25 
 
 
67 aa  60.8  0.000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.386206  normal  0.184038 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0384  cold-shock DNA-binding protein family protein  47.76 
 
 
67 aa  60.8  0.000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2370  cold shock proteins  47.76 
 
 
66 aa  61.2  0.000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  6.71289e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2295  cold-shock DNA-binding protein family protein  46.27 
 
 
67 aa  60.8  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.904352  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0175  cold-shock DNA-binding protein family protein  46.27 
 
 
67 aa  61.2  0.000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2342  cold-shock DNA-binding protein family protein  46.27 
 
 
67 aa  60.8  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.432439 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1040  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  48.44 
 
 
67 aa  61.2  0.000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.366618  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2334  cold-shock DNA-binding protein family protein  46.27 
 
 
67 aa  60.8  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.213577  normal  0.0207687 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2588  cold-shock DNA-binding domain protein  47.69 
 
 
67 aa  60.8  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.110334  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0172  cold-shock DNA-binding domain protein  43.75 
 
 
67 aa  60.8  0.000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0000163048  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4566  putative cold-shock DNA-binding domain protein  46.88 
 
 
67 aa  60.8  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.55888  normal  0.0641574 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1521  cold-shock DNA-binding protein family protein  50 
 
 
68 aa  60.8  0.000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.490356  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2494  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  46.15 
 
 
67 aa  60.8  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.170049  decreased coverage  0.000196654 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1274  cold-shock DNA-binding protein family protein  47.69 
 
 
67 aa  60.8  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0982  cold-shock DNA-binding domain protein  50 
 
 
83 aa  60.8  0.000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000000734957  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1730  cold-shock DNA-binding protein family protein  52.38 
 
 
71 aa  60.8  0.000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.244991 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2681  cold-shock DNA-binding domain protein  47.69 
 
 
67 aa  60.8  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0114675  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2202  cold-shock DNA-binding protein family protein  45.31 
 
 
69 aa  60.8  0.000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.532688 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1250  cold-shock DNA-binding protein family protein  44.62 
 
 
71 aa  60.5  0.000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.124236  normal  0.203788 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0803  cold-shock DNA-binding domain protein  49.25 
 
 
66 aa  60.5  0.000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0273  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  45.45 
 
 
67 aa  60.5  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.355642 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1053  cold shock-like transcription regulator protein  46.15 
 
 
67 aa  60.5  0.000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.470883  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4798  cold-shock DNA-binding protein family protein  44.78 
 
 
67 aa  60.5  0.000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4884  cold-shock DNA-binding protein family protein  44.78 
 
 
67 aa  60.5  0.000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.71911  normal  0.101787 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5184  cold-shock DNA-binding protein family protein  44.78 
 
 
67 aa  60.5  0.000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00427326 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>