More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_0647 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_0647  cold-shock DNA-binding domain protein  100 
 
 
69 aa  139  1.9999999999999998e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0554  cold-shock DNA-binding domain protein  96.88 
 
 
64 aa  126  1.0000000000000001e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2592  cold-shock DNA-binding domain protein  93.65 
 
 
64 aa  122  2e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.00103043  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1585  cold-shock DNA-binding domain protein  92.19 
 
 
64 aa  120  6e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1312  cold-shock DNA-binding domain protein  89.06 
 
 
64 aa  120  9e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.632587 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0301  cold-shock DNA-binding domain protein  90.62 
 
 
64 aa  119  9.999999999999999e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2129  cold-shock DNA-binding domain protein  90.62 
 
 
64 aa  119  9.999999999999999e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1549  cold-shock DNA-binding domain protein  89.06 
 
 
64 aa  119  1.9999999999999998e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0339  cold-shock DNA-binding domain protein  92.06 
 
 
64 aa  119  1.9999999999999998e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.219193 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1550  cold-shock DNA-binding domain protein  89.06 
 
 
64 aa  118  1.9999999999999998e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1986  cold-shock DNA-binding domain protein  87.5 
 
 
64 aa  118  3e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.320623 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0430  cold-shock DNA-binding domain protein  90.62 
 
 
64 aa  117  3.9999999999999996e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1326  cold-shock DNA-binding domain protein  90.48 
 
 
64 aa  117  4.9999999999999996e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.706189  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1855  cold-shock DNA-binding domain protein  88.89 
 
 
64 aa  115  1.9999999999999998e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2850  cold-shock DNA-binding domain protein  88.89 
 
 
65 aa  115  1.9999999999999998e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0661  cold-shock DNA-binding domain protein  87.3 
 
 
64 aa  113  7.999999999999999e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.90481  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1421  cold-shock DNA-binding domain protein  90.48 
 
 
64 aa  113  1.0000000000000001e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0048  cold-shock DNA-binding domain protein  85.71 
 
 
64 aa  112  2.0000000000000002e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.152198  hitchhiker  0.00109076 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3545  cold-shock DNA-binding domain protein  85.71 
 
 
64 aa  108  2.0000000000000002e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2827  cold-shock DNA-binding domain protein  90.62 
 
 
64 aa  103  5e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.433406  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2828  cold-shock DNA-binding domain protein  89.06 
 
 
64 aa  102  2e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.272905  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1630  cold-shock DNA-binding domain protein  77.61 
 
 
68 aa  97.4  5e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.686511  normal  0.327142 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3576  cold-shock DNA-binding domain protein  84.38 
 
 
64 aa  96.3  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0386  cold-shock DNA-binding domain protein  66.67 
 
 
78 aa  90.1  1e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.659141  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0493  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  50 
 
 
66 aa  71.6  0.000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.156279  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1440  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  44.78 
 
 
67 aa  69.7  0.00000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1584  cold-shock DNA-binding protein family  49.25 
 
 
67 aa  68.9  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000297873  unclonable  9.08249e-24 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2053  cold-shock DNA-binding domain protein  49.23 
 
 
67 aa  67.4  0.00000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.203977  normal  0.0111256 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1131  cold-shock DNA-binding domain protein  49.25 
 
 
67 aa  66.6  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.294478 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6014  cold-shock DNA-binding protein family protein  46.27 
 
 
67 aa  65.5  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0368  cold-shock DNA-binding domain protein  49.23 
 
 
68 aa  65.9  0.0000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  2.16983e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07120  cold-shock DNA-binding protein family  53.12 
 
 
67 aa  65.5  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.976007  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0521  Cold-shock protein DNA-binding protein  49.28 
 
 
79 aa  65.9  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.49245  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2503  cold-shock DNA-binding protein family protein  46.88 
 
 
68 aa  65.1  0.0000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00000079429  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2963  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  46.15 
 
 
70 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.711924 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1668  cold-shock DNA-binding protein family protein  46.88 
 
 
67 aa  64.7  0.0000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.0000281076  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2904  cold-shock DNA-binding protein family protein  45.45 
 
 
71 aa  64.7  0.0000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0532076  normal  0.608581 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2200  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  52.24 
 
 
66 aa  64.3  0.0000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000689795  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5230  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  44.78 
 
 
67 aa  64.3  0.0000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.244858  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4566  putative cold-shock DNA-binding domain protein  47.69 
 
 
67 aa  63.9  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.55888  normal  0.0641574 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0252  cold-shock DNA-binding protein family protein  46.27 
 
 
67 aa  64.3  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.994476  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1055  cold-shock DNA-binding protein family protein  46.27 
 
 
67 aa  64.3  0.0000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.481948  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0273  cold-shock DNA-binding domain protein  46.27 
 
 
67 aa  64.3  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1250  cold-shock DNA-binding protein family protein  45.45 
 
 
71 aa  64.3  0.0000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.124236  normal  0.203788 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1251  cold-shock DNA-binding domain protein  43.94 
 
 
67 aa  63.9  0.0000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.791861  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0262  cold-shock DNA-binding domain protein  46.27 
 
 
67 aa  64.3  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3605  putative cold-shock DNA-binding domain protein  46.27 
 
 
67 aa  63.9  0.0000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.439248 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3621  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  50.75 
 
 
69 aa  63.9  0.0000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0652324  hitchhiker  0.000182164 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3093  cold-shock DNA-binding protein family protein  42.03 
 
 
72 aa  63.5  0.0000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.475725  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0751  cold-shock DNA-binding protein family protein  46.88 
 
 
67 aa  63.5  0.0000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0103  cold-shock DNA-binding domain protein  50.75 
 
 
67 aa  63.5  0.0000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0567  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  47.76 
 
 
67 aa  63.5  0.0000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000164882  normal  0.415354 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0972  CSD family cold shock protein  45.59 
 
 
77 aa  62.8  0.000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3880  cold-shock DNA-binding domain protein  47.76 
 
 
67 aa  62.8  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.902071  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6028  cold-shock DNA-binding protein family protein  44.78 
 
 
67 aa  63.5  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2370  cold shock proteins  47.76 
 
 
66 aa  62.8  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  6.71289e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1892  cold-shock DNA-binding domain protein  44.78 
 
 
67 aa  62.8  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3637  putative cold-shock DNA-binding domain protein  47.76 
 
 
67 aa  63.2  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0555  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  49.25 
 
 
66 aa  63.2  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000000705321  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2140  cold-shock DNA-binding protein family protein  43.94 
 
 
67 aa  62.8  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000000648799  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3948  cold-shock DNA-binding domain protein  46.27 
 
 
67 aa  62.8  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4269  cold-shock DNA-binding protein family protein  47.76 
 
 
67 aa  62.8  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1111  cold shock transcriptional regulator CspA  44.62 
 
 
70 aa  63.2  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3670  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  48.48 
 
 
66 aa  62.8  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000000254143  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2146  cold-shock DNA-binding domain protein  47.76 
 
 
66 aa  62.8  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3548  cold shock protein CspB  46.97 
 
 
66 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  4.8624399999999996e-45 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1720  cold shock protein CspB  50 
 
 
65 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.146917  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3553  cold shock protein CspB  46.97 
 
 
66 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000960966  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1771  cold shock protein CspB  50 
 
 
65 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.674817  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1512  cold shock protein CspB  50 
 
 
65 aa  62.4  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0532666  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3333  cold shock protein CspB  46.97 
 
 
66 aa  62.4  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000000000736097  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02480  cold-shock DNA-binding protein family  47.76 
 
 
67 aa  62.8  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.181166  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0320  cold-shock DNA-binding protein family  50 
 
 
68 aa  62.4  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.673011 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1484  cold shock protein  50 
 
 
65 aa  62.4  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00463121  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3297  cold shock protein  46.97 
 
 
66 aa  62.4  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.0310600000000001e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1474  cold shock protein  50 
 
 
65 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.259968  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3248  cold shock protein  46.97 
 
 
66 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000222014  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1463  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  46.27 
 
 
66 aa  62  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.302037  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1629  cold shock protein CspB  50 
 
 
65 aa  62.4  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3594  cold shock protein CspB  46.97 
 
 
66 aa  62.4  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000632893  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0218  putative cold-shock DNA-binding domain protein  47.76 
 
 
67 aa  62.8  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.230692  hitchhiker  0.00399283 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1264  cold-shock DNA-binding domain protein  47.76 
 
 
66 aa  62.4  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000176373  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3557  cold shock protein CspB  46.97 
 
 
66 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000616269  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1452  cold shock protein  48.57 
 
 
69 aa  62.4  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00528727  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3647  cold shock protein CspB  46.97 
 
 
66 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000702498  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1492  cold-shock protein DNA-binding  46.27 
 
 
66 aa  62  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000192979  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5227  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  44.78 
 
 
67 aa  62  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.54507  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1670  cold shock protein CspB  46.97 
 
 
66 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000143673  decreased coverage  2.4479999999999998e-23 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2498  cold-shock DNA-binding protein family protein  47.69 
 
 
70 aa  62  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000241121  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0668  cold-shock DNA-binding domain protein  46.27 
 
 
67 aa  61.6  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.16024  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4614  cold shock protein  48.48 
 
 
66 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000169422  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3353  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  46.27 
 
 
67 aa  62  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0827794  hitchhiker  0.00618792 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5134  cold-shock DNA-binding protein family protein  43.28 
 
 
67 aa  62  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.984065  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3679  cold shock protein CspB  50 
 
 
65 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.844549  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_5000  cold shock protein  44.78 
 
 
70 aa  61.6  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3052  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  44.78 
 
 
70 aa  61.6  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2295  cold-shock DNA-binding protein family protein  46.27 
 
 
67 aa  61.6  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.904352  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0172  cold-shock DNA-binding domain protein  45.31 
 
 
67 aa  61.6  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0000163048  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3123  cold-shock protein, DNA-binding  46.27 
 
 
67 aa  62  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0870951  normal  0.605091 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0306  cold shock domain-contain protein  43.08 
 
 
70 aa  62  0.000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.751232  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>