More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4566 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_4566  putative cold-shock DNA-binding domain protein  100 
 
 		 67 aa  137  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.55888  normal  0.0641574 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7468  cold-shock DNA-binding domain protein  86.36 
 
 		 68 aa  122  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3123  cold-shock protein, DNA-binding  79.1 
 
 		 67 aa  117  3.9999999999999996e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0870951  normal  0.605091 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3353  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  79.1 
 
 		 67 aa  117  3.9999999999999996e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0827794  hitchhiker  0.00618792 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0948  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  76.12 
 
 		 67 aa  110  7.000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.360484  normal  0.128926 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4477  cold-shock DNA-binding domain protein  80.6 
 
 		 67 aa  110  8.000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0628  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  76.12 
 
 		 67 aa  110  9e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0641  cold-shock DNA-binding domain protein  76.12 
 
 		 67 aa  109  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4023  cold-shock DNA-binding domain protein  76.12 
 
 		 67 aa  108  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00477592 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0472  cold-shock DNA-binding protein family protein  76.12 
 
 		 67 aa  108  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.16014  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4169  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  73.13 
 
 		 67 aa  107  4.0000000000000004e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.206868  normal  0.740799 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1580  cold-shock DNA-binding domain protein  73.13 
 
 		 67 aa  105  1e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.507056  normal  0.495998 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1263  cold-shock DNA-binding domain protein  76.12 
 
 		 67 aa  105  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1267  cold-shock DNA-binding domain protein  70.15 
 
 		 67 aa  105  3e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.922504  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2701  cold-shock DNA-binding domain protein  70.15 
 
 		 67 aa  105  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2415  cold-shock DNA-binding domain protein  70.15 
 
 		 67 aa  105  3e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.751848  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0220  cold-shock DNA-binding domain protein  71.21 
 
 		 67 aa  103  5e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0560  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  71.64 
 
 		 67 aa  103  6e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02480  cold-shock DNA-binding protein family  73.13 
 
 		 67 aa  103  6e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.181166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4469  cold-shock DNA-binding protein family protein  71.64 
 
 		 67 aa  103  7e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2426  cold-shock DNA-binding domain protein  71.64 
 
 		 67 aa  103  8e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.386206  normal  0.184038 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0218  putative cold-shock DNA-binding domain protein  71.88 
 
 		 67 aa  102  1e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.230692  hitchhiker  0.00399283 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4269  cold-shock DNA-binding protein family protein  70.15 
 
 		 67 aa  102  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5449  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  67.16 
 
 		 94 aa  100  5e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.265568  normal  0.248856 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1896  cold-shock DNA-binding domain protein  68.66 
 
 		 67 aa  100  5e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.385975  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3637  putative cold-shock DNA-binding domain protein  71.88 
 
 		 67 aa  100  8e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0668  cold-shock DNA-binding domain protein  67.16 
 
 		 67 aa  99.8  1e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.16024  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1762  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  67.16 
 
 		 67 aa  99  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00760021 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10670  cold-shock DNA-binding protein family  65.67 
 
 		 67 aa  99.4  2e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00582905  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1900  cold-shock DNA-binding domain protein  70.31 
 
 		 67 aa  99  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.030523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3366  cold-shock DNA-binding domain protein  67.16 
 
 		 67 aa  99  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1775  cold-shock protein, DNA-binding  67.16 
 
 		 67 aa  99  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26130  cold-shock DNA-binding protein family  68.18 
 
 		 67 aa  99  2e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6575  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  68.66 
 
 		 67 aa  98.6  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.513102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0260  cold-shock DNA-binding protein family protein  68.66 
 
 		 67 aa  98.6  3e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1668  cold-shock DNA-binding protein family protein  67.16 
 
 		 67 aa  97.8  4e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.0000281076  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0051  cold shock protein  68.75 
 
 		 69 aa  97.8  4e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.86437  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3292  cold-shock DNA-binding domain protein  65.67 
 
 		 67 aa  97.8  5e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.0070619  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1034  cold shock-like protein CspG  69.84 
 
 		 69 aa  97.1  6e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4386  cold-shock DNA-binding domain protein  68.18 
 
 		 67 aa  97.1  7e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.490734 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1165  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  70.31 
 
 		 69 aa  97.1  7e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.122246 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4276  cold-shock DNA-binding domain protein  68.18 
 
 		 67 aa  97.1  7e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2202  cold-shock DNA-binding protein family protein  67.69 
 
 		 69 aa  97.1  7e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.532688 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2129  cold-shock DNA-binding domain protein  70.31 
 
 		 69 aa  97.1  7e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01731  hypothetical protein  65.67 
 
 		 68 aa  96.7  9e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4042  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  65.67 
 
 		 67 aa  96.7  9e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1466  cold-shock DNA-binding domain protein  65.67 
 
 		 67 aa  96.3  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00122582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3614  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  65.67 
 
 		 70 aa  96.3  1e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.44614  hitchhiker  0.00284754 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02500  cold-shock DNA-binding protein family  70.97 
 
 		 62 aa  96.7  1e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.169268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2494  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  64.18 
 
 		 67 aa  96.3  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.170049  decreased coverage  0.000196654 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1131  cold-shock DNA-binding domain protein  70.31 
 
 		 67 aa  95.9  1e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.294478 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0735  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  65.15 
 
 		 70 aa  96.3  1e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4117  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  65.67 
 
 		 67 aa  95.5  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.327381  normal  0.21845 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0143  putative cold-shock DNA-binding domain protein  65.67 
 
 		 67 aa  95.1  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.113975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1388  cold-shock DNA-binding protein family protein  67.16 
 
 		 67 aa  95.1  3e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000202704  normal  0.239262 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0013  cold-shock DNA-binding domain protein  65.67 
 
 		 67 aa  95.1  3e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0988  cold-shock DNA-binding protein family protein  65.67 
 
 		 67 aa  95.1  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3176  cold-shock DNA-binding protein family protein  64.18 
 
 		 67 aa  95.1  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1049  cold-shock DNA-binding domain protein  65.67 
 
 		 67 aa  95.1  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2503  cold-shock DNA-binding protein family protein  65.67 
 
 		 68 aa  94.7  3e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00000079429  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1042  cold-shock DNA-binding domain protein  68.75 
 
 		 68 aa  95.1  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0301  cold-shock DNA-binding domain protein  68.18 
 
 		 67 aa  95.1  3e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00253542  normal  0.0688177 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0755  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  68.18 
 
 		 68 aa  95.1  3e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1045  cold-shock DNA-binding domain protein  65.67 
 
 		 67 aa  95.1  3e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.396466  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7382  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  65.67 
 
 		 67 aa  94.7  4e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0708981 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1358  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  66.15 
 
 		 70 aa  94.7  4e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000569017 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3141  cold-shock DNA-binding domain protein  63.64 
 
 		 67 aa  94.4  5e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0244532  hitchhiker  0.00153434 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2965  cold-shock DNA-binding domain protein  62.69 
 
 		 68 aa  94.4  5e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000138264 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3760  cold-shock DNA-binding protein family protein  69.23 
 
 		 69 aa  94  6e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.780435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1055  cold-shock DNA-binding protein family protein  68.75 
 
 		 67 aa  94  6e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.481948  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3652  cold-shock DNA-binding domain protein  62.69 
 
 		 67 aa  94  6e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1366  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  67.19 
 
 		 69 aa  93.6  7e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29050  cold-shock DNA-binding protein family  67.19 
 
 		 67 aa  94  7e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.415515  normal  0.771728 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1522  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  59.7 
 
 		 67 aa  93.6  8e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1465  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  59.7 
 
 		 67 aa  93.6  8e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.359616  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37160  cold-shock DNA-binding protein family  65.62 
 
 		 67 aa  93.6  8e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0943216 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2140  cold-shock DNA-binding protein family protein  67.19 
 
 		 67 aa  93.6  8e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000000648799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1881  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  70.31 
 
 		 69 aa  93.6  8e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0395263  normal  0.068791 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2869  cold-shock DNA-binding protein family protein  64.06 
 
 		 67 aa  93.6  8e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0181409  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0587  cold-shock DNA-binding domain protein  62.69 
 
 		 67 aa  93.6  9e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1053  cold shock-like transcription regulator protein  68.75 
 
 		 67 aa  92.8  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.470883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0103  cold-shock DNA-binding domain protein  68.75 
 
 		 67 aa  92.8  1e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1672  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  65.67 
 
 		 73 aa  93.2  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.974123 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3558  cold-shock DNA-binding protein family protein  69.23 
 
 		 69 aa  93.2  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.914458 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1464  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  66.67 
 
 		 69 aa  93.2  1e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2883  cold-shock DNA-binding domain protein  66.67 
 
 		 69 aa  93.2  1e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00808952 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3784  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  65.15 
 
 		 69 aa  93.2  1e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1500  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  66.67 
 
 		 69 aa  93.2  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3895  cold-shock DNA-binding domain protein  65.15 
 
 		 67 aa  92.4  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0002  cold shock-like transcription regulator protein  65.15 
 
 		 67 aa  92.4  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  unclonable  0.0000000106276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2784  cold-shock protein DNA-binding  65.67 
 
 		 66 aa  92  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8911  putative cold-shock DNA-binding domain protein  65.67 
 
 		 66 aa  92.4  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2727  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  65.67 
 
 		 66 aa  92  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2681  cold-shock DNA-binding domain protein  64.06 
 
 		 67 aa  92  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0114675  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0252  cold-shock DNA-binding protein family protein  64.18 
 
 		 67 aa  92  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.994476  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1274  cold-shock DNA-binding protein family protein  64.06 
 
 		 67 aa  92  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2061  cold-shock DNA-binding protein family protein  64.18 
 
 		 67 aa  92  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.131927 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0273  cold-shock DNA-binding domain protein  64.18 
 
 		 67 aa  92  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0262  cold-shock DNA-binding domain protein  64.18 
 
 		 67 aa  92  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2588  cold-shock DNA-binding domain protein  64.06 
 
 		 67 aa  92  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.110334  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>