More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_3545 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_3545  cold-shock DNA-binding domain protein  100 
 
 
64 aa  129  2.0000000000000002e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1421  cold-shock DNA-binding domain protein  95.24 
 
 
64 aa  122  2e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1855  cold-shock DNA-binding domain protein  89.06 
 
 
64 aa  116  9.999999999999999e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2850  cold-shock DNA-binding domain protein  87.5 
 
 
65 aa  114  3e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1326  cold-shock DNA-binding domain protein  85.94 
 
 
64 aa  112  2.0000000000000002e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.706189  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0339  cold-shock DNA-binding domain protein  85.94 
 
 
64 aa  111  3e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.219193 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0430  cold-shock DNA-binding domain protein  85.71 
 
 
64 aa  111  4.0000000000000004e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0048  cold-shock DNA-binding domain protein  82.81 
 
 
64 aa  110  9e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.152198  hitchhiker  0.00109076 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2129  cold-shock DNA-binding domain protein  82.54 
 
 
64 aa  108  2.0000000000000002e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0301  cold-shock DNA-binding domain protein  82.54 
 
 
64 aa  108  2.0000000000000002e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0647  cold-shock DNA-binding domain protein  85.71 
 
 
69 aa  108  2.0000000000000002e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0661  cold-shock DNA-binding domain protein  85.71 
 
 
64 aa  108  2.0000000000000002e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.90481  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2592  cold-shock DNA-binding domain protein  82.81 
 
 
64 aa  108  2.0000000000000002e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.00103043  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1986  cold-shock DNA-binding domain protein  82.54 
 
 
64 aa  108  4.0000000000000004e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.320623 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0554  cold-shock DNA-binding domain protein  84.13 
 
 
64 aa  107  4.0000000000000004e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1312  cold-shock DNA-binding domain protein  80.95 
 
 
64 aa  106  1e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.632587 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1585  cold-shock DNA-binding domain protein  80.95 
 
 
64 aa  103  9e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0386  cold-shock DNA-binding domain protein  80.88 
 
 
78 aa  102  1e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.659141  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1550  cold-shock DNA-binding domain protein  76.19 
 
 
64 aa  100  8e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1549  cold-shock DNA-binding domain protein  74.6 
 
 
64 aa  98.6  3e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1630  cold-shock DNA-binding domain protein  77.94 
 
 
68 aa  97.1  7e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.686511  normal  0.327142 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2827  cold-shock DNA-binding domain protein  80.95 
 
 
64 aa  89  2e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.433406  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3576  cold-shock DNA-binding domain protein  77.78 
 
 
64 aa  84.7  4e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2828  cold-shock DNA-binding domain protein  76.19 
 
 
64 aa  84.3  4e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.272905  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0493  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  48.48 
 
 
66 aa  68.9  0.00000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.156279  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1440  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  45.45 
 
 
67 aa  68.2  0.00000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2053  cold-shock DNA-binding domain protein  48.44 
 
 
67 aa  65.5  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.203977  normal  0.0111256 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3214  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  48.48 
 
 
67 aa  65.1  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0979697  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0557  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  51.52 
 
 
67 aa  65.1  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0146749  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1131  cold-shock DNA-binding domain protein  48.44 
 
 
67 aa  63.5  0.0000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.294478 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0658  cold-shock DNA-binding domain protein  49.25 
 
 
66 aa  63.2  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.18008e-25 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0645  cold-shock DNA-binding domain protein  49.25 
 
 
66 aa  63.5  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000000155303  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1251  cold-shock DNA-binding domain protein  43.94 
 
 
67 aa  63.2  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.791861  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3948  cold-shock DNA-binding domain protein  46.15 
 
 
67 aa  62.8  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2200  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  51.52 
 
 
66 aa  63.2  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000689795  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0262  cold-shock DNA-binding domain protein  45.45 
 
 
67 aa  62.8  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3186  cold-shock DNA-binding domain protein  48.48 
 
 
67 aa  62.4  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000014796  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6014  cold-shock DNA-binding protein family protein  45.31 
 
 
67 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4169  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  46.88 
 
 
67 aa  62  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.206868  normal  0.740799 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0252  cold-shock DNA-binding protein family protein  45.45 
 
 
67 aa  62.8  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.994476  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0172  cold-shock DNA-binding domain protein  44.62 
 
 
67 aa  62.4  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0000163048  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1055  cold-shock DNA-binding protein family protein  46.88 
 
 
67 aa  62.4  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.481948  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0273  cold-shock DNA-binding domain protein  45.45 
 
 
67 aa  62.8  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0567  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  48.48 
 
 
67 aa  62.8  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000164882  normal  0.415354 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2221  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  47.76 
 
 
66 aa  62  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000348612  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2494  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  45.31 
 
 
67 aa  61.6  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.170049  decreased coverage  0.000196654 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1077  cold-shock DNA-binding domain protein  48.48 
 
 
66 aa  61.6  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.27833e-32 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3185  cold-shock DNA-binding domain protein  48.48 
 
 
66 aa  61.6  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000000997397  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3711  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  48.48 
 
 
66 aa  61.2  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000509741  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3670  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  46.97 
 
 
66 aa  61.2  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000000254143  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0191  cold-shock DNA-binding domain protein  46.97 
 
 
66 aa  61.2  0.000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  8.97537e-36 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0226  cold-shock DNA-binding protein family protein  48.44 
 
 
65 aa  61.2  0.000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000017804  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0733  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  46.88 
 
 
67 aa  60.8  0.000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.0000585148  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4386  cold-shock DNA-binding domain protein  43.08 
 
 
67 aa  60.8  0.000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.490734 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2466  cold shock-like transcription regulator protein  43.75 
 
 
67 aa  60.8  0.000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.4868  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07120  cold-shock DNA-binding protein family  48.44 
 
 
67 aa  60.8  0.000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.976007  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0273  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  43.94 
 
 
67 aa  60.8  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.355642 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4276  cold-shock DNA-binding domain protein  43.08 
 
 
67 aa  60.8  0.000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2140  cold-shock DNA-binding protein family protein  42.42 
 
 
67 aa  60.8  0.000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000000648799  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1391  cold-shock DNA-binding domain protein  46.97 
 
 
66 aa  60.5  0.000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000000857842  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4380  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  46.97 
 
 
66 aa  60.5  0.000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000149248  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6028  cold-shock DNA-binding protein family protein  43.75 
 
 
67 aa  60.5  0.000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2370  cold shock proteins  46.97 
 
 
66 aa  60.5  0.000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  6.71289e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5269  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  45.31 
 
 
67 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0859722 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3548  cold shock protein CspB  48.44 
 
 
66 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  4.8624399999999996e-45 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3553  cold shock protein CspB  48.44 
 
 
66 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000960966  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3333  cold shock protein CspB  48.44 
 
 
66 aa  59.7  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000000000736097  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3557  cold shock protein CspB  48.44 
 
 
66 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000616269  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3647  cold shock protein CspB  48.44 
 
 
66 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000702498  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3297  cold shock protein  48.44 
 
 
66 aa  59.7  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.0310600000000001e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3248  cold shock protein  48.44 
 
 
66 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000222014  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1267  cold-shock DNA-binding domain protein  46.15 
 
 
67 aa  59.7  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.922504  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3093  cold-shock DNA-binding protein family protein  43.75 
 
 
72 aa  60.1  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.475725  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1670  cold shock protein CspB  48.44 
 
 
66 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000143673  decreased coverage  2.4479999999999998e-23 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2701  cold-shock DNA-binding domain protein  45.31 
 
 
67 aa  60.1  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0208  cold-shock DNA-binding domain protein  45.45 
 
 
66 aa  59.7  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000000807689  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0340  cold-shock DNA-binding protein family protein  45.45 
 
 
66 aa  60.1  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  3.6796e-20  unclonable  6.2466300000000005e-24 
 
 
 
NC_007530  GBAA_3594  cold shock protein CspB  48.44 
 
 
66 aa  59.7  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000632893  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2246  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  42.19 
 
 
67 aa  59.7  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.000000157436  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4117  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  45.31 
 
 
67 aa  59.7  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.327381  normal  0.21845 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4269  cold-shock DNA-binding protein family protein  46.88 
 
 
67 aa  60.1  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000590  cold shock protein CspA  44.44 
 
 
69 aa  60.1  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00446829  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4566  putative cold-shock DNA-binding domain protein  44.62 
 
 
67 aa  60.1  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.55888  normal  0.0641574 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1049  cold-shock DNA-binding domain protein  46.88 
 
 
67 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2891  cold-shock DNA-binding domain protein  45.45 
 
 
66 aa  59.3  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.87323e-28 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0237  cold-shock DNA-binding protein family protein  43.94 
 
 
66 aa  59.3  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000692047  hitchhiker  0.0000000000000296416 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0641  cold-shock DNA-binding domain protein  45.31 
 
 
67 aa  58.9  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0521  Cold-shock protein DNA-binding protein  46.88 
 
 
79 aa  58.9  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.49245  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0988  cold-shock DNA-binding protein family protein  46.88 
 
 
67 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1264  cold-shock DNA-binding domain protein  46.97 
 
 
66 aa  58.9  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000176373  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1715  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  43.55 
 
 
69 aa  59.3  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1045  cold-shock DNA-binding domain protein  46.88 
 
 
67 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.396466  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2503  cold-shock DNA-binding protein family protein  43.75 
 
 
68 aa  59.3  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00000079429  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2894  cold-shock DNA-binding protein family protein  43.75 
 
 
69 aa  58.9  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.620309 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0368  cold-shock DNA-binding domain protein  46.88 
 
 
68 aa  58.9  0.00000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  2.16983e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01731  hypothetical protein  42.19 
 
 
68 aa  58.9  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2754  cold-shock DNA-binding protein family protein  40.62 
 
 
69 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2965  cold-shock DNA-binding domain protein  41.54 
 
 
68 aa  58.5  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000138264 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1274  cold-shock DNA-binding protein family protein  43.75 
 
 
67 aa  58.5  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2951  cold-shock DNA-binding protein family protein  42.19 
 
 
77 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.15288  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>