More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_2850 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_2850  cold-shock DNA-binding domain protein  100 
 
 
65 aa  130  3.9999999999999996e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1855  cold-shock DNA-binding domain protein  93.75 
 
 
64 aa  124  4.0000000000000003e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0430  cold-shock DNA-binding domain protein  93.65 
 
 
64 aa  120  8e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2592  cold-shock DNA-binding domain protein  89.06 
 
 
64 aa  117  4.9999999999999996e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.00103043  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0301  cold-shock DNA-binding domain protein  88.89 
 
 
64 aa  117  6e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1326  cold-shock DNA-binding domain protein  87.5 
 
 
64 aa  115  1.9999999999999998e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.706189  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1421  cold-shock DNA-binding domain protein  90.48 
 
 
64 aa  115  1.9999999999999998e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0647  cold-shock DNA-binding domain protein  88.89 
 
 
69 aa  115  1.9999999999999998e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3545  cold-shock DNA-binding domain protein  87.5 
 
 
64 aa  114  3e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0339  cold-shock DNA-binding domain protein  87.5 
 
 
64 aa  115  3e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.219193 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0554  cold-shock DNA-binding domain protein  87.3 
 
 
64 aa  114  5e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2129  cold-shock DNA-binding domain protein  85.71 
 
 
64 aa  114  5e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0661  cold-shock DNA-binding domain protein  85.71 
 
 
64 aa  112  2.0000000000000002e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.90481  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1585  cold-shock DNA-binding domain protein  87.3 
 
 
64 aa  112  3e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1986  cold-shock DNA-binding domain protein  84.13 
 
 
64 aa  112  3e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.320623 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0048  cold-shock DNA-binding domain protein  81.25 
 
 
64 aa  110  6e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.152198  hitchhiker  0.00109076 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1549  cold-shock DNA-binding domain protein  82.54 
 
 
64 aa  109  2.0000000000000002e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1550  cold-shock DNA-binding domain protein  80.95 
 
 
64 aa  107  4.0000000000000004e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1312  cold-shock DNA-binding domain protein  79.37 
 
 
64 aa  107  5e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.632587 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1630  cold-shock DNA-binding domain protein  79.41 
 
 
68 aa  102  1e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.686511  normal  0.327142 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0386  cold-shock DNA-binding domain protein  75 
 
 
78 aa  95.9  2e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.659141  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2828  cold-shock DNA-binding domain protein  82.54 
 
 
64 aa  93.6  8e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.272905  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2827  cold-shock DNA-binding domain protein  80.95 
 
 
64 aa  92.8  1e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.433406  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3576  cold-shock DNA-binding domain protein  80.95 
 
 
64 aa  90.5  8e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0493  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  46.97 
 
 
66 aa  68.6  0.00000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.156279  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1440  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  43.94 
 
 
67 aa  67.4  0.00000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2053  cold-shock DNA-binding domain protein  50 
 
 
67 aa  67.4  0.00000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.203977  normal  0.0111256 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1251  cold-shock DNA-binding domain protein  45.45 
 
 
67 aa  67  0.00000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.791861  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1131  cold-shock DNA-binding domain protein  48.44 
 
 
67 aa  65.5  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.294478 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07120  cold-shock DNA-binding protein family  51.56 
 
 
67 aa  65.5  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.976007  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0262  cold-shock DNA-binding domain protein  45.45 
 
 
67 aa  64.3  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0252  cold-shock DNA-binding protein family protein  45.45 
 
 
67 aa  64.3  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.994476  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0273  cold-shock DNA-binding domain protein  45.45 
 
 
67 aa  64.3  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1055  cold-shock DNA-binding protein family protein  46.88 
 
 
67 aa  63.9  0.0000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.481948  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01731  hypothetical protein  44.62 
 
 
68 aa  63.5  0.0000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2466  cold shock-like transcription regulator protein  45.31 
 
 
67 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.4868  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4386  cold-shock DNA-binding domain protein  43.08 
 
 
67 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.490734 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2965  cold-shock DNA-binding domain protein  44.62 
 
 
68 aa  63.5  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000138264 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4276  cold-shock DNA-binding domain protein  43.08 
 
 
67 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0103  cold-shock DNA-binding domain protein  48.44 
 
 
67 aa  62.8  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2724  cold-shock DNA-binding domain protein  53.03 
 
 
66 aa  62.8  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.720009  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0273  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  43.28 
 
 
67 aa  62  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.355642 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3093  cold-shock DNA-binding protein family protein  43.75 
 
 
72 aa  62.4  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.475725  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6014  cold-shock DNA-binding protein family protein  42.19 
 
 
67 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2532  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  51.52 
 
 
65 aa  62.4  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.19716  normal  0.287944 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0172  cold-shock DNA-binding domain protein  43.08 
 
 
67 aa  62.8  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0000163048  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2246  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  42.19 
 
 
67 aa  62.4  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.000000157436  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1235  cold-shock DNA-binding protein family protein  53.03 
 
 
66 aa  62.8  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0557  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  50 
 
 
67 aa  62.8  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0146749  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2630  cold-shock DNA-binding domain protein  53.03 
 
 
66 aa  62.8  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.681724  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2494  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  45.31 
 
 
67 aa  62  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.170049  decreased coverage  0.000196654 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3186  cold-shock DNA-binding domain protein  50 
 
 
67 aa  62  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000014796  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3948  cold-shock DNA-binding domain protein  44.62 
 
 
67 aa  61.6  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3214  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  48.48 
 
 
67 aa  61.6  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0979697  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4269  cold-shock DNA-binding protein family protein  46.88 
 
 
67 aa  61.6  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2681  cold-shock DNA-binding domain protein  45.31 
 
 
67 aa  61.6  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0114675  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2221  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  47.76 
 
 
66 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000348612  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3670  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  48.48 
 
 
66 aa  61.6  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000000254143  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2588  cold-shock DNA-binding domain protein  45.31 
 
 
67 aa  61.6  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.110334  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1274  cold-shock DNA-binding protein family protein  45.31 
 
 
67 aa  61.6  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1189  cold shock protein CspE  44.44 
 
 
69 aa  61.6  0.000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0368  cold-shock DNA-binding domain protein  46.88 
 
 
68 aa  61.2  0.000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  2.16983e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0590  cold-shock protein  46.97 
 
 
67 aa  60.8  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.000832642  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0521  Cold-shock protein DNA-binding protein  46.88 
 
 
79 aa  60.8  0.000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.49245  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4117  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  45.31 
 
 
67 aa  60.8  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.327381  normal  0.21845 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0174  cold-shock DNA-binding protein family protein  43.94 
 
 
65 aa  60.8  0.000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000215085  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5398  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  45.31 
 
 
67 aa  60.8  0.000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.262283  normal  0.0908383 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0742  cold-shock DNA-binding domain protein  46.97 
 
 
67 aa  60.8  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.0000000000219995  unclonable  0.0000000000274746 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1392  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  45.31 
 
 
67 aa  60.8  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.124556  normal  0.329269 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02480  cold-shock DNA-binding protein family  46.88 
 
 
67 aa  60.8  0.000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.181166  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2951  cold-shock DNA-binding protein family protein  42.19 
 
 
77 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.15288  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1267  cold-shock DNA-binding domain protein  46.15 
 
 
67 aa  60.8  0.000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.922504  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4798  cold-shock DNA-binding protein family protein  45.31 
 
 
67 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4884  cold-shock DNA-binding protein family protein  45.31 
 
 
67 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.71911  normal  0.101787 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5184  cold-shock DNA-binding protein family protein  45.31 
 
 
67 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00427326 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0191  cold-shock DNA-binding domain protein  46.97 
 
 
66 aa  60.5  0.000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  8.97537e-36 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0567  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  48.48 
 
 
67 aa  60.5  0.000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000164882  normal  0.415354 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0645  cold-shock DNA-binding domain protein  47.76 
 
 
66 aa  60.5  0.000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000000155303  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0855  cold-shock DNA-binding protein family protein  42.19 
 
 
68 aa  60.5  0.000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.563444  normal  0.445485 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2503  cold-shock DNA-binding protein family protein  42.19 
 
 
68 aa  60.5  0.000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00000079429  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0208  cold-shock DNA-binding domain protein  46.97 
 
 
66 aa  60.5  0.000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000000807689  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6907  cold-shock DNA-binding domain protein  42.19 
 
 
67 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.240211  normal  0.394944 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00593  cold shock protein E  44.44 
 
 
69 aa  60.5  0.000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.337159  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3002  cold-shock DNA-binding domain protein  44.44 
 
 
69 aa  60.5  0.000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0574427  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0644  cold shock protein CspE  44.44 
 
 
69 aa  60.5  0.000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0784428  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0712  cold shock protein CspE  44.44 
 
 
69 aa  60.5  0.000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0018015  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0675  cold shock protein CspE  44.44 
 
 
69 aa  60.5  0.000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000392249  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1291  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  42.19 
 
 
67 aa  60.1  0.000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.515471  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2140  cold-shock DNA-binding protein family protein  39.39 
 
 
67 aa  60.1  0.000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000000648799  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00582  hypothetical protein  44.44 
 
 
69 aa  60.5  0.000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.287726  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3021  cold shock protein CspE  44.44 
 
 
69 aa  60.5  0.000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0130834  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0538  cold shock protein CspE  44.44 
 
 
69 aa  60.5  0.000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0648  cold shock protein CspE  44.44 
 
 
69 aa  60.5  0.000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00594526  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1053  cold shock-like transcription regulator protein  42.19 
 
 
67 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.470883  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13677  cold shock protein A cspA  45.31 
 
 
67 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0108357  normal  0.108106 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2197  cold-shock DNA-binding domain protein  46.97 
 
 
66 aa  59.7  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000106738  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6028  cold-shock DNA-binding protein family protein  40.62 
 
 
67 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3637  putative cold-shock DNA-binding domain protein  45.31 
 
 
67 aa  60.1  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1750  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  43.75 
 
 
67 aa  60.1  0.00000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0957427  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1668  cold-shock DNA-binding protein family protein  42.19 
 
 
67 aa  59.7  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.0000281076  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>