57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3633 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_3633  PepSY-associated TM helix  100 
 
 		 213 aa  433  1e-120  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2813  PepSY-associated TM helix  83.49 
 
 		 221 aa  349  2e-95  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3730  hypothetical protein  58.42 
 
 		 209 aa  256  2e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.301466 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0424  PepSY-associated TM helix  53.92 
 
 		 207 aa  248  7e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.906941 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5640  hypothetical protein  54.21 
 
 		 223 aa  239  2e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5057  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  53.92 
 
 		 212 aa  237  1e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.176839 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1710  hypothetical protein  50.98 
 
 		 216 aa  233  1.0000000000000001e-60  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.860634  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1639  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  50.98 
 
 		 216 aa  232  4.0000000000000004e-60  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1076  PepSY-associated TM helix domain protein  56.06 
 
 		 225 aa  227  9e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.765993  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0987  PepSY-associated TM helix domain protein  54.45 
 
 		 204 aa  222  3e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.162613 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5215  PepSY-associated TM helix  55.5 
 
 		 218 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0430  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  56.22 
 
 		 211 aa  219  1.9999999999999999e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.181107  normal  0.797798 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3988  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  58.42 
 
 		 228 aa  215  2.9999999999999998e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.580617 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12400  PepSY-associated TM helix  57.46 
 
 		 199 aa  214  9.999999999999999e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1500  PepSY-associated TM helix domain protein  32.14 
 
 		 212 aa  88.2  9e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.171935  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000841  hypothetical protein  31.71 
 
 		 209 aa  77.4  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0040  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  33.33 
 
 		 208 aa  75.1  0.0000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2152  PepSY-associated TM helix  31.87 
 
 		 191 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.482162  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3297  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  35.57 
 
 		 226 aa  68.2  0.00000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0897886  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1075  hypothetical protein  34.23 
 
 		 177 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0704726  normal  0.124163 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0118  membrane protein  28.89 
 
 		 214 aa  67.4  0.0000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1188  hypothetical protein  32.89 
 
 		 177 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1010  hypothetical protein  33.56 
 
 		 177 aa  67  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0372015  normal  0.0671955 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1112  PepSY-associated TM helix domain protein  35.57 
 
 		 198 aa  67  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00122652  hitchhiker  0.000000000766556 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3433  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  35.57 
 
 		 198 aa  67  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.527066  hitchhiker  0.000475318 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2850  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  33.56 
 
 		 212 aa  67  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000664158  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3255  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  35.57 
 
 		 226 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00662139  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1014  hypothetical protein  33.56 
 
 		 177 aa  65.9  0.0000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.235833  hitchhiker  0.00784249 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3029  hypothetical protein  23.86 
 
 		 218 aa  66.2  0.0000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.178112  hitchhiker  0.000157336 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06750  hypothetical protein  31.82 
 
 		 161 aa  65.9  0.0000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1855  hypothetical protein  25.71 
 
 		 177 aa  59.7  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0378502  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0206  PepSY-associated TM helix family protein  27.98 
 
 		 248 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3126  hypothetical protein  27.07 
 
 		 186 aa  54.7  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0240  hypothetical protein  26.79 
 
 		 239 aa  53.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0422  PepSY-associated TM helix family protein  26.79 
 
 		 248 aa  53.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0450107  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3287  hypothetical protein  26.79 
 
 		 248 aa  53.5  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3394  hypothetical protein  26.79 
 
 		 239 aa  53.5  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2952  hypothetical protein  26.79 
 
 		 239 aa  53.5  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.442146  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2136  hypothetical protein  26.79 
 
 		 239 aa  53.5  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0228  hypothetical protein  26.79 
 
 		 239 aa  53.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.165958  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2969  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  29.17 
 
 		 244 aa  53.5  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.137689  normal  0.135359 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3103  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  29.17 
 
 		 231 aa  53.1  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.775507  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3055  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  28.57 
 
 		 251 aa  52.4  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2808  hypothetical protein  34.88 
 
 		 201 aa  52.4  0.000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.994405 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2998  PepSY-associated TM helix domain protein  25 
 
 		 254 aa  52.4  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6407  hypothetical protein  28.19 
 
 		 244 aa  51.6  0.000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.281041 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7103  PepSY-associated TM helix domain protein  25.97 
 
 		 240 aa  50.1  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3345  PepSY-associated TM helix domain protein  24.11 
 
 		 258 aa  50.4  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.649992 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2444  PepSY-associated TM helix  27.98 
 
 		 231 aa  49.3  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0220  hypothetical protein  27.57 
 
 		 240 aa  49.3  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3058  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  27.98 
 
 		 244 aa  49.3  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.543499  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3077  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  27.38 
 
 		 244 aa  47.8  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3067  hypothetical protein  25.12 
 
 		 247 aa  45.1  0.0008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.438529  normal  0.387636 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3790  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  30.56 
 
 		 265 aa  44.7  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000212157  decreased coverage  0.000000557586 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3576  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  27.78 
 
 		 233 aa  43.9  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.548586 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5003  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  26.24 
 
 		 239 aa  43.1  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.862813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4478  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  27.27 
 
 		 239 aa  42.4  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>