55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMASAVP1_A2952 on replicon NC_008785
Organism: Burkholderia mallei SAVP1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009080  BMA10247_3394  hypothetical protein  100 
 
 
239 aa  477  1e-134  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0240  hypothetical protein  100 
 
 
239 aa  477  1e-134  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2136  hypothetical protein  100 
 
 
239 aa  477  1e-134  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2952  hypothetical protein  100 
 
 
239 aa  477  1e-134  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.442146  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3287  hypothetical protein  99.58 
 
 
248 aa  476  1e-133  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0422  PepSY-associated TM helix family protein  99.58 
 
 
248 aa  476  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0450107  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0228  hypothetical protein  99.58 
 
 
239 aa  476  1e-133  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.165958  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0206  PepSY-associated TM helix family protein  92.89 
 
 
248 aa  412  1e-114  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6407  hypothetical protein  75.51 
 
 
244 aa  348  3e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.281041 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3055  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  76.19 
 
 
251 aa  327  7e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3058  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  76.33 
 
 
244 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.543499  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2969  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  75.66 
 
 
244 aa  324  7e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.137689  normal  0.135359 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3077  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  75.51 
 
 
244 aa  323  1e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2444  PepSY-associated TM helix  79.04 
 
 
231 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3103  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  79.33 
 
 
231 aa  318  5e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.775507  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0220  hypothetical protein  61.51 
 
 
240 aa  308  5e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7103  PepSY-associated TM helix domain protein  61.51 
 
 
240 aa  305  4.0000000000000004e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2345  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  56.2 
 
 
248 aa  277  8e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.755435  normal  0.0903937 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4478  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  63.41 
 
 
239 aa  263  2e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5003  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  62.62 
 
 
239 aa  260  1e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.862813  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4358  hypothetical protein  62.04 
 
 
246 aa  260  1e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3576  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  61.08 
 
 
233 aa  259  2e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.548586 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2998  PepSY-associated TM helix domain protein  44.89 
 
 
254 aa  191  1e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3345  PepSY-associated TM helix domain protein  44.89 
 
 
258 aa  189  4e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.649992 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3067  hypothetical protein  46.08 
 
 
247 aa  178  8e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.438529  normal  0.387636 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2392  PepSY-associated TM helix  40.39 
 
 
258 aa  168  8e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.932712  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0088  hypothetical protein  71.7 
 
 
54 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1639  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  27.67 
 
 
216 aa  61.6  0.00000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3730  hypothetical protein  28.06 
 
 
209 aa  60.8  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.301466 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1710  hypothetical protein  28.8 
 
 
216 aa  60.1  0.00000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.860634  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5215  PepSY-associated TM helix  30.05 
 
 
218 aa  58.9  0.00000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3633  PepSY-associated TM helix  27.67 
 
 
213 aa  58.5  0.00000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000841  hypothetical protein  28.42 
 
 
209 aa  54.3  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12400  PepSY-associated TM helix  29.63 
 
 
199 aa  53.1  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1855  hypothetical protein  23.68 
 
 
177 aa  51.6  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0378502  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2661  hypothetical protein  30.39 
 
 
225 aa  50.8  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.522386  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5057  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  25.64 
 
 
212 aa  50.1  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.176839 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5640  hypothetical protein  26.88 
 
 
223 aa  48.9  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0987  PepSY-associated TM helix domain protein  28.8 
 
 
204 aa  48.9  0.00007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.162613 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1500  PepSY-associated TM helix domain protein  25 
 
 
212 aa  47.8  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.171935  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2152  PepSY-associated TM helix  27.12 
 
 
191 aa  48.1  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.482162  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0430  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  25.86 
 
 
211 aa  47.4  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.181107  normal  0.797798 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2813  PepSY-associated TM helix  28.1 
 
 
221 aa  47  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3297  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  25.69 
 
 
226 aa  45.8  0.0005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0897886  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2850  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  27.14 
 
 
212 aa  46.2  0.0005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000664158  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3255  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  25.69 
 
 
226 aa  45.8  0.0006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00662139  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1014  hypothetical protein  25.42 
 
 
177 aa  44.7  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.235833  hitchhiker  0.00784249 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1075  hypothetical protein  25.42 
 
 
177 aa  44.7  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0704726  normal  0.124163 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1188  hypothetical protein  24.86 
 
 
177 aa  44.7  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3988  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  26.77 
 
 
228 aa  44.3  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.580617 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1010  hypothetical protein  25.47 
 
 
177 aa  43.9  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0372015  normal  0.0671955 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0424  PepSY-associated TM helix  24.48 
 
 
207 aa  43.9  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.906941 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0118  membrane protein  24.48 
 
 
214 aa  43.1  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1076  PepSY-associated TM helix domain protein  27.13 
 
 
225 aa  42.7  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.765993  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3029  hypothetical protein  24.76 
 
 
218 aa  41.6  0.01  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.178112  hitchhiker  0.000157336 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>