38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A2661 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A2661  hypothetical protein  100 
 
 		 225 aa  454  1e-127  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.522386  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6407  hypothetical protein  29.65 
 
 		 244 aa  86.3  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.281041 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3077  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  30.86 
 
 		 244 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3058  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  29.71 
 
 		 244 aa  82  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.543499  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2444  PepSY-associated TM helix  29.71 
 
 		 231 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3103  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  29.78 
 
 		 231 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.775507  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0220  hypothetical protein  27.23 
 
 		 240 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7103  PepSY-associated TM helix domain protein  27.23 
 
 		 240 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2969  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  29.94 
 
 		 244 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.137689  normal  0.135359 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4358  hypothetical protein  29.28 
 
 		 246 aa  78.6  0.00000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3055  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  30.29 
 
 		 251 aa  78.6  0.00000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2392  PepSY-associated TM helix  30.05 
 
 		 258 aa  77.8  0.0000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.932712  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2345  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  26.36 
 
 		 248 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.755435  normal  0.0903937 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4478  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  28.28 
 
 		 239 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0206  PepSY-associated TM helix family protein  29.89 
 
 		 248 aa  75.5  0.0000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5003  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  28.79 
 
 		 239 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.862813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0422  PepSY-associated TM helix family protein  29.51 
 
 		 248 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0450107  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3287  hypothetical protein  29.51 
 
 		 248 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2952  hypothetical protein  30.43 
 
 		 239 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.442146  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2136  hypothetical protein  30.43 
 
 		 239 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0228  hypothetical protein  30.43 
 
 		 239 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.165958  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0240  hypothetical protein  30.43 
 
 		 239 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3394  hypothetical protein  30.43 
 
 		 239 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2998  PepSY-associated TM helix domain protein  25.11 
 
 		 254 aa  71.6  0.000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3576  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  27.78 
 
 		 233 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.548586 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3345  PepSY-associated TM helix domain protein  24.66 
 
 		 258 aa  69.3  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.649992 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3067  hypothetical protein  25.25 
 
 		 247 aa  67.8  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.438529  normal  0.387636 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1855  hypothetical protein  27.04 
 
 		 177 aa  66.2  0.0000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0378502  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1710  hypothetical protein  38.46 
 
 		 216 aa  51.6  0.000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.860634  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5057  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  25.79 
 
 		 212 aa  50.1  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.176839 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1639  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  29.41 
 
 		 216 aa  50.8  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5215  PepSY-associated TM helix  27.72 
 
 		 218 aa  50.4  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3730  hypothetical protein  27.59 
 
 		 209 aa  49.7  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.301466 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5640  hypothetical protein  24.41 
 
 		 223 aa  48.1  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0987  PepSY-associated TM helix domain protein  27.86 
 
 		 204 aa  47  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.162613 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3029  hypothetical protein  23.08 
 
 		 218 aa  44.7  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.178112  hitchhiker  0.000157336 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0118  membrane protein  22.07 
 
 		 214 aa  43.9  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1076  PepSY-associated TM helix domain protein  27.78 
 
 		 225 aa  42.7  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.765993  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>