38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_5003 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_5003  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  100 
 
 		 239 aa  470  1e-132  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.862813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4478  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  94.56 
 
 		 239 aa  426  1e-118  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3576  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  80.59 
 
 		 233 aa  369  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.548586 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0220  hypothetical protein  63.29 
 
 		 240 aa  291  6e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7103  PepSY-associated TM helix domain protein  62.87 
 
 		 240 aa  288  5.0000000000000004e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2345  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  62.21 
 
 		 248 aa  276  1e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.755435  normal  0.0903937 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6407  hypothetical protein  63.18 
 
 		 244 aa  261  8.999999999999999e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.281041 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3055  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  66.49 
 
 		 251 aa  256  3e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2969  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  64.48 
 
 		 244 aa  246  2e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.137689  normal  0.135359 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3103  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  64.48 
 
 		 231 aa  245  4.9999999999999997e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.775507  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0422  PepSY-associated TM helix family protein  62.77 
 
 		 248 aa  244  6.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0450107  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3287  hypothetical protein  62.77 
 
 		 248 aa  244  6.999999999999999e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2952  hypothetical protein  62.77 
 
 		 239 aa  243  9.999999999999999e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.442146  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2136  hypothetical protein  62.77 
 
 		 239 aa  243  9.999999999999999e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0228  hypothetical protein  62.77 
 
 		 239 aa  243  9.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.165958  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0240  hypothetical protein  62.77 
 
 		 239 aa  243  9.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3394  hypothetical protein  62.77 
 
 		 239 aa  243  9.999999999999999e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2444  PepSY-associated TM helix  62.84 
 
 		 231 aa  240  2e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3058  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  62.84 
 
 		 244 aa  240  2e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.543499  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3077  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  62.3 
 
 		 244 aa  238  5.999999999999999e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0206  PepSY-associated TM helix family protein  59.57 
 
 		 248 aa  236  2e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4358  hypothetical protein  59.22 
 
 		 246 aa  225  5.0000000000000005e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2998  PepSY-associated TM helix domain protein  38.96 
 
 		 254 aa  178  4.999999999999999e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3345  PepSY-associated TM helix domain protein  40.87 
 
 		 258 aa  173  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.649992 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2392  PepSY-associated TM helix  43.23 
 
 		 258 aa  163  2.0000000000000002e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.932712  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3067  hypothetical protein  40.97 
 
 		 247 aa  162  5.0000000000000005e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.438529  normal  0.387636 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0088  hypothetical protein  75.51 
 
 		 54 aa  72  0.000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5057  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  27.04 
 
 		 212 aa  51.2  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.176839 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12400  PepSY-associated TM helix  29.34 
 
 		 199 aa  51.2  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3730  hypothetical protein  28.34 
 
 		 209 aa  47.4  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.301466 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3029  hypothetical protein  21.63 
 
 		 218 aa  47.4  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.178112  hitchhiker  0.000157336 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5215  PepSY-associated TM helix  29.5 
 
 		 218 aa  47.8  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1639  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  24.68 
 
 		 216 aa  45.4  0.0008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2661  hypothetical protein  28.79 
 
 		 225 aa  44.7  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.522386  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1710  hypothetical protein  24.45 
 
 		 216 aa  44.7  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.860634  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1855  hypothetical protein  24.02 
 
 		 177 aa  45.1  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0378502  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3633  PepSY-associated TM helix  26.24 
 
 		 213 aa  43.1  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0430  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  29.38 
 
 		 211 aa  42  0.008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.181107  normal  0.797798 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>