38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3029 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_3029  hypothetical protein  100 
 
 		 218 aa  447  1e-125  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.178112  hitchhiker  0.000157336 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0118  membrane protein  33.81 
 
 		 214 aa  107  2e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1500  PepSY-associated TM helix domain protein  29.61 
 
 		 212 aa  102  5e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.171935  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000841  hypothetical protein  33.5 
 
 		 209 aa  101  8e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2808  hypothetical protein  35.75 
 
 		 201 aa  99  5e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.994405 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2152  PepSY-associated TM helix  33.33 
 
 		 191 aa  90.9  1e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.482162  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3297  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  34.42 
 
 		 226 aa  90.9  1e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0897886  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2850  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  34.47 
 
 		 212 aa  90.1  2e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000664158  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3255  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  34.42 
 
 		 226 aa  90.5  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00662139  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1112  PepSY-associated TM helix domain protein  35.16 
 
 		 198 aa  89  5e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00122652  hitchhiker  0.000000000766556 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3433  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  35.16 
 
 		 198 aa  89  5e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.527066  hitchhiker  0.000475318 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0040  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  31.1 
 
 		 208 aa  83.6  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06750  hypothetical protein  37.5 
 
 		 161 aa  82  0.000000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3730  hypothetical protein  28.57 
 
 		 209 aa  79.7  0.00000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.301466 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5057  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  26.83 
 
 		 212 aa  75.5  0.0000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.176839 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1014  hypothetical protein  31.07 
 
 		 177 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.235833  hitchhiker  0.00784249 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5640  hypothetical protein  26.85 
 
 		 223 aa  74.3  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0987  PepSY-associated TM helix domain protein  31.84 
 
 		 204 aa  74.3  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.162613 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1076  PepSY-associated TM helix domain protein  30.3 
 
 		 225 aa  73.2  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.765993  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1075  hypothetical protein  29.65 
 
 		 177 aa  72.8  0.000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0704726  normal  0.124163 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1010  hypothetical protein  29.65 
 
 		 177 aa  72.8  0.000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0372015  normal  0.0671955 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1188  hypothetical protein  29.65 
 
 		 177 aa  72.8  0.000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1639  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  31.58 
 
 		 216 aa  71.6  0.000000000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1710  hypothetical protein  31.58 
 
 		 216 aa  71.6  0.000000000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.860634  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1855  hypothetical protein  25.87 
 
 		 177 aa  69.3  0.00000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0378502  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5215  PepSY-associated TM helix  29 
 
 		 218 aa  68.2  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3988  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  29.26 
 
 		 228 aa  67.4  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.580617 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0424  PepSY-associated TM helix  26.11 
 
 		 207 aa  66.6  0.0000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.906941 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12400  PepSY-associated TM helix  31.33 
 
 		 199 aa  66.6  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3633  PepSY-associated TM helix  23.86 
 
 		 213 aa  66.2  0.0000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2813  PepSY-associated TM helix  25.38 
 
 		 221 aa  60.8  0.00000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0430  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  27.85 
 
 		 211 aa  55.1  0.0000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.181107  normal  0.797798 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2345  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  24.02 
 
 		 248 aa  51.6  0.000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.755435  normal  0.0903937 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0220  hypothetical protein  26.56 
 
 		 240 aa  50.1  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7103  PepSY-associated TM helix domain protein  25.38 
 
 		 240 aa  48.9  0.00007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5003  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  21.63 
 
 		 239 aa  47.4  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.862813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3576  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  24.38 
 
 		 233 aa  47.4  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.548586 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4478  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  22.45 
 
 		 239 aa  46.2  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>