52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_3297 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_3297  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  100 
 
 		 226 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0897886  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3255  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  99.56 
 
 		 226 aa  456  1e-127  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00662139  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1112  PepSY-associated TM helix domain protein  98.99 
 
 		 198 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00122652  hitchhiker  0.000000000766556 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3433  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  98.99 
 
 		 198 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.527066  hitchhiker  0.000475318 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2850  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  87.19 
 
 		 212 aa  342  2.9999999999999997e-93  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000664158  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1188  hypothetical protein  80.12 
 
 		 177 aa  285  4e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1075  hypothetical protein  79.52 
 
 		 177 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0704726  normal  0.124163 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1010  hypothetical protein  79.52 
 
 		 177 aa  283  1.0000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0372015  normal  0.0671955 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1014  hypothetical protein  79.52 
 
 		 177 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.235833  hitchhiker  0.00784249 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2808  hypothetical protein  53.06 
 
 		 201 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.994405 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2152  PepSY-associated TM helix  42.94 
 
 		 191 aa  148  8e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.482162  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000841  hypothetical protein  38.54 
 
 		 209 aa  136  3.0000000000000003e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0118  membrane protein  38.12 
 
 		 214 aa  133  1.9999999999999998e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3029  hypothetical protein  33.95 
 
 		 218 aa  104  1e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.178112  hitchhiker  0.000157336 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1500  PepSY-associated TM helix domain protein  34.04 
 
 		 212 aa  103  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.171935  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0040  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  34.9 
 
 		 208 aa  102  6e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06750  hypothetical protein  43.14 
 
 		 161 aa  94.7  1e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12400  PepSY-associated TM helix  36.26 
 
 		 199 aa  88.6  8e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5057  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  35.58 
 
 		 212 aa  87.8  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.176839 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1710  hypothetical protein  38.22 
 
 		 216 aa  87  2e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.860634  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1639  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  37.58 
 
 		 216 aa  85.5  6e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0987  PepSY-associated TM helix domain protein  36.08 
 
 		 204 aa  84  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.162613 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3730  hypothetical protein  35.15 
 
 		 209 aa  83.6  0.000000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.301466 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0424  PepSY-associated TM helix  34.59 
 
 		 207 aa  84  0.000000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.906941 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5640  hypothetical protein  34.3 
 
 		 223 aa  82.4  0.000000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5215  PepSY-associated TM helix  35.93 
 
 		 218 aa  80.5  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1855  hypothetical protein  32.37 
 
 		 177 aa  79.3  0.00000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0378502  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1076  PepSY-associated TM helix domain protein  35.98 
 
 		 225 aa  79  0.00000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.765993  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3633  PepSY-associated TM helix  36.36 
 
 		 213 aa  78.6  0.00000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2813  PepSY-associated TM helix  36.31 
 
 		 221 aa  67.8  0.0000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3988  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  30.17 
 
 		 228 aa  66.6  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.580617 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0430  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  29.22 
 
 		 211 aa  61.2  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.181107  normal  0.797798 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0206  PepSY-associated TM helix family protein  25.67 
 
 		 248 aa  52.4  0.000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3103  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  26.09 
 
 		 231 aa  52.4  0.000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.775507  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2444  PepSY-associated TM helix  26.09 
 
 		 231 aa  52  0.000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6407  hypothetical protein  26.37 
 
 		 244 aa  51.6  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.281041 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3058  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  26.09 
 
 		 244 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.543499  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2969  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  26.74 
 
 		 244 aa  50.1  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.137689  normal  0.135359 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3055  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  26.74 
 
 		 251 aa  49.3  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3077  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  25.54 
 
 		 244 aa  49.7  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4358  hypothetical protein  26.9 
 
 		 246 aa  48.9  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0220  hypothetical protein  27.27 
 
 		 240 aa  47.8  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7103  PepSY-associated TM helix domain protein  27.01 
 
 		 240 aa  48.1  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0422  PepSY-associated TM helix family protein  24.6 
 
 		 248 aa  46.2  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0450107  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3287  hypothetical protein  24.6 
 
 		 248 aa  46.2  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0228  hypothetical protein  24.6 
 
 		 239 aa  45.8  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.165958  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3394  hypothetical protein  24.6 
 
 		 239 aa  45.8  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0240  hypothetical protein  24.6 
 
 		 239 aa  45.8  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2136  hypothetical protein  24.6 
 
 		 239 aa  45.8  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2952  hypothetical protein  24.6 
 
 		 239 aa  45.8  0.0006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.442146  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5499  hypothetical protein  28.87 
 
 		 568 aa  42.4  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.102476 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2392  PepSY-associated TM helix  26.14 
 
 		 258 aa  42.4  0.006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.932712  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>