53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_1075 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_1075  hypothetical protein  100 
 
 		 177 aa  362  1e-99  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0704726  normal  0.124163 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1010  hypothetical protein  98.87 
 
 		 177 aa  361  2e-99  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0372015  normal  0.0671955 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1014  hypothetical protein  99.44 
 
 		 177 aa  361  3e-99  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.235833  hitchhiker  0.00784249 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1188  hypothetical protein  94.58 
 
 		 177 aa  328  4e-89  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2850  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  82.53 
 
 		 212 aa  293  9e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000664158  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3255  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  80.12 
 
 		 226 aa  287  4e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00662139  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3433  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  80.12 
 
 		 198 aa  287  7e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.527066  hitchhiker  0.000475318 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1112  PepSY-associated TM helix domain protein  80.12 
 
 		 198 aa  287  7e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00122652  hitchhiker  0.000000000766556 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3297  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  79.52 
 
 		 226 aa  284  4e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0897886  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2808  hypothetical protein  49.7 
 
 		 201 aa  184  8e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.994405 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0118  membrane protein  37.63 
 
 		 214 aa  125  2.0000000000000002e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2152  PepSY-associated TM helix  40.85 
 
 		 191 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.482162  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000841  hypothetical protein  37.63 
 
 		 209 aa  122  3e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06750  hypothetical protein  47.06 
 
 		 161 aa  98.6  4e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1500  PepSY-associated TM helix domain protein  32.02 
 
 		 212 aa  87  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.171935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5057  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  36.54 
 
 		 212 aa  86.3  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.176839 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3730  hypothetical protein  37.42 
 
 		 209 aa  86.7  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.301466 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0040  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  35.29 
 
 		 208 aa  85.9  3e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12400  PepSY-associated TM helix  40.13 
 
 		 199 aa  85.5  4e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3029  hypothetical protein  30.77 
 
 		 218 aa  82.4  0.000000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.178112  hitchhiker  0.000157336 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1710  hypothetical protein  35.58 
 
 		 216 aa  80.9  0.000000000000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.860634  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0987  PepSY-associated TM helix domain protein  33.54 
 
 		 204 aa  80.5  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.162613 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1639  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  35.98 
 
 		 216 aa  80.1  0.00000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5215  PepSY-associated TM helix  37.27 
 
 		 218 aa  79  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1076  PepSY-associated TM helix domain protein  37.58 
 
 		 225 aa  78.6  0.00000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.765993  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5640  hypothetical protein  34.97 
 
 		 223 aa  77.4  0.00000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3633  PepSY-associated TM helix  35.67 
 
 		 213 aa  76.6  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0424  PepSY-associated TM helix  31.33 
 
 		 207 aa  73.2  0.000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.906941 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3988  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  32.24 
 
 		 228 aa  67  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.580617 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2813  PepSY-associated TM helix  37.27 
 
 		 221 aa  66.6  0.0000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1855  hypothetical protein  26.71 
 
 		 177 aa  64.7  0.0000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0378502  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0430  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  32.12 
 
 		 211 aa  59.7  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.181107  normal  0.797798 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0206  PepSY-associated TM helix family protein  27.98 
 
 		 248 aa  53.9  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3287  hypothetical protein  26.35 
 
 		 248 aa  48.9  0.00004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0422  PepSY-associated TM helix family protein  26.35 
 
 		 248 aa  48.9  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0450107  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3394  hypothetical protein  26.35 
 
 		 239 aa  48.5  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0240  hypothetical protein  26.35 
 
 		 239 aa  48.5  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0228  hypothetical protein  26.35 
 
 		 239 aa  48.5  0.00005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.165958  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2136  hypothetical protein  26.35 
 
 		 239 aa  48.5  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2952  hypothetical protein  26.35 
 
 		 239 aa  48.5  0.00005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.442146  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2969  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  28.57 
 
 		 244 aa  47.8  0.00009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.137689  normal  0.135359 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6407  hypothetical protein  25.54 
 
 		 244 aa  46.2  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.281041 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3103  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  25.6 
 
 		 231 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.775507  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3055  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  28.14 
 
 		 251 aa  45.4  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2444  PepSY-associated TM helix  25.6 
 
 		 231 aa  45.1  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3058  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  25.6 
 
 		 244 aa  45.1  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.543499  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4358  hypothetical protein  26.25 
 
 		 246 aa  44.7  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7103  PepSY-associated TM helix domain protein  26.49 
 
 		 240 aa  43.5  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0220  hypothetical protein  26.06 
 
 		 240 aa  43.9  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5003  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  26.29 
 
 		 239 aa  43.5  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.862813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3077  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  25 
 
 		 244 aa  43.1  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06753  hypothetical protein  51.28 
 
 		 41 aa  42.7  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4478  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  26.8 
 
 		 239 aa  42.4  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>