36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_2808 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_2808  hypothetical protein  100 
 
 		 201 aa  409  1e-113  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.994405 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2850  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  55.5 
 
 		 212 aa  211  4.9999999999999996e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000664158  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1112  PepSY-associated TM helix domain protein  52.79 
 
 		 198 aa  199  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00122652  hitchhiker  0.000000000766556 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3433  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  52.79 
 
 		 198 aa  199  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.527066  hitchhiker  0.000475318 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3255  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  53.06 
 
 		 226 aa  199  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00662139  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3297  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  53.06 
 
 		 226 aa  197  9e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0897886  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1010  hypothetical protein  50.3 
 
 		 177 aa  184  8e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0372015  normal  0.0671955 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1188  hypothetical protein  50.3 
 
 		 177 aa  183  1.0000000000000001e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1075  hypothetical protein  49.7 
 
 		 177 aa  183  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0704726  normal  0.124163 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1014  hypothetical protein  49.7 
 
 		 177 aa  182  3e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.235833  hitchhiker  0.00784249 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2152  PepSY-associated TM helix  44.75 
 
 		 191 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.482162  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0118  membrane protein  40.39 
 
 		 214 aa  147  7e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000841  hypothetical protein  39.42 
 
 		 209 aa  141  5e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3029  hypothetical protein  35.27 
 
 		 218 aa  112  5e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.178112  hitchhiker  0.000157336 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06750  hypothetical protein  46.73 
 
 		 161 aa  101  6e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1500  PepSY-associated TM helix domain protein  33.53 
 
 		 212 aa  92.4  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.171935  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0040  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  34.5 
 
 		 208 aa  91.7  6e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5057  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  36.9 
 
 		 212 aa  82  0.000000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.176839 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1639  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  33.16 
 
 		 216 aa  78.2  0.00000000000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0987  PepSY-associated TM helix domain protein  35.16 
 
 		 204 aa  77.8  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.162613 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5215  PepSY-associated TM helix  35.37 
 
 		 218 aa  77  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1710  hypothetical protein  32.29 
 
 		 216 aa  76.6  0.0000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.860634  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3730  hypothetical protein  34.5 
 
 		 209 aa  73.6  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.301466 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1855  hypothetical protein  30.41 
 
 		 177 aa  72  0.000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0378502  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5640  hypothetical protein  33.14 
 
 		 223 aa  71.2  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1076  PepSY-associated TM helix domain protein  37.97 
 
 		 225 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.765993  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12400  PepSY-associated TM helix  33.53 
 
 		 199 aa  70.1  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0424  PepSY-associated TM helix  33.12 
 
 		 207 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.906941 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3633  PepSY-associated TM helix  30.94 
 
 		 213 aa  60.8  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3988  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  29.94 
 
 		 228 aa  59.7  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.580617 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0430  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  33.12 
 
 		 211 aa  57  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.181107  normal  0.797798 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2813  PepSY-associated TM helix  32.24 
 
 		 221 aa  55.1  0.0000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6407  hypothetical protein  25.77 
 
 		 244 aa  42.4  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.281041 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3058  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  25.29 
 
 		 244 aa  42.7  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.543499  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2444  PepSY-associated TM helix  25.29 
 
 		 231 aa  42.7  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3077  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  25.29 
 
 		 244 aa  42  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>