36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_0424 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007947  Mfla_0424  PepSY-associated TM helix  100 
 
 
207 aa  424  1e-118  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.906941 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5057  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  60.1 
 
 
212 aa  263  2e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.176839 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5640  hypothetical protein  57.67 
 
 
223 aa  262  2e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3633  PepSY-associated TM helix  53.92 
 
 
213 aa  248  7e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3730  hypothetical protein  57.43 
 
 
209 aa  246  2e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.301466 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1710  hypothetical protein  56.31 
 
 
216 aa  245  4e-64  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.860634  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1639  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  55.83 
 
 
216 aa  244  6e-64  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0987  PepSY-associated TM helix domain protein  60 
 
 
204 aa  238  4e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.162613 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2813  PepSY-associated TM helix  56.59 
 
 
221 aa  237  1e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0430  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  56.57 
 
 
211 aa  230  9e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.181107  normal  0.797798 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5215  PepSY-associated TM helix  58.85 
 
 
218 aa  229  3e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1076  PepSY-associated TM helix domain protein  57.87 
 
 
225 aa  215  5e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.765993  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12400  PepSY-associated TM helix  55.87 
 
 
199 aa  211  7.999999999999999e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3988  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  51.44 
 
 
228 aa  202  2e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.580617 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1500  PepSY-associated TM helix domain protein  31.5 
 
 
212 aa  90.9  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.171935  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000841  hypothetical protein  34.13 
 
 
209 aa  86.3  3e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0118  membrane protein  29.24 
 
 
214 aa  75.9  0.0000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3297  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  33.57 
 
 
226 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0897886  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1112  PepSY-associated TM helix domain protein  33.57 
 
 
198 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00122652  hitchhiker  0.000000000766556 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3433  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  33.57 
 
 
198 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.527066  hitchhiker  0.000475318 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3255  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  33.57 
 
 
226 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00662139  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0040  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  30.32 
 
 
208 aa  71.2  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06750  hypothetical protein  43.06 
 
 
161 aa  70.9  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2152  PepSY-associated TM helix  31.1 
 
 
191 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.482162  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1188  hypothetical protein  31.91 
 
 
177 aa  69.3  0.00000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2850  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  31.69 
 
 
212 aa  67  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000664158  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3029  hypothetical protein  26.11 
 
 
218 aa  66.6  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.178112  hitchhiker  0.000157336 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1010  hypothetical protein  30.28 
 
 
177 aa  65.5  0.0000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0372015  normal  0.0671955 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1075  hypothetical protein  29.58 
 
 
177 aa  65.1  0.0000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0704726  normal  0.124163 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1014  hypothetical protein  29.58 
 
 
177 aa  63.9  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.235833  hitchhiker  0.00784249 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2808  hypothetical protein  37.5 
 
 
201 aa  61.2  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.994405 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1855  hypothetical protein  27.12 
 
 
177 aa  57.8  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0378502  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3126  hypothetical protein  24.27 
 
 
186 aa  43.9  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0206  PepSY-associated TM helix family protein  24.58 
 
 
248 aa  43.5  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3345  PepSY-associated TM helix domain protein  25.53 
 
 
258 aa  42  0.007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.649992 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1568  hypothetical protein  25.49 
 
 
187 aa  41.6  0.008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>