58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5640 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_5640  hypothetical protein  100 
 
 		 223 aa  457  9.999999999999999e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5215  PepSY-associated TM helix  76.23 
 
 		 218 aa  324  5e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5057  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  63.18 
 
 		 212 aa  287  8e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.176839 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0424  PepSY-associated TM helix  57.67 
 
 		 207 aa  262  3e-69  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.906941 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3730  hypothetical protein  56.94 
 
 		 209 aa  255  4e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.301466 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1710  hypothetical protein  55.86 
 
 		 216 aa  247  1e-64  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.860634  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1639  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  54.19 
 
 		 216 aa  244  9e-64  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0987  PepSY-associated TM helix domain protein  57.64 
 
 		 204 aa  240  1e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.162613 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3633  PepSY-associated TM helix  54.21 
 
 		 213 aa  239  2e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12400  PepSY-associated TM helix  61.14 
 
 		 199 aa  238  6.999999999999999e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1076  PepSY-associated TM helix domain protein  60.29 
 
 		 225 aa  233  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.765993  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2813  PepSY-associated TM helix  54.42 
 
 		 221 aa  229  3e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3988  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  57.14 
 
 		 228 aa  224  9e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.580617 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0430  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  52.58 
 
 		 211 aa  211  7.999999999999999e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.181107  normal  0.797798 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000841  hypothetical protein  30.94 
 
 		 209 aa  84  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1500  PepSY-associated TM helix domain protein  30.88 
 
 		 212 aa  78.6  0.00000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.171935  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0118  membrane protein  27.84 
 
 		 214 aa  77.4  0.0000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3029  hypothetical protein  26.85 
 
 		 218 aa  74.3  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.178112  hitchhiker  0.000157336 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2152  PepSY-associated TM helix  29.24 
 
 		 191 aa  72.8  0.000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.482162  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3297  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  33.12 
 
 		 226 aa  72.4  0.000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0897886  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06750  hypothetical protein  39.08 
 
 		 161 aa  70.9  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1112  PepSY-associated TM helix domain protein  32.48 
 
 		 198 aa  69.3  0.00000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00122652  hitchhiker  0.000000000766556 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3255  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  32.48 
 
 		 226 aa  69.3  0.00000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00662139  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1014  hypothetical protein  33.55 
 
 		 177 aa  69.3  0.00000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.235833  hitchhiker  0.00784249 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3433  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  32.48 
 
 		 198 aa  69.3  0.00000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.527066  hitchhiker  0.000475318 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1188  hypothetical protein  32.26 
 
 		 177 aa  68.9  0.00000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1075  hypothetical protein  33.55 
 
 		 177 aa  68.9  0.00000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0704726  normal  0.124163 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1010  hypothetical protein  32.9 
 
 		 177 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0372015  normal  0.0671955 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1855  hypothetical protein  27.72 
 
 		 177 aa  67.4  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0378502  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2850  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  32.91 
 
 		 212 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000664158  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0040  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  29.03 
 
 		 208 aa  62.4  0.000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2808  hypothetical protein  41.25 
 
 		 201 aa  61.6  0.000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.994405 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3126  hypothetical protein  27.19 
 
 		 186 aa  57  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2345  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  24.63 
 
 		 248 aa  47.8  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.755435  normal  0.0903937 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3287  hypothetical protein  26.26 
 
 		 248 aa  47.8  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0422  PepSY-associated TM helix family protein  26.26 
 
 		 248 aa  47.8  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0450107  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0206  PepSY-associated TM helix family protein  25.7 
 
 		 248 aa  48.1  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4358  hypothetical protein  25.13 
 
 		 246 aa  47.8  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3394  hypothetical protein  26.26 
 
 		 239 aa  48.1  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0240  hypothetical protein  26.26 
 
 		 239 aa  48.1  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0228  hypothetical protein  26.26 
 
 		 239 aa  48.1  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.165958  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2136  hypothetical protein  26.26 
 
 		 239 aa  48.1  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2952  hypothetical protein  26.26 
 
 		 239 aa  48.1  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.442146  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3576  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  27.8 
 
 		 233 aa  48.1  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.548586 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3077  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  23.56 
 
 		 244 aa  46.6  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3055  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  23.56 
 
 		 251 aa  46.6  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0567  hypothetical protein  41.76 
 
 		 182 aa  45.8  0.0005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.11377 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6407  hypothetical protein  23.04 
 
 		 244 aa  45.8  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.281041 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1568  hypothetical protein  35.23 
 
 		 187 aa  44.3  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2444  PepSY-associated TM helix  23.04 
 
 		 231 aa  45.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2969  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  22.51 
 
 		 244 aa  44.7  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.137689  normal  0.135359 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3058  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  23.04 
 
 		 244 aa  45.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.543499  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3345  PepSY-associated TM helix domain protein  24.03 
 
 		 258 aa  43.5  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.649992 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0220  hypothetical protein  26 
 
 		 240 aa  43.1  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2998  PepSY-associated TM helix domain protein  24.03 
 
 		 254 aa  43.1  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3103  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  21.99 
 
 		 231 aa  43.1  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.775507  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7103  PepSY-associated TM helix domain protein  23.5 
 
 		 240 aa  42.4  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2392  PepSY-associated TM helix  22.07 
 
 		 258 aa  42  0.008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.932712  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>