35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0040 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_0040  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  100 
 
 		 208 aa  416  9.999999999999999e-116  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1500  PepSY-associated TM helix domain protein  43.62 
 
 		 212 aa  168  5e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.171935  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000841  hypothetical protein  35.64 
 
 		 209 aa  100  1e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0118  membrane protein  31.19 
 
 		 214 aa  97.1  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2152  PepSY-associated TM helix  30.94 
 
 		 191 aa  87  2e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.482162  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3029  hypothetical protein  30.22 
 
 		 218 aa  85.5  5e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.178112  hitchhiker  0.000157336 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3297  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  34.9 
 
 		 226 aa  85.5  5e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0897886  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3255  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  34.9 
 
 		 226 aa  85.1  7e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00662139  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1112  PepSY-associated TM helix domain protein  36.31 
 
 		 198 aa  81.6  0.000000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00122652  hitchhiker  0.000000000766556 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3433  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  36.31 
 
 		 198 aa  81.6  0.000000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.527066  hitchhiker  0.000475318 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3633  PepSY-associated TM helix  33.67 
 
 		 213 aa  80.1  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2850  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  37.95 
 
 		 212 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000664158  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2808  hypothetical protein  34.5 
 
 		 201 aa  75.9  0.0000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.994405 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0424  PepSY-associated TM helix  30.33 
 
 		 207 aa  74.7  0.0000000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.906941 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1014  hypothetical protein  28.74 
 
 		 177 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.235833  hitchhiker  0.00784249 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1639  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  33.16 
 
 		 216 aa  74.3  0.000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0987  PepSY-associated TM helix domain protein  32.12 
 
 		 204 aa  73.9  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.162613 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1710  hypothetical protein  33.16 
 
 		 216 aa  73.9  0.000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.860634  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1075  hypothetical protein  28.74 
 
 		 177 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0704726  normal  0.124163 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1010  hypothetical protein  33.56 
 
 		 177 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0372015  normal  0.0671955 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1076  PepSY-associated TM helix domain protein  33.73 
 
 		 225 aa  72  0.000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.765993  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06750  hypothetical protein  34.86 
 
 		 161 aa  71.6  0.000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1188  hypothetical protein  30.77 
 
 		 177 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3730  hypothetical protein  30.19 
 
 		 209 aa  69.7  0.00000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.301466 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5057  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  30.58 
 
 		 212 aa  68.6  0.00000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.176839 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0430  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  32.97 
 
 		 211 aa  68.2  0.00000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.181107  normal  0.797798 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5640  hypothetical protein  29.11 
 
 		 223 aa  65.1  0.0000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2813  PepSY-associated TM helix  32.66 
 
 		 221 aa  62.8  0.000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3988  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  29.41 
 
 		 228 aa  60.8  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.580617 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12400  PepSY-associated TM helix  29.88 
 
 		 199 aa  59.3  0.00000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5215  PepSY-associated TM helix  30.39 
 
 		 218 aa  56.2  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1855  hypothetical protein  26.06 
 
 		 177 aa  55.5  0.0000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0378502  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0220  hypothetical protein  28.93 
 
 		 240 aa  47.8  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7103  PepSY-associated TM helix domain protein  28.43 
 
 		 240 aa  47  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2345  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  23.59 
 
 		 248 aa  42  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.755435  normal  0.0903937 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>