32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_06750 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_06750  hypothetical protein  100 
 
 		 161 aa  332  1e-90  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000841  hypothetical protein  80.79 
 
 		 209 aa  265  2.9999999999999995e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0118  membrane protein  70.71 
 
 		 214 aa  219  9.999999999999999e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2808  hypothetical protein  46.73 
 
 		 201 aa  102  3e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.994405 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1188  hypothetical protein  48.04 
 
 		 177 aa  99.4  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1010  hypothetical protein  48.04 
 
 		 177 aa  99  3e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0372015  normal  0.0671955 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1075  hypothetical protein  47.06 
 
 		 177 aa  98.6  3e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0704726  normal  0.124163 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1014  hypothetical protein  47.06 
 
 		 177 aa  98.6  3e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.235833  hitchhiker  0.00784249 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2850  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  46.08 
 
 		 212 aa  98.2  5e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000664158  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3255  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  43.14 
 
 		 226 aa  94.7  4e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00662139  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3297  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  43.14 
 
 		 226 aa  94.7  5e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0897886  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3433  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  43.14 
 
 		 198 aa  94.4  6e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.527066  hitchhiker  0.000475318 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1112  PepSY-associated TM helix domain protein  43.14 
 
 		 198 aa  94.4  6e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00122652  hitchhiker  0.000000000766556 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2152  PepSY-associated TM helix  36.43 
 
 		 191 aa  94  8e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.482162  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1710  hypothetical protein  37.7 
 
 		 216 aa  89  2e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.860634  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1639  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  37.7 
 
 		 216 aa  88.2  4e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12400  PepSY-associated TM helix  39.69 
 
 		 199 aa  82.4  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3988  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  43.82 
 
 		 228 aa  82.4  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.580617 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3029  hypothetical protein  37.5 
 
 		 218 aa  82  0.000000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.178112  hitchhiker  0.000157336 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1500  PepSY-associated TM helix domain protein  37.27 
 
 		 212 aa  79.3  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.171935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5057  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  45.78 
 
 		 212 aa  77  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.176839 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0987  PepSY-associated TM helix domain protein  40.45 
 
 		 204 aa  74.3  0.0000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.162613 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3730  hypothetical protein  42.5 
 
 		 209 aa  72.4  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.301466 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0040  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  34.86 
 
 		 208 aa  72  0.000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5215  PepSY-associated TM helix  36.7 
 
 		 218 aa  71.2  0.000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5640  hypothetical protein  39.08 
 
 		 223 aa  70.9  0.000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0424  PepSY-associated TM helix  43.06 
 
 		 207 aa  70.9  0.000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.906941 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3633  PepSY-associated TM helix  31.82 
 
 		 213 aa  65.9  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0430  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  35.71 
 
 		 211 aa  60.8  0.000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.181107  normal  0.797798 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1076  PepSY-associated TM helix domain protein  37.93 
 
 		 225 aa  60.8  0.000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.765993  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2813  PepSY-associated TM helix  36.25 
 
 		 221 aa  55.5  0.0000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1855  hypothetical protein  29.9 
 
 		 177 aa  53.9  0.0000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0378502  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>