48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_2152 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_2152  PepSY-associated TM helix  100 
 
 		 191 aa  389  1e-107  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.482162  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0118  membrane protein  41.94 
 
 		 214 aa  139  1.9999999999999998e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2808  hypothetical protein  44.75 
 
 		 201 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.994405 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000841  hypothetical protein  38.04 
 
 		 209 aa  130  1.0000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3297  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  42.94 
 
 		 226 aa  129  3e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0897886  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1112  PepSY-associated TM helix domain protein  43.26 
 
 		 198 aa  128  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00122652  hitchhiker  0.000000000766556 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3433  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  43.26 
 
 		 198 aa  128  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.527066  hitchhiker  0.000475318 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2850  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  43.48 
 
 		 212 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000664158  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3255  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  43.26 
 
 		 226 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00662139  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1010  hypothetical protein  37.95 
 
 		 177 aa  111  5e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0372015  normal  0.0671955 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1188  hypothetical protein  38.01 
 
 		 177 aa  111  7.000000000000001e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1014  hypothetical protein  37.35 
 
 		 177 aa  111  8.000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.235833  hitchhiker  0.00784249 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1075  hypothetical protein  37.35 
 
 		 177 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0704726  normal  0.124163 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06750  hypothetical protein  35.71 
 
 		 161 aa  94.7  8e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3029  hypothetical protein  32.35 
 
 		 218 aa  90.9  1e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.178112  hitchhiker  0.000157336 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1500  PepSY-associated TM helix domain protein  29.32 
 
 		 212 aa  90.1  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.171935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3730  hypothetical protein  36.97 
 
 		 209 aa  89.7  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.301466 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0040  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  30.85 
 
 		 208 aa  87  1e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12400  PepSY-associated TM helix  34.97 
 
 		 199 aa  87  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5057  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  33.51 
 
 		 212 aa  86.7  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.176839 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1710  hypothetical protein  32.98 
 
 		 216 aa  82  0.000000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.860634  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1639  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  32.98 
 
 		 216 aa  81.6  0.000000000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1855  hypothetical protein  29.94 
 
 		 177 aa  79.3  0.00000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0378502  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0987  PepSY-associated TM helix domain protein  34.68 
 
 		 204 aa  75.9  0.0000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.162613 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3633  PepSY-associated TM helix  31.35 
 
 		 213 aa  75.5  0.0000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5640  hypothetical protein  28.86 
 
 		 223 aa  73.2  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0424  PepSY-associated TM helix  31.09 
 
 		 207 aa  72.8  0.000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.906941 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3988  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  32.57 
 
 		 228 aa  72.4  0.000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.580617 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5215  PepSY-associated TM helix  28.31 
 
 		 218 aa  71.2  0.000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1076  PepSY-associated TM helix domain protein  31.71 
 
 		 225 aa  68.6  0.00000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.765993  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0430  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  32.68 
 
 		 211 aa  66.6  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.181107  normal  0.797798 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2813  PepSY-associated TM helix  30.72 
 
 		 221 aa  57  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2952  hypothetical protein  26.63 
 
 		 239 aa  47.4  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.442146  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3287  hypothetical protein  27.12 
 
 		 248 aa  47.4  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0228  hypothetical protein  27.12 
 
 		 239 aa  47.4  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.165958  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2136  hypothetical protein  26.63 
 
 		 239 aa  47.4  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0206  PepSY-associated TM helix family protein  22.6 
 
 		 248 aa  47.4  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0422  PepSY-associated TM helix family protein  27.12 
 
 		 248 aa  47.4  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0450107  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3394  hypothetical protein  26.63 
 
 		 239 aa  47.4  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0240  hypothetical protein  26.63 
 
 		 239 aa  47.4  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6407  hypothetical protein  22.83 
 
 		 244 aa  43.9  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.281041 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3055  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  22.73 
 
 		 251 aa  43.1  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1568  hypothetical protein  28.3 
 
 		 187 aa  43.5  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2969  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  22.6 
 
 		 244 aa  42.4  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.137689  normal  0.135359 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2949  hypothetical protein  23.21 
 
 		 337 aa  42  0.005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2444  PepSY-associated TM helix  22.6 
 
 		 231 aa  42  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3058  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  22.6 
 
 		 244 aa  41.6  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.543499  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3103  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  22.03 
 
 		 231 aa  41.2  0.009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.775507  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>