49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A6407 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A6407  hypothetical protein  100 
 
 		 244 aa  489  1e-137  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.281041 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3058  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  93.85 
 
 		 244 aa  414  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.543499  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3077  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  93.03 
 
 		 244 aa  412  1e-114  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2969  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  92.89 
 
 		 244 aa  403  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.137689  normal  0.135359 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3055  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  88.26 
 
 		 251 aa  394  1e-109  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2444  PepSY-associated TM helix  95.2 
 
 		 231 aa  391  1e-108  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3103  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  94.74 
 
 		 231 aa  380  1e-105  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.775507  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0206  PepSY-associated TM helix family protein  73.48 
 
 		 248 aa  334  7e-91  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3287  hypothetical protein  73.91 
 
 		 248 aa  332  3e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0422  PepSY-associated TM helix family protein  73.91 
 
 		 248 aa  332  3e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0450107  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0228  hypothetical protein  75.32 
 
 		 239 aa  331  6e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.165958  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2136  hypothetical protein  74.89 
 
 		 239 aa  330  2e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2952  hypothetical protein  74.89 
 
 		 239 aa  330  2e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.442146  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0240  hypothetical protein  74.89 
 
 		 239 aa  330  2e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3394  hypothetical protein  74.89 
 
 		 239 aa  330  2e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7103  PepSY-associated TM helix domain protein  65.02 
 
 		 240 aa  326  2.0000000000000001e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0220  hypothetical protein  64.2 
 
 		 240 aa  322  3e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2345  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  59.76 
 
 		 248 aa  298  5e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.755435  normal  0.0903937 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4358  hypothetical protein  67.35 
 
 		 246 aa  286  2e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5003  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  63.59 
 
 		 239 aa  270  2e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.862813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3576  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  59.09 
 
 		 233 aa  268  5e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.548586 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4478  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  62.25 
 
 		 239 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2998  PepSY-associated TM helix domain protein  47.79 
 
 		 254 aa  196  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3345  PepSY-associated TM helix domain protein  47.73 
 
 		 258 aa  194  9e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.649992 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3067  hypothetical protein  44.68 
 
 		 247 aa  181  1e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.438529  normal  0.387636 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2392  PepSY-associated TM helix  39.32 
 
 		 258 aa  161  9e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.932712  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0088  hypothetical protein  77.36 
 
 		 54 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3633  PepSY-associated TM helix  29.15 
 
 		 213 aa  57  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5215  PepSY-associated TM helix  29.02 
 
 		 218 aa  57.4  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2661  hypothetical protein  29.65 
 
 		 225 aa  55.5  0.0000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.522386  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3730  hypothetical protein  26.52 
 
 		 209 aa  53.1  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.301466 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12400  PepSY-associated TM helix  26.99 
 
 		 199 aa  53.5  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1855  hypothetical protein  25.25 
 
 		 177 aa  50.1  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0378502  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1500  PepSY-associated TM helix domain protein  25.12 
 
 		 212 aa  49.3  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.171935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0430  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  27.84 
 
 		 211 aa  47.4  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.181107  normal  0.797798 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5057  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  24.47 
 
 		 212 aa  46.2  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.176839 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5640  hypothetical protein  23.62 
 
 		 223 aa  46.6  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000841  hypothetical protein  25.14 
 
 		 209 aa  46.2  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1710  hypothetical protein  26.04 
 
 		 216 aa  45.8  0.0007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.860634  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1639  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  26.04 
 
 		 216 aa  45.8  0.0007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3297  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  25.82 
 
 		 226 aa  43.5  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0897886  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0987  PepSY-associated TM helix domain protein  26.37 
 
 		 204 aa  43.5  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.162613 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0118  membrane protein  21.88 
 
 		 214 aa  43.1  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1076  PepSY-associated TM helix domain protein  26.2 
 
 		 225 aa  43.5  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.765993  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3433  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  26.13 
 
 		 198 aa  43.1  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.527066  hitchhiker  0.000475318 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3255  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  25.82 
 
 		 226 aa  43.1  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00662139  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1112  PepSY-associated TM helix domain protein  26.13 
 
 		 198 aa  43.1  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00122652  hitchhiker  0.000000000766556 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2152  PepSY-associated TM helix  23.16 
 
 		 191 aa  43.1  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.482162  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3029  hypothetical protein  24.14 
 
 		 218 aa  42  0.01  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.178112  hitchhiker  0.000157336 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>