42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_3576 on replicon NC_010086
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010086  Bmul_3576  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  100 
 
 
233 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.548586 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5003  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  80.59 
 
 
239 aa  369  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.862813  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4478  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  76.67 
 
 
239 aa  352  2e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0220  hypothetical protein  71.43 
 
 
240 aa  298  7e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7103  PepSY-associated TM helix domain protein  69.95 
 
 
240 aa  293  2e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2345  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  60.62 
 
 
248 aa  281  7.000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.755435  normal  0.0903937 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6407  hypothetical protein  61.11 
 
 
244 aa  259  3e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.281041 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3055  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  65.43 
 
 
251 aa  254  6e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2969  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  63.39 
 
 
244 aa  247  1e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.137689  normal  0.135359 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3103  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  62.84 
 
 
231 aa  245  4e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.775507  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0422  PepSY-associated TM helix family protein  61.7 
 
 
248 aa  244  8e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0450107  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3287  hypothetical protein  61.7 
 
 
248 aa  244  8e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0228  hypothetical protein  61.7 
 
 
239 aa  243  9.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.165958  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3394  hypothetical protein  61.7 
 
 
239 aa  243  9.999999999999999e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2136  hypothetical protein  61.7 
 
 
239 aa  243  9.999999999999999e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0240  hypothetical protein  61.7 
 
 
239 aa  243  9.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2952  hypothetical protein  61.7 
 
 
239 aa  243  9.999999999999999e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.442146  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3058  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  61.2 
 
 
244 aa  239  2e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.543499  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2444  PepSY-associated TM helix  61.2 
 
 
231 aa  239  2e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3077  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  61.2 
 
 
244 aa  239  4e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0206  PepSY-associated TM helix family protein  59.57 
 
 
248 aa  239  4e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4358  hypothetical protein  55.78 
 
 
246 aa  225  5.0000000000000005e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2998  PepSY-associated TM helix domain protein  41.3 
 
 
254 aa  175  6e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3345  PepSY-associated TM helix domain protein  41.3 
 
 
258 aa  171  9e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.649992 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3067  hypothetical protein  39.59 
 
 
247 aa  159  4e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.438529  normal  0.387636 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2392  PepSY-associated TM helix  41.46 
 
 
258 aa  157  1e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.932712  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0088  hypothetical protein  73.47 
 
 
54 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5215  PepSY-associated TM helix  26.77 
 
 
218 aa  52  0.000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3730  hypothetical protein  31.67 
 
 
209 aa  51.6  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.301466 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12400  PepSY-associated TM helix  26.95 
 
 
199 aa  51.2  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5057  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  25.62 
 
 
212 aa  48.9  0.00006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.176839 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1639  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  26.13 
 
 
216 aa  48.5  0.00008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5640  hypothetical protein  27.8 
 
 
223 aa  48.1  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3029  hypothetical protein  24.38 
 
 
218 aa  47.4  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.178112  hitchhiker  0.000157336 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0430  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  30.51 
 
 
211 aa  46.6  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.181107  normal  0.797798 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1710  hypothetical protein  25.11 
 
 
216 aa  45.8  0.0005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.860634  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1855  hypothetical protein  21.16 
 
 
177 aa  45.1  0.0009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0378502  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0987  PepSY-associated TM helix domain protein  25.91 
 
 
204 aa  45.1  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.162613 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3633  PepSY-associated TM helix  27.78 
 
 
213 aa  43.9  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0118  membrane protein  24.86 
 
 
214 aa  43.1  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1076  PepSY-associated TM helix domain protein  29.53 
 
 
225 aa  42.7  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.765993  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3988  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  26.53 
 
 
228 aa  42  0.008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.580617 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>