11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1568 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1568  hypothetical protein  100 
 
 		 187 aa  388  1e-107  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0567  hypothetical protein  67.6 
 
 		 182 aa  270  1e-71  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.11377 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3126  hypothetical protein  31.91 
 
 		 186 aa  107  1e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5739  hypothetical protein  34.66 
 
 		 186 aa  99.4  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5385  hypothetical protein  30.99 
 
 		 200 aa  87  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0883057  normal  0.237779 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0987  PepSY-associated TM helix domain protein  25 
 
 		 204 aa  46.6  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.162613 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5640  hypothetical protein  35.23 
 
 		 223 aa  44.3  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2152  PepSY-associated TM helix  28.3 
 
 		 191 aa  43.5  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.482162  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3730  hypothetical protein  24.52 
 
 		 209 aa  42.4  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.301466 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0424  PepSY-associated TM helix  25.49 
 
 		 207 aa  41.6  0.006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.906941 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5057  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  34.33 
 
 		 212 aa  41.2  0.008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.176839 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>