191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1981 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_1981  Ketopantoate reductase ApbA/PanE domain protein  100 
 
 
290 aa  556  1e-157  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0271338  hitchhiker  0.000000668288 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3712  Ketopantoate reductase ApbA/PanE domain protein  59.79 
 
 
286 aa  300  2e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.439375  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2775  alpha/beta hydrolase fold protein  35.53 
 
 
621 aa  128  1.0000000000000001e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16020  ketopantoate reductase  31.7 
 
 
299 aa  111  1.0000000000000001e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.431175  hitchhiker  0.000000288636 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0353  GDSL family lipase/acylhydrolase  27.86 
 
 
531 aa  101  2e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2695  2-dehydropantoate 2-reductase  39.36 
 
 
315 aa  92.8  6e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.120286  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6131  2-dehydropantoate 2-reductase  36.7 
 
 
341 aa  91.7  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2998  2-dehydropantoate 2-reductase, putative  38.83 
 
 
315 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0207469 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5528  2-dehydropantoate 2-reductase  37.23 
 
 
316 aa  90.5  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5892  2-dehydropantoate 2-reductase  37.23 
 
 
316 aa  90.5  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.700658  normal  0.998449 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6243  2-dehydropantoate 2-reductase  38.17 
 
 
316 aa  89.4  7e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6528  2-dehydropantoate 2-reductase  37.63 
 
 
316 aa  86.3  6e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5508  2-dehydropantoate 2-reductase  34.95 
 
 
323 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.723336  normal  0.36356 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6401  2-dehydropantoate 2-reductase  35.64 
 
 
316 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.246941 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4507  2-dehydropantoate 2-reductase  36.46 
 
 
335 aa  79.3  0.00000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.28047  normal  0.622175 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6020  2-dehydropantoate 2-reductase  33.33 
 
 
316 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.217101  normal  0.377898 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2270  2-dehydropantoate 2-reductase  33.33 
 
 
326 aa  74.7  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.191181  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2525  2-dehydropantoate 2-reductase  31.46 
 
 
326 aa  72.4  0.000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4615  2-dehydropantoate 2-reductase  30.67 
 
 
312 aa  70.5  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0698  2-dehydropantoate 2-reductase  29.11 
 
 
332 aa  68.6  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0555265  hitchhiker  0.000214293 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1551  2-dehydropantoate 2-reductase  32.63 
 
 
312 aa  67.8  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.257766  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3612  2-dehydropantoate 2-reductase  28.57 
 
 
342 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0270  2-dehydropantoate 2-reductase  35.11 
 
 
318 aa  67.8  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.267073 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6024  2-dehydropantoate 2-reductase  28.4 
 
 
325 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.578091  normal  0.113365 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2259  2-dehydropantoate 2-reductase  27.98 
 
 
325 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1850  2-dehydropantoate 2-reductase  27.06 
 
 
353 aa  66.2  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.9641 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1558  2-dehydropantoate 2-reductase  30.1 
 
 
447 aa  65.1  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1605  2-dehydropantoate 2-reductase  33.8 
 
 
326 aa  65.1  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.799177  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2669  2-dehydropantoate 2-reductase  30.69 
 
 
310 aa  65.1  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0588922  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1681  2-dehydropantoate 2-reductase  33.8 
 
 
326 aa  65.1  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.53848  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0211  2-dehydropantoate 2-reductase  29.86 
 
 
324 aa  64.7  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.817769  normal  0.569864 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4927  2-dehydropantoate 2-reductase  27.82 
 
 
306 aa  64.3  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0332007  normal  0.934837 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4344  2-dehydropantoate 2-reductase  29.58 
 
 
332 aa  64.3  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.244617  decreased coverage  0.000830744 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3781  2-dehydropantoate 2-reductase  28.57 
 
 
312 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0449567 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2873  Ketopantoate reductase ApbA/PanE domain protein  26.64 
 
 
296 aa  63.5  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.393919  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2023  2-dehydropantoate 2-reductase  25.51 
 
 
324 aa  63.2  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.607439  normal  0.396245 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1216  2-dehydropantoate 2-reductase  28.81 
 
 
325 aa  62.8  0.000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.192364  normal  0.954067 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0902  2-dehydropantoate 2-reductase  32.97 
 
 
294 aa  63.2  0.000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4356  2-dehydropantoate 2-reductase  28.22 
 
 
335 aa  62.4  0.000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.484695 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2816  2-dehydropantoate 2-reductase  25.77 
 
 
305 aa  61.6  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3892  2-dehydropantoate 2-reductase  38.68 
 
 
310 aa  62  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2605  2-dehydropantoate 2-reductase  30.14 
 
 
314 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2153  2-dehydropantoate 2-reductase  27.02 
 
 
326 aa  61.2  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.998843  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6687  2-dehydropantoate 2-reductase  31.77 
 
 
312 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2839  2-dehydropantoate 2-reductase  25.77 
 
 
305 aa  61.2  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.748115 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2776  2-dehydropantoate 2-reductase  25.77 
 
 
305 aa  61.2  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5912  2-dehydropantoate 2-reductase  29.68 
 
 
314 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.579455  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1861  2-dehydropantoate 2-reductase  33.67 
 
 
317 aa  60.8  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2735  2-dehydropantoate 2-reductase  25.77 
 
 
305 aa  60.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0050  2-dehydropantoate 2-reductase  38.3 
 
 
335 aa  60.8  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1859  2-dehydropantoate 2-reductase  27.89 
 
 
311 aa  60.1  0.00000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.540128  normal  0.594276 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2951  2-dehydropantoate 2-reductase  25.77 
 
 
305 aa  60.1  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0743  ketopantoate reductase ApbA/PanE  29.57 
 
 
311 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.786977  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5446  2-dehydropantoate 2-reductase  28.91 
 
 
327 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.686649  normal  0.0261809 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6159  2-dehydropantoate 2-reductase  28.3 
 
 
314 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.33113  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4552  2-dehydropantoate 2-reductase  29.95 
 
 
307 aa  59.3  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0234  2-dehydropantoate 2-reductase  30.92 
 
 
325 aa  58.9  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0107  2-dehydropantoate 2-reductase  29.25 
 
 
333 aa  58.2  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0016  2-dehydropantoate 2-reductase  30.6 
 
 
307 aa  58.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45590  hypothetical protein  29.47 
 
 
359 aa  58.5  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0313  2-dehydropantoate 2-reductase  30.21 
 
 
307 aa  58.5  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.82281 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1224  2-dehydropantoate 2-reductase  42.31 
 
 
327 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.318793 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4479  2-dehydropantoate 2-reductase  28.37 
 
 
337 aa  58.2  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0021  2-dehydropantoate 2-reductase  33.14 
 
 
306 aa  57.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5382  2-dehydropantoate 2-reductase  43.59 
 
 
327 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.324063  normal  0.227406 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0018  2-dehydropantoate 2-reductase  32.29 
 
 
306 aa  57.4  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3431  2-dehydropantoate 2-reductase  25.31 
 
 
324 aa  57.4  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.990914  normal  0.0502044 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3896  ketopantoate reductase ApbA/PanE  28.57 
 
 
337 aa  57  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4116  2-dehydropantoate 2-reductase  34.64 
 
 
308 aa  57.4  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.605632 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4671  2-dehydropantoate 2-reductase  25.98 
 
 
325 aa  56.6  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1567  2-dehydropantoate 2-reductase  24.39 
 
 
318 aa  56.6  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.62221  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4498  2-dehydropantoate 2-reductase  30.77 
 
 
312 aa  57  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.646734  normal  0.399113 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2793  2-dehydropantoate 2-reductase  31 
 
 
336 aa  56.2  0.0000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0474339 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0193  2-dehydropantoate 2-reductase  28.09 
 
 
285 aa  56.2  0.0000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0380974  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2500  2-dehydropantoate 2-reductase  28.76 
 
 
314 aa  55.5  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.637616 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4423  2-dehydropantoate 2-reductase  30.32 
 
 
311 aa  55.5  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.852681 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0729  2-dehydropantoate 2-reductase  31.25 
 
 
306 aa  55.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.691763  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0480  2-dehydropantoate 2-reductase  25.82 
 
 
346 aa  55.5  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1713  2-dehydropantoate 2-reductase  34.48 
 
 
306 aa  54.3  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1107  2-dehydropantoate 2-reductase  32.74 
 
 
319 aa  54.3  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2967  2-dehydropantoate 2-reductase  30.73 
 
 
311 aa  54.7  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.53344  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1736  2-dehydropantoate 2-reductase  27.27 
 
 
309 aa  54.7  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0419891 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0260  2-dehydropantoate 2-reductase  31.75 
 
 
331 aa  54.3  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0191  2-dehydropantoate 2-reductase  30.57 
 
 
339 aa  54.3  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00418767  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4373  2-dehydropantoate 2-reductase  28.72 
 
 
305 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0586836 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2629  2-dehydropantoate 2-reductase  29.2 
 
 
314 aa  53.9  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2753  2-dehydropantoate 2-reductase  32.11 
 
 
309 aa  53.9  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1323  2-dehydropantoate 2-reductase  27.2 
 
 
316 aa  53.9  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.684769  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0533  ketopantoate reductase ApbA/PanE  28.73 
 
 
334 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1351  2-dehydropantoate 2-reductase  28.21 
 
 
305 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.144072 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0788  2-dehydropantoate 2-reductase  27.71 
 
 
307 aa  53.5  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1695  ketopantoate reductase ApbA/PanE-like protein  28.73 
 
 
334 aa  53.5  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1723  ketopantoate reductase ApbA/PanE  28.73 
 
 
334 aa  53.5  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.711694  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1739  ketopantoate reductase ApbA/PanE  28.73 
 
 
334 aa  53.5  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.753948  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1673  ketopantoate reductase ApbA/PanE  28.73 
 
 
334 aa  53.5  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.662338  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2019  ketopantoate reductase ApbA/PanE  46.27 
 
 
627 aa  53.5  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.691708  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2099  2-dehydropantoate 2-reductase  34.62 
 
 
335 aa  53.1  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.531117  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2226  2-dehydropantoate 2-reductase  25.46 
 
 
336 aa  53.1  0.000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0839  2-dehydropantoate 2-reductase  28.29 
 
 
307 aa  52.8  0.000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0218  2-dehydropantoate 2-reductase  33.61 
 
 
300 aa  52.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>