157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_16020 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_16020  ketopantoate reductase  100 
 
 		 299 aa  617  1e-176  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.431175  hitchhiker  0.000000288636 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0353  GDSL family lipase/acylhydrolase  55.9 
 
 		 531 aa  348  5e-95  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3712  Ketopantoate reductase ApbA/PanE domain protein  33.73 
 
 		 286 aa  114  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.439375  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1981  Ketopantoate reductase ApbA/PanE domain protein  31.18 
 
 		 290 aa  108  9.000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0271338  hitchhiker  0.000000668288 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2775  alpha/beta hydrolase fold protein  29.43 
 
 		 621 aa  107  2e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0533  ketopantoate reductase ApbA/PanE  30.1 
 
 		 334 aa  70.1  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1695  ketopantoate reductase ApbA/PanE-like protein  30.1 
 
 		 334 aa  69.7  0.00000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1723  ketopantoate reductase ApbA/PanE  30.1 
 
 		 334 aa  69.7  0.00000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.711694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1739  ketopantoate reductase ApbA/PanE  30.1 
 
 		 334 aa  69.7  0.00000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.753948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1673  ketopantoate reductase ApbA/PanE  30.1 
 
 		 334 aa  69.7  0.00000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.662338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0557  ketopantoate reductase ApbA/PanE  30.1 
 
 		 334 aa  69.3  0.00000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.302954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3781  2-dehydropantoate 2-reductase  26.98 
 
 		 312 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0449567 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3892  2-dehydropantoate 2-reductase  35.58 
 
 		 310 aa  62.4  0.000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4726  2-dehydropantoate 2-reductase  26.71 
 
 		 315 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.14221 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4356  2-dehydropantoate 2-reductase  32.18 
 
 		 335 aa  60.8  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.484695 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0163  2-dehydropantoate 2-reductase  29.85 
 
 		 306 aa  59.7  0.00000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1558  2-dehydropantoate 2-reductase  35.85 
 
 		 447 aa  58.9  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0050  2-dehydropantoate 2-reductase  28.71 
 
 		 335 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0021  2-dehydropantoate 2-reductase  30.54 
 
 		 306 aa  57.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2226  2-dehydropantoate 2-reductase  34.19 
 
 		 336 aa  57.8  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0313  2-dehydropantoate 2-reductase  27.37 
 
 		 307 aa  57.8  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.82281 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0211  2-dehydropantoate 2-reductase  35.85 
 
 		 324 aa  57.4  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.817769  normal  0.569864 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2023  2-dehydropantoate 2-reductase  27.08 
 
 		 324 aa  56.6  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.607439  normal  0.396245 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4203  2-dehydropantoate 2-reductase  27.44 
 
 		 315 aa  57  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.379422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3040  2-dehydropantoate 2-reductase  36.79 
 
 		 324 aa  56.2  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0480  2-dehydropantoate 2-reductase  27.41 
 
 		 346 aa  55.8  0.0000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4655  2-dehydropantoate 2-reductase  24.5 
 
 		 306 aa  55.8  0.0000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2998  2-dehydropantoate 2-reductase, putative  29.19 
 
 		 315 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0207469 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4423  2-dehydropantoate 2-reductase  28.12 
 
 		 311 aa  55.5  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.852681 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2669  2-dehydropantoate 2-reductase  27.46 
 
 		 310 aa  55.1  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0588922  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0743  ketopantoate reductase ApbA/PanE  27.08 
 
 		 311 aa  54.7  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.786977  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2873  Ketopantoate reductase ApbA/PanE domain protein  22.65 
 
 		 296 aa  54.3  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.393919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0107  2-dehydropantoate 2-reductase  26.34 
 
 		 333 aa  54.3  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1724  2-dehydropantoate 2-reductase  24.04 
 
 		 331 aa  54.3  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1216  2-dehydropantoate 2-reductase  31.13 
 
 		 325 aa  55.1  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.192364  normal  0.954067 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4552  2-dehydropantoate 2-reductase  34.62 
 
 		 307 aa  53.9  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6687  2-dehydropantoate 2-reductase  29.8 
 
 		 312 aa  53.5  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3431  2-dehydropantoate 2-reductase  31.78 
 
 		 324 aa  53.5  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.990914  normal  0.0502044 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1818  2-dehydropantoate 2-reductase  30.15 
 
 		 327 aa  53.9  0.000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1850  2-dehydropantoate 2-reductase  32.71 
 
 		 353 aa  53.1  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.9641 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0191  2-dehydropantoate 2-reductase  30.21 
 
 		 305 aa  53.5  0.000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2695  2-dehydropantoate 2-reductase  27.96 
 
 		 315 aa  53.1  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.120286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2099  2-dehydropantoate 2-reductase  26.57 
 
 		 335 aa  53.1  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.531117  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0882  2-dehydropantoate 2-reductase  24.91 
 
 		 315 aa  52.8  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.277426 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0260  2-dehydropantoate 2-reductase  30 
 
 		 331 aa  52.8  0.000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5461  2-dehydropantoate 2-reductase  24.91 
 
 		 315 aa  53.1  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.853784  normal  0.141843 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2270  2-dehydropantoate 2-reductase  36.08 
 
 		 326 aa  52.8  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.191181  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2462  2-dehydropantoate 2-reductase  32.73 
 
 		 323 aa  52.8  0.000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0016  2-dehydropantoate 2-reductase  29.44 
 
 		 307 aa  52.4  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4671  2-dehydropantoate 2-reductase  27.36 
 
 		 325 aa  51.6  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3612  2-dehydropantoate 2-reductase  31.58 
 
 		 342 aa  51.6  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4956  2-dehydropantoate 2-reductase  24.73 
 
 		 298 aa  52  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1713  2-dehydropantoate 2-reductase  26.83 
 
 		 306 aa  52  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3341  2-dehydropantoate 2-reductase  34.17 
 
 		 324 aa  52.4  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.185962  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2371  2-dehydropantoate 2-reductase  30.83 
 
 		 333 aa  52  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.58261  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4479  2-dehydropantoate 2-reductase  31.36 
 
 		 337 aa  52  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5051  2-dehydropantoate 2-reductase  28.57 
 
 		 325 aa  52  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.317407  normal  0.691254 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2936  2-dehydropantoate 2-reductase  28.57 
 
 		 312 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.178942 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5446  2-dehydropantoate 2-reductase  31.58 
 
 		 327 aa  51.2  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.686649  normal  0.0261809 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3118  2-dehydropantoate 2-reductase  28.16 
 
 		 312 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.782034 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0218  2-dehydropantoate 2-reductase  33.94 
 
 		 300 aa  51.2  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1681  2-dehydropantoate 2-reductase  29.13 
 
 		 326 aa  50.8  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.53848  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2416  2-dehydropantoate 2-reductase  28.37 
 
 		 335 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.483923  normal  0.193956 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1605  2-dehydropantoate 2-reductase  29.13 
 
 		 326 aa  50.8  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.799177  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2139  2-dehydropantoate 2-reductase  28.37 
 
 		 335 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.147044  normal  0.399133 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2115  2-dehydropantoate 2-reductase  31.94 
 
 		 329 aa  50.8  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3545  2-dehydropantoate 2-reductase  24.91 
 
 		 315 aa  50.4  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.16372  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4822  2-dehydropantoate 2-reductase  24.91 
 
 		 315 aa  50.4  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.117223 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0191  2-dehydropantoate 2-reductase  26.2 
 
 		 339 aa  50.4  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00418767  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6167  2-dehydropantoate 2-reductase  30.81 
 
 		 314 aa  50.4  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1471  2-dehydropantoate 2-reductase  33.33 
 
 		 329 aa  50.4  0.00004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1861  2-dehydropantoate 2-reductase  28.26 
 
 		 317 aa  50.4  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0729  2-dehydropantoate 2-reductase  29.21 
 
 		 306 aa  50.4  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.691763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3162  2-dehydropantoate 2-reductase  28 
 
 		 312 aa  50.4  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.396021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1964  2-dehydropantoate 2-reductase  33.33 
 
 		 329 aa  50.4  0.00004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.734659  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1238  2-dehydropantoate 2-reductase  33.33 
 
 		 329 aa  50.4  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2487  2-dehydropantoate 2-reductase  33.33 
 
 		 329 aa  50.1  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4116  2-dehydropantoate 2-reductase  26.59 
 
 		 308 aa  50.1  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.605632 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1224  2-dehydropantoate 2-reductase  33 
 
 		 327 aa  49.7  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.318793 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1400  2-dehydropantoate 2-reductase  29.66 
 
 		 345 aa  50.1  0.00005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45590  hypothetical protein  33 
 
 		 359 aa  49.7  0.00006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5228  2-dehydropantoate 2-reductase  34.55 
 
 		 332 aa  49.7  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.724551 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0600  2-dehydropantoate 2-reductase  26.56 
 
 		 314 aa  49.3  0.00007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000137771  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5770  2-dehydropantoate 2-reductase  27.42 
 
 		 307 aa  49.3  0.00009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1323  2-dehydropantoate 2-reductase  31.25 
 
 		 316 aa  48.9  0.00009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.684769  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0018  2-dehydropantoate 2-reductase  30.89 
 
 		 306 aa  48.5  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0603  2-dehydropantoate 2-reductase  31.78 
 
 		 299 aa  48.9  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0186  2-dehydropantoate 2-reductase  24.61 
 
 		 306 aa  48.5  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5382  2-dehydropantoate 2-reductase  34.02 
 
 		 327 aa  48.5  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.324063  normal  0.227406 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6243  2-dehydropantoate 2-reductase  24.72 
 
 		 316 aa  48.1  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1845  2-dehydropantoate 2-reductase  34 
 
 		 332 aa  48.1  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.995272  normal  0.0110748 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1719  2-dehydropantoate 2-reductase  30.25 
 
 		 312 aa  47.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.11731  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06250  2-dehydropantoate 2-reductase  40.59 
 
 		 305 aa  47.8  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4498  2-dehydropantoate 2-reductase  27.01 
 
 		 312 aa  48.1  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.646734  normal  0.399113 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0716  2-dehydropantoate 2-reductase  31.25 
 
 		 310 aa  48.1  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.379767 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5508  2-dehydropantoate 2-reductase  24.72 
 
 		 323 aa  47.4  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.723336  normal  0.36356 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1915  2-dehydropantoate 2-reductase  32.11 
 
 		 332 aa  47.4  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.546087  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5729  2-dehydropantoate 2-reductase  25 
 
 		 301 aa  47  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.807147  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6131  2-dehydropantoate 2-reductase  25.56 
 
 		 341 aa  47.4  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1790  2-dehydropantoate 2-reductase  30.86 
 
 		 332 aa  47  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>