105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4216 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_4216  transcriptional regulator, TrmB  100 
 
 		 200 aa  396  1e-109  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.141181  normal  0.174348 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3725  transcriptional regulator, ArsR family  39.33 
 
 		 196 aa  101  6e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.833334  normal  0.384305 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0259  transcriptional regulator, ArsR family  35.29 
 
 		 171 aa  75.9  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.792172  normal  0.339898 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1526  putative transcriptional regulator  36.08 
 
 		 180 aa  67  0.0000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0870  transcriptional regulator, ArsR family  33.74 
 
 		 171 aa  63.5  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.680607 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1887  putative transcriptional regulatory protein  34.88 
 
 		 188 aa  60.1  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.471019  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1838  transcriptional regulator, ArsR family  30.43 
 
 		 472 aa  59.3  0.00000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.240001  normal  0.27249 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1606  transcriptional regulatory protein, putative  33.72 
 
 		 188 aa  58.5  0.00000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00436475  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7611  ArsR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 185 aa  56.2  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4756  transcriptional regulator, ArsR family  36.36 
 
 		 150 aa  54.7  0.0000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00171627  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3269  ArsR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 207 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.574198  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2826  regulatory protein, ArsR  38.46 
 
 		 112 aa  53.9  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0214569  hitchhiker  0.000742235 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1497  transcriptional regulator  36.25 
 
 		 149 aa  51.2  0.000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2973  putative transcriptional regulator  34.57 
 
 		 207 aa  50.8  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0226444  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3245  transcriptional regulator, ArsR family  35.8 
 
 		 208 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1739  hypothetical protein  36.25 
 
 		 149 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0385114  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1796  hypothetical protein  35 
 
 		 149 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1718  hypothetical protein  35 
 
 		 149 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0824  transcriptional regulator, ArsR family  40.23 
 
 		 110 aa  49.3  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0045  transcriptional regulator, ArsR family  34.18 
 
 		 142 aa  49.3  0.00004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1047  transcriptional regulator, ArsR family  43.66 
 
 		 194 aa  49.3  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0265584 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3009  ArsR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 207 aa  48.9  0.00006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3024  ArsR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 207 aa  48.5  0.00007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2946  ArsR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 207 aa  48.5  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.958799  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3257  ArsR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 207 aa  48.5  0.00007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3255  transcriptional regulator, ArsR family  34.57 
 
 		 207 aa  48.5  0.00007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8127  transcriptional regulator, ArsR family  33.9 
 
 		 209 aa  48.1  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1532  hypothetical protein  33.75 
 
 		 149 aa  47.8  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1651  hypothetical protein  33.75 
 
 		 149 aa  47.8  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4017  regulatory protein, ArsR  30.43 
 
 		 190 aa  47.8  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.94661  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1506  ArsR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 149 aa  47.4  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0520742  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1537  ArsR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 149 aa  47  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.238883  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2480  transcriptional regulator, ArsR family  45.76 
 
 		 118 aa  47.4  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2859  transcriptional regulator, ArsR  45.76 
 
 		 118 aa  47.4  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.156895  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22370  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 121 aa  47  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.186573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2317  transcriptional regulator, ArsR family  41.94 
 
 		 115 aa  47  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.161195 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1697  ArsR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 86 aa  46.2  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000623406  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2932  regulatory protein ArsR  38.16 
 
 		 111 aa  46.2  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00263901  hitchhiker  0.00135799 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2552  ArsR family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 185 aa  46.2  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0674571  normal  0.191331 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1075  ArsR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 107 aa  45.8  0.0005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000458748  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1386  ArsR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 107 aa  45.8  0.0005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.705753 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5611  ArsR family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 103 aa  45.1  0.0008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4024  transcriptional regulator, ArsR family  30.77 
 
 		 93 aa  44.7  0.0008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0486243  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1230  putative transcriptional regulator, ArsR family  38.57 
 
 		 330 aa  45.1  0.0008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2191  ArsR family transcriptional regulator  40.23 
 
 		 115 aa  44.7  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0860  regulatory protein, ArsR  37.62 
 
 		 114 aa  44.7  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3727  regulatory protein, ArsR  40.68 
 
 		 137 aa  44.7  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.438217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2047  regulatory protein, ArsR  35.19 
 
 		 144 aa  44.7  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.314568  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3434  ArsR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 113 aa  44.3  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.181701  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1305  ArsR family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 105 aa  44.3  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0788  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 124 aa  44.7  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.428593  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1182  transcriptional regulator, ArsR family  42.19 
 
 		 99 aa  43.5  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00795875  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1005  ArsR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 112 aa  43.5  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.146198  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2101  ArsR family transcriptional regulator  48 
 
 		 317 aa  43.5  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5891  regulatory protein, ArsR  36.36 
 
 		 109 aa  43.5  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10842  transcriptional regulator  40.68 
 
 		 130 aa  43.9  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.67021e-19  hitchhiker  0.000000379454 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1014  ArsR family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 124 aa  43.9  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.379913 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3275  transcriptional regulator, ArsR family  36.21 
 
 		 184 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.42483  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0935  transcriptional regulator, ArsR family  42.65 
 
 		 118 aa  43.5  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1143  transcriptional regulator, ArsR family  38.46 
 
 		 96 aa  43.1  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000214185  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3941  transcriptional regulator, ArsR family  36.36 
 
 		 113 aa  43.5  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.393884  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2272  transcriptional regulator, ArsR family  34.33 
 
 		 130 aa  43.9  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0649616  normal  0.067843 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_876  transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 		 112 aa  43.9  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7936  putative transcriptional regulator, ArsR family  40.51 
 
 		 328 aa  43.5  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209211  normal  0.473194 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2257  transcriptional regulator, ArsR family  38.1 
 
 		 183 aa  43.5  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.587807  normal  0.865774 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2260  transcriptional regulator, ArsR family  35.14 
 
 		 183 aa  42.7  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.1059  normal  0.463419 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3415  regulatory protein ArsR  35.63 
 
 		 113 aa  42.7  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2855  transcriptional regulator, ArsR family  45.45 
 
 		 100 aa  42.7  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.293533  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4095  putative transcriptional regulator  28.25 
 
 		 196 aa  43.1  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.475604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1190  ArsR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 114 aa  42.4  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.417891 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0179  ArsR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 87 aa  42.4  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2973  transcriptional regulator, ArsR family  36.59 
 
 		 94 aa  42.7  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1381  transcriptional regulator, ArsR family  36.78 
 
 		 133 aa  42.7  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3384  transcriptional regulator, ArsR family  42.31 
 
 		 105 aa  42.4  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.508828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3654  transcriptional regulator, ArsR family  38.36 
 
 		 226 aa  42.7  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.162067 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5727  transcriptional regulator, ArsR family  46 
 
 		 111 aa  42.7  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.513261  normal  0.813202 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0109  ArsR family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 197 aa  42  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0846  ArsR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 91 aa  42.4  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0892  ArsR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 112 aa  42.4  0.005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2109  ArsR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 131 aa  42.4  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0530099  normal  0.0700709 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4852  transcriptional regulator, ArsR family  31.25 
 
 		 114 aa  42.4  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2827  transcriptional regulator, ArsR family  42.11 
 
 		 115 aa  42.4  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0287  regulatory protein ArsR  43.33 
 
 		 112 aa  42.4  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1960  putative transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  42.37 
 
 		 118 aa  42  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.234312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0264  ArsR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 114 aa  42  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.88486  normal  0.727225 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1005  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 116 aa  42  0.006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0103223  normal  0.0233709 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1437  transcriptional regulator, ArsR family  30.49 
 
 		 162 aa  42  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4545  ArsR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 187 aa  42  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0707495  normal  0.191523 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3521  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 368 aa  42  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0047  transcriptional repressor of chromosomal ars operon  38.89 
 
 		 112 aa  42  0.007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0346943  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1421  regulatory protein, ArsR  42.31 
 
 		 113 aa  41.6  0.007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.116907  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2830  methyltransferase type 11  35.29 
 
 		 349 aa  41.6  0.007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.157878 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5266  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 368 aa  42  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5219  transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 		 118 aa  41.6  0.007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2299  ArsR family transcriptional regulator  42 
 
 		 115 aa  41.6  0.008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0302  ArsR family transcriptional regulator  42 
 
 		 103 aa  41.6  0.008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.919233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1266  regulatory protein, ArsR  34.25 
 
 		 198 aa  41.6  0.008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.234884 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2476  transcriptional regulator, ArsR family  35.63 
 
 		 112 aa  41.6  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.135015  normal  0.0281012 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2625  ArsR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 92 aa  41.2  0.009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0040  putative transcriptional regulator  40.91 
 
 		 224 aa  41.6  0.009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.533704 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>