98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0371 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_0371  hypothetical protein  100 
 
 
275 aa  543  1e-153  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0317  Luciferase-like monooxygenase  33.45 
 
 
287 aa  124  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1139  putative F420-dependent oxidoreductase  30.56 
 
 
289 aa  100  2e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39070  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  30.74 
 
 
296 aa  83.6  0.000000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.604696 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4930  luciferase family protein  27.6 
 
 
274 aa  81.3  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0362878  normal  0.0194962 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1815  luciferase family protein  26.79 
 
 
289 aa  80.5  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6911  luciferase family protein  24.85 
 
 
325 aa  76.3  0.0000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4755  luciferase family protein  29.64 
 
 
274 aa  73.2  0.000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.377838  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4461  luciferase family protein  29.64 
 
 
274 aa  73.2  0.000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0432852  normal  0.0185115 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4374  luciferase-like protein  29.64 
 
 
274 aa  73.2  0.000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.111927  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0516  luciferase family protein  26.44 
 
 
327 aa  71.6  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0213  putative F420-dependent oxidoreductase  26.81 
 
 
336 aa  71.6  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3259  luciferase family protein  27.24 
 
 
350 aa  70.9  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0757  luciferase family protein  30.73 
 
 
310 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.701747  normal  0.787392 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3123  Luciferase-like monooxygenase  28.75 
 
 
312 aa  63.5  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.23873  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2659  luciferase-like  25 
 
 
327 aa  63.5  0.000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0969127 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0173  putative F420-dependent oxidoreductase  30.88 
 
 
326 aa  61.2  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.182486  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2517  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  29.32 
 
 
304 aa  58.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.165572  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2247  luciferase family protein  36.89 
 
 
310 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4098  luciferase family protein  29.24 
 
 
310 aa  52.8  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.207864  normal  0.49324 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29280  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  26.21 
 
 
328 aa  52.8  0.000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.963848  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4793  Luciferase-like monooxygenase  31.16 
 
 
349 aa  51.6  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3381  luciferase family protein  30.61 
 
 
337 aa  50.8  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4972  Luciferase-like monooxygenase  41.03 
 
 
317 aa  50.8  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3320  luciferase family protein  33.33 
 
 
338 aa  50.1  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.180327  normal  0.483465 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0205  methylenetetrahydromethanopterin reductase  28.49 
 
 
318 aa  49.7  0.00005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.987151  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2031  luciferase-like protein  39.56 
 
 
313 aa  49.3  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2077  luciferase family protein  39.56 
 
 
313 aa  49.3  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.841403 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2014  luciferase family protein  39.56 
 
 
313 aa  49.3  0.00008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.599873  normal  0.371395 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2260  luciferase family protein  29.22 
 
 
347 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.294332  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2329  Luciferase-like monooxygenase  28.1 
 
 
339 aa  48.1  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270807  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2265  luciferase family protein  29.87 
 
 
346 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2920  luciferase family protein  30.63 
 
 
291 aa  47  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4162  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  30.2 
 
 
333 aa  47  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.945898  normal  0.398456 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1207  putative F420-dependent oxidoreductase  26.94 
 
 
327 aa  47  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.814029  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1301  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase and related flavin-dependent oxidoreductase  29.23 
 
 
336 aa  47.4  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.350981  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1419  Luciferase-like monooxygenase  32.82 
 
 
293 aa  47  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3088  luciferase-like protein  36.36 
 
 
299 aa  47  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3286  luciferase family protein  30.15 
 
 
307 aa  46.6  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0452434 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2087  luciferase family protein  29.87 
 
 
346 aa  46.2  0.0006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0147979  normal  0.63736 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3644  luciferase family protein  29.87 
 
 
346 aa  46.2  0.0006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.130748  normal  0.102583 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2774  Luciferase-like monooxygenase  29.85 
 
 
350 aa  46.2  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000162274  hitchhiker  0.000235272 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3077  luciferase family protein  28.79 
 
 
309 aa  45.8  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2788  Luciferase-like monooxygenase  34.86 
 
 
296 aa  45.8  0.0007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1977  Luciferase-like monooxygenase  32.53 
 
 
282 aa  45.8  0.0008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3478  luciferase family protein  32.08 
 
 
347 aa  45.8  0.0008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1552  Luciferase-like monooxygenase  35.24 
 
 
284 aa  45.8  0.0008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3263  luciferase-like  28.95 
 
 
347 aa  45.4  0.0009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.712407  normal  0.0317231 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2313  luciferase family protein  32.98 
 
 
316 aa  45.4  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0072758  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7422  Luciferase-like monooxygenase  25.12 
 
 
316 aa  45.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33827  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2603  putative F420-dependent oxidoreductase  30.77 
 
 
328 aa  45.4  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.52821  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12907  oxidoreductase  33.02 
 
 
325 aa  45.1  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000227121  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5223  luciferase family protein  27.8 
 
 
330 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.018076 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3523  Luciferase-like monooxygenase  33.56 
 
 
349 aa  45.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.551464  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2491  luciferase family protein  32.53 
 
 
310 aa  45.1  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.2611  normal  0.915237 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4155  luciferase-like  35.35 
 
 
343 aa  45.1  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.455198 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2104  luciferase family protein  31.63 
 
 
353 aa  45.4  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2098  luciferase family protein  35.06 
 
 
309 aa  45.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.463112 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3115  putative F420-dependent oxidoreductase  34.58 
 
 
754 aa  44.7  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000129974 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4855  luciferase-like protein  27.32 
 
 
341 aa  44.3  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2183  Luciferase-like monooxygenase  31.69 
 
 
289 aa  44.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0087  Luciferase-like monooxygenase  30.23 
 
 
355 aa  44.7  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2346  luciferase family protein  26.76 
 
 
316 aa  44.3  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0184001 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3016  hypothetical protein  38.75 
 
 
295 aa  44.7  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.098004  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4906  luciferase family protein  40.24 
 
 
325 aa  44.3  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.089783  normal  0.0157174 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5695  luciferase family protein  27.78 
 
 
286 aa  44.3  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.146497 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4944  luciferase family protein  27.32 
 
 
330 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1828  Luciferase-like monooxygenase  40.82 
 
 
329 aa  43.9  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0959568 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3880  luciferase family protein  35.06 
 
 
316 aa  43.9  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2278  luciferase  28.86 
 
 
345 aa  43.9  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0442763  normal  0.0103665 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1886  luciferase-like  38.67 
 
 
287 aa  43.9  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.5944 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4150  hypothetical protein  35.05 
 
 
296 aa  43.9  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2322  luciferase family protein  34.18 
 
 
281 aa  43.9  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0803  putative F420-dependent oxidoreductase  34.15 
 
 
328 aa  43.9  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0629  luciferase family protein  32.53 
 
 
319 aa  43.5  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0662642 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4515  putative F420-dependent oxidoreductase  27.13 
 
 
346 aa  43.5  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0369  luciferase-like protein  32.14 
 
 
307 aa  43.1  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0907338  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2588  bacterial luciferase family protein  28.86 
 
 
345 aa  43.5  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.143367  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4271  luciferase family protein  35.06 
 
 
316 aa  43.5  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0653657  normal  0.0110143 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01300  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  32.03 
 
 
296 aa  43.5  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.570221  normal  0.447872 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6491  luciferase family protein  35 
 
 
336 aa  43.5  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.988125  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2163  luciferase family protein  30.6 
 
 
350 aa  43.1  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2317  luciferase family protein  30.6 
 
 
350 aa  43.1  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00863612 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2214  glucose-6-phosphate dehydrogenase (coenzyme F420)  35.42 
 
 
347 aa  43.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.125658  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1696  luciferase family protein  29.69 
 
 
330 aa  43.1  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.862088  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0268  luciferase family protein  31.33 
 
 
313 aa  42.7  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7375  Luciferase-like monooxygenase  38.27 
 
 
282 aa  42.7  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.758616 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3410  putative F420-dependent oxidoreductase  38.81 
 
 
293 aa  42.7  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.212924  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8767  hypothetical protein  34.67 
 
 
278 aa  42.7  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.430519 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0487  luciferase family protein  35.96 
 
 
292 aa  42.7  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.372075  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2460  putative F420-dependent oxidoreductase  30.37 
 
 
531 aa  42.4  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.952845  normal  0.0130004 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2418  Luciferase-like monooxygenase  33.33 
 
 
311 aa  42.4  0.008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00430888  hitchhiker  0.005997 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7171  monooxygenase  29.07 
 
 
348 aa  42.4  0.008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21228  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0438  luciferase family protein  31.65 
 
 
309 aa  42.4  0.009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.465558  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0451  luciferase-like protein  31.65 
 
 
309 aa  42.4  0.009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00720803  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0462  luciferase family protein  31.65 
 
 
312 aa  42.4  0.009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.628952 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0254  methylenetetrahydromethanopterin reductase  23.53 
 
 
328 aa  42.4  0.009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.893725 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4065  luciferase family protein  30.46 
 
 
344 aa  42  0.01  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>