More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_4115 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_4115  hydrogen dehydrogenase  100 
 
 		 239 aa  482  1e-135  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.178174  normal  0.335137 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1523  ferredoxin  76.86 
 
 		 236 aa  369  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000171825  hitchhiker  0.00403982 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2725  NAD-reducing hydrogenase, gamma subunit  42.98 
 
 		 243 aa  192  5e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.006537  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0980  ferredoxin  41.23 
 
 		 235 aa  189  2.9999999999999997e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2248  ferredoxin  41.28 
 
 		 243 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0185475  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3857  hydrogen dehydrogenase  41.41 
 
 		 240 aa  181  1e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1671  hydrogen dehydrogenase  41.1 
 
 		 245 aa  180  2e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1461  ferredoxin  39.74 
 
 		 234 aa  174  9.999999999999999e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.544429 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0529  putative NADH dehydrogenase subunit  39.21 
 
 		 246 aa  167  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.243128  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2750  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  38.91 
 
 		 240 aa  163  3e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1216  hydrogen dehydrogenase  34.93 
 
 		 433 aa  157  1e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0473732 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4051  bidirectional hydrogenase complex protein HoxU  39.15 
 
 		 238 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0848168 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4164  bidirectional hydrogenase complex protein HoxU  37.26 
 
 		 238 aa  142  5e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2557  bidirectional hydrogenase complex protein HoxU  36.36 
 
 		 238 aa  138  7e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.379328  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0097  bidirectional hydrogenase complex protein HoxU  33.49 
 
 		 238 aa  136  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0094  bidirectional hydrogenase complex protein HoxU  33.49 
 
 		 238 aa  135  5e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.604003 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4657  bidirectional hydrogenase complex protein HoxU  33.02 
 
 		 238 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2793  bidirectional hydrogenase complex protein HoxU  33.05 
 
 		 240 aa  123  2e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30068  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3541  bidirectional hydrogenase complex protein HoxU  34.15 
 
 		 235 aa  122  6e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2720  bidirectional hydrogenase complex protein HoxU  34.93 
 
 		 238 aa  119  3e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2478  bidirectional hydrogenase complex protein HoxU  34.13 
 
 		 235 aa  119  3.9999999999999996e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0927823  normal  0.689692 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0076  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulphur binding, conserved site  31.6 
 
 		 559 aa  119  4.9999999999999996e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.75307  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1366  bidirectional hydrogenase complex protein HoxU  33.17 
 
 		 235 aa  116  3e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2714  bidirectional hydrogenase complex protein HoxU  32.54 
 
 		 239 aa  115  6e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1111  bidirectional hydrogenase complex protein HoxU  33.49 
 
 		 238 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.592876  normal  0.501453 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3509  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.39 
 
 		 905 aa  113  2.0000000000000002e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.434543  normal  0.526227 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4258  NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit G, iron-sulfur-binding protein  30.66 
 
 		 226 aa  113  3e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.27815  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2705  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  32.85 
 
 		 355 aa  113  3e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.223751 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0100  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.73 
 
 		 893 aa  111  1.0000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000102152  hitchhiker  0.000000000000206048 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1717  Iron hydrogenase, small subunit  32.21 
 
 		 573 aa  111  1.0000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.118526  normal  0.410336 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06330  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 75 kDa subunit  31.88 
 
 		 578 aa  111  1.0000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00021405  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2138  hydrogenase, Fe-only  31.1 
 
 		 581 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000865974  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0785  NADH dehydrogenase I chain G  33.65 
 
 		 353 aa  111  1.0000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2100  ferredoxin  33.89 
 
 		 609 aa  110  2.0000000000000002e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.624892  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0660  molybdopterin oxidoreductase  32.04 
 
 		 822 aa  109  3e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.672989  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2559  NADH dehydrogenase subunit G  32.08 
 
 		 797 aa  108  6e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.437488  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0030  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  30.8 
 
 		 359 aa  108  6e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00062453  normal  0.73393 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2232  hydrogenase, Fe-only  29.81 
 
 		 582 aa  108  9.000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3132  molybdopterin oxidoreductase  30.43 
 
 		 815 aa  108  9.000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1856  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  27.95 
 
 		 351 aa  107  1e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3639  molybdopterin oxidoreductase  29.61 
 
 		 843 aa  107  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.424964  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2312  formate dehydrogenase subunit alpha  30 
 
 		 899 aa  107  1e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0941024  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4076  ferredoxin  31.19 
 
 		 334 aa  107  1e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.505676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1367  hydrogenase large subunit  32.35 
 
 		 645 aa  107  2e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4066  NADH dehydrogenase subunit G  29.18 
 
 		 871 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0945726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1538  molybdopterin oxidoreductase  32.86 
 
 		 879 aa  106  4e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1319  hydrogenase large subunit  32.35 
 
 		 645 aa  106  4e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1017  iron hydrogenase, small subunit  29.33 
 
 		 574 aa  105  4e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1309  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  29.2 
 
 		 788 aa  105  5e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0823  NADH dehydrogenase subunit G  30.7 
 
 		 700 aa  105  6e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.477547  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1708  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.56 
 
 		 959 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0844  hydrogenases, Fe-only  32.69 
 
 		 576 aa  104  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1783  hydrogenase, Fe-only  31.88 
 
 		 583 aa  103  2e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0236  hydrogenase, Fe-only  35.07 
 
 		 586 aa  104  2e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.660897  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0673  molybdopterin oxidoreductase  31.88 
 
 		 822 aa  103  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01358e-20 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3504  ferredoxin  30.48 
 
 		 312 aa  103  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0835  anaerobic dehydrogenase  29.86 
 
 		 305 aa  103  2e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0729  ferredoxin  31.16 
 
 		 628 aa  104  2e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7013  ferredoxin  30.73 
 
 		 362 aa  103  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3187  ferredoxin  32.27 
 
 		 468 aa  103  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0634  ferredoxin  32.27 
 
 		 468 aa  103  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1629  ferredoxin  32.27 
 
 		 468 aa  103  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0156  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.9 
 
 		 898 aa  103  3e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2830  NADH dehydrogenase subunit G  32.21 
 
 		 783 aa  103  3e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2699  NADH dehydrogenase subunit G  32.21 
 
 		 783 aa  103  3e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0661  molybdopterin oxidoreductase  28.5 
 
 		 808 aa  103  3e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_85822  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 78K chain precursor, 5-prime end  31.03 
 
 		 722 aa  103  3e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.28905  normal  0.0501454 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4113  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.54 
 
 		 901 aa  103  3e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.163208  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1831  NADH dehydrogenase I chain G  33.62 
 
 		 363 aa  103  3e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0053  NADH dehydrogenase subunit G  30.48 
 
 		 679 aa  102  4e-21  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.292666  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4238  molybdopterin oxidoreductase  30.43 
 
 		 828 aa  102  4e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1759  NADH dehydrogenase subunit G  30.81 
 
 		 795 aa  102  5e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0152  hydrogenase, Fe-only  31.82 
 
 		 580 aa  102  7e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0334  NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit G, iron-sulphur binding protein  32.92 
 
 		 826 aa  102  8e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1029  NADH dehydrogenase I chain G  33.19 
 
 		 358 aa  102  8e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3349  NADH dehydrogenase I, G subunit, putative  31.4 
 
 		 828 aa  101  9e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.407234  normal  0.217544 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0344  NADH dehydrogenase I, G subunit, putative  30.43 
 
 		 826 aa  101  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0560  hydrogenase, Fe-only  34.09 
 
 		 666 aa  101  1e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00291892  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0386  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.11 
 
 		 917 aa  100  1e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.118073  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5104  NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit G, iron-sulphur binding protein  30.28 
 
 		 361 aa  100  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1809  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.16 
 
 		 960 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.550904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4457  NADH dehydrogenase subunit G  31.7 
 
 		 839 aa  100  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.815296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0720  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.52 
 
 		 949 aa  100  2e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1277  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  28.46 
 
 		 791 aa  100  2e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.770189 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3019  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.92 
 
 		 957 aa  100  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2185  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.7 
 
 		 960 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.602321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4059  NADH dehydrogenase subunit G  32.14 
 
 		 839 aa  99.8  3e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.785313 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2383  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.46 
 
 		 959 aa  100  3e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2856  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.39 
 
 		 959 aa  99.8  3e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0578  NADH dehydrogenase subunit G  29.44 
 
 		 1039 aa  100  3e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0992  NADH dehydrogenase subunit G  31.73 
 
 		 791 aa  99.4  4e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.529585  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0342  hydrogenase, Fe-only  27.54 
 
 		 582 aa  99.4  4e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0172  hydrogenase, Fe-only  32.86 
 
 		 573 aa  99.4  4e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3552  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.7 
 
 		 960 aa  99.4  4e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2249  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.96 
 
 		 903 aa  99  5e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.580662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0714  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  32.52 
 
 		 798 aa  99.4  5e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0110  molybdopterin oxidoreductase  33.17 
 
 		 998 aa  99  6e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4120  NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit G, iron- sulphur binding protein  28.46 
 
 		 320 aa  99  6e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0589  NADH dehydrogenase subunit G  29.44 
 
 		 1030 aa  98.6  7e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1299  hydrogenase, Fe-only  29.81 
 
 		 579 aa  98.6  7e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.130328  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>