More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_4076 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_4076  ferredoxin  100 
 
 		 334 aa  697    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.505676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7013  ferredoxin  78.48 
 
 		 362 aa  509  1e-143  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5104  NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit G, iron-sulphur binding protein  75 
 
 		 361 aa  501  1e-141  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1376  NADH dehydrogenase I chain G  75.16 
 
 		 323 aa  494  1e-139  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.034851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4082  ferredoxin  70.36 
 
 		 371 aa  469  1.0000000000000001e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.237691  normal  0.121556 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1240  ferredoxin  68.98 
 
 		 342 aa  444  1e-123  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2251  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  42.7 
 
 		 782 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000992476 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2624  NADH-quinone oxidoreductase, G subunit  42.7 
 
 		 782 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2055  NADH dehydrogenase subunit G  41.92 
 
 		 808 aa  200  3e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3334  NADH dehydrogenase subunit G  40.94 
 
 		 689 aa  199  3.9999999999999996e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.318541 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1964  NADH dehydrogenase subunit G  38.79 
 
 		 797 aa  199  3.9999999999999996e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0536465  normal  0.0616113 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1885  NADH dehydrogenase subunit G  45.78 
 
 		 783 aa  199  5e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.441319 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2208  NADH dehydrogenase subunit G  45.78 
 
 		 783 aa  199  6e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.336643 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1045  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  40.38 
 
 		 771 aa  197  1.0000000000000001e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2056  NADH dehydrogenase subunit G  45.33 
 
 		 783 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.81056  normal  0.0464837 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0827  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  40.3 
 
 		 771 aa  197  1.0000000000000001e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.342284  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0967  NADH dehydrogenase subunit G  44.89 
 
 		 791 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0699273  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5174  NADH dehydrogenase subunit G  45.33 
 
 		 707 aa  197  2.0000000000000003e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3629  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  40.48 
 
 		 797 aa  197  2.0000000000000003e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.192772 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0053  NADH dehydrogenase subunit G  38.83 
 
 		 679 aa  196  4.0000000000000005e-49  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.292666  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39049  predicted protein  40.43 
 
 		 685 aa  196  5.000000000000001e-49  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0489184  normal  0.0880451 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0927  NADH dehydrogenase subunit G  39.93 
 
 		 686 aa  196  6e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3250  NADH dehydrogenase subunit G  43.56 
 
 		 717 aa  195  9e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.521932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1430  NADH dehydrogenase subunit G  44 
 
 		 714 aa  195  9e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.718625 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2559  NADH dehydrogenase subunit G  43.75 
 
 		 797 aa  194  2e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.437488  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0963  NADH dehydrogenase subunit G  44.89 
 
 		 715 aa  194  2e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.409091  normal  0.052717 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0878  NADH dehydrogenase subunit G  44.89 
 
 		 710 aa  193  3e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1182  NADH dehydrogenase subunit G  38.25 
 
 		 673 aa  193  3e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.577988  normal  0.579246 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1561  NADH dehydrogenase subunit G  45.74 
 
 		 689 aa  193  3e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1269  NADH dehydrogenase subunit G  44.89 
 
 		 716 aa  193  3e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.626778  normal  0.299354 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3504  NADH dehydrogenase subunit G  44 
 
 		 720 aa  193  4e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1409  putative NADH dehydrogenase I chain G  44 
 
 		 771 aa  192  6e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0277288 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0933  NADH dehydrogenase subunit G  44 
 
 		 790 aa  192  6e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_85822  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 78K chain precursor, 5-prime end  39.93 
 
 		 722 aa  192  6e-48  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.28905  normal  0.0501454 
 
 
-
 
NC_002978  WD0160  NADH dehydrogenase subunit G  40 
 
 		 682 aa  192  1e-47  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1499  NADH dehydrogenase subunit G  43.11 
 
 		 721 aa  191  1e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1320  NADH dehydrogenase subunit G  38.6 
 
 		 672 aa  191  1e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.568369  normal  0.0415953 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1136  NADH dehydrogenase subunit G  43.56 
 
 		 776 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.205487  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2003  NADH dehydrogenase subunit G  43.56 
 
 		 777 aa  191  2e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.643114  normal  0.247059 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2000  NADH dehydrogenase subunit G  38.46 
 
 		 671 aa  191  2e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00951952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1305  NADH dehydrogenase subunit G  43.56 
 
 		 776 aa  191  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1823  NADH dehydrogenase subunit G  43.56 
 
 		 776 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1441  NADH dehydrogenase subunit G  43.56 
 
 		 776 aa  191  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.147964  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0419  NADH dehydrogenase subunit G  43.56 
 
 		 776 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.701161  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1296  NADH dehydrogenase subunit G  43.56 
 
 		 776 aa  191  2e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1067  NADH dehydrogenase subunit G  43.56 
 
 		 776 aa  190  2e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.149532  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0731  NADH dehydrogenase subunit G  43.56 
 
 		 776 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0714  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  43.81 
 
 		 798 aa  191  2e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04288  NADH-ubiquinone oxidoreductase, subunit G, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G04370)  40.49 
 
 		 738 aa  190  2.9999999999999997e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.503379  normal  0.151595 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1034  NADH dehydrogenase subunit G  43.56 
 
 		 776 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.884498  normal  0.272009 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3087  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  41.64 
 
 		 913 aa  190  2.9999999999999997e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1631  NADH dehydrogenase subunit G  43.56 
 
 		 776 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.65954  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2281  NADH dehydrogenase subunit G  43.56 
 
 		 776 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.936523  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2243  NADH dehydrogenase subunit G  43.56 
 
 		 776 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1759  NADH dehydrogenase subunit G  42.04 
 
 		 795 aa  189  4e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5571  NADH dehydrogenase subunit G  43.56 
 
 		 776 aa  189  4e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.199302 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2267  NADH dehydrogenase subunit G  43.56 
 
 		 776 aa  190  4e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.263925  normal  0.104437 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2160  NADH dehydrogenase subunit G  43.56 
 
 		 776 aa  189  5e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.26978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0955  NADH dehydrogenase subunit G  38.77 
 
 		 777 aa  189  8e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.391451  normal  0.458803 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1507  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  42.22 
 
 		 770 aa  189  8e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00792374 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1748  NADH dehydrogenase subunit G  43.3 
 
 		 779 aa  188  9e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB01310  NADH-ubiquinone oxidoreductase, putative  38.63 
 
 		 775 aa  188  1e-46  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.754341  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2237  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  40.13 
 
 		 918 aa  188  1e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2827  NADH dehydrogenase subunit G  38.97 
 
 		 686 aa  187  2e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.655346  normal  0.155123 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0992  NADH dehydrogenase subunit G  42.92 
 
 		 791 aa  187  3e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.529585  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3389  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  40.13 
 
 		 923 aa  187  3e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1097  NADH dehydrogenase subunit G  40.08 
 
 		 809 aa  187  3e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3208  NADH dehydrogenase subunit G  42.22 
 
 		 777 aa  186  3e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.453988  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0618  NADH dehydrogenase subunit G  38.69 
 
 		 683 aa  186  4e-46  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2991  NADH dehydrogenase subunit G  40.23 
 
 		 667 aa  186  4e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.687826 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1349  NADH dehydrogenase subunit G  42.22 
 
 		 777 aa  186  4e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0234349  normal  0.0108936 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2807  NADH dehydrogenase subunit G  44 
 
 		 719 aa  186  4e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.434484  normal  0.352791 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1148  NADH dehydrogenase subunit G  39.46 
 
 		 784 aa  186  6e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1611  NADH dehydrogenase subunit G  36.22 
 
 		 787 aa  185  8e-46  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0552  NADH dehydrogenase subunit G  36.22 
 
 		 787 aa  185  8e-46  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1303  NADH dehydrogenase subunit G  39.69 
 
 		 670 aa  184  1.0000000000000001e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.460965  normal  0.406307 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1361  NADH dehydrogenase subunit G  38.16 
 
 		 699 aa  185  1.0000000000000001e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.587534  normal  0.089712 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2241  NADH dehydrogenase subunit G  36.49 
 
 		 674 aa  184  3e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.242623 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0896  NADH dehydrogenase subunit G  36.52 
 
 		 693 aa  183  4.0000000000000006e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.380192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1043  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  40 
 
 		 903 aa  183  4.0000000000000006e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0751  NADH dehydrogenase subunit G  36.84 
 
 		 660 aa  182  5.0000000000000004e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0442747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3220  NADH dehydrogenase subunit G  36.73 
 
 		 680 aa  182  6e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2879  NADH dehydrogenase subunit G  38.58 
 
 		 691 aa  182  8.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.644938  normal  0.120527 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2294  NADH dehydrogenase subunit G  34.92 
 
 		 669 aa  181  1e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3439  NADH dehydrogenase subunit G  39.51 
 
 		 677 aa  181  2e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0175  NADH dehydrogenase subunit G  37.46 
 
 		 648 aa  181  2e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1267  NADH dehydrogenase subunit G  37.01 
 
 		 693 aa  181  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.555052  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1359  NADH dehydrogenase subunit G  36.65 
 
 		 693 aa  180  4e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.113832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6676  NADH dehydrogenase subunit G  39.64 
 
 		 815 aa  179  4.999999999999999e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2924  NADH dehydrogenase subunit G  37.26 
 
 		 687 aa  179  5.999999999999999e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1720  NADH dehydrogenase subunit G  36.65 
 
 		 693 aa  179  8e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0209  NADH dehydrogenase subunit G  39.78 
 
 		 798 aa  178  9e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2830  NADH dehydrogenase subunit G  38.22 
 
 		 783 aa  178  1e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2521  NADH dehydrogenase subunit G  37.36 
 
 		 654 aa  178  1e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2417  NADH dehydrogenase subunit G  32.8 
 
 		 694 aa  178  1e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.163312  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0808  NADH dehydrogenase subunit G  32.7 
 
 		 694 aa  177  2e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2699  NADH dehydrogenase subunit G  34.54 
 
 		 783 aa  177  2e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1183  NADH dehydrogenase subunit G  35.44 
 
 		 672 aa  177  2e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.551845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2410  NADH dehydrogenase subunit G  32.42 
 
 		 692 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.390379  hitchhiker  0.00632886 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0526  NADH dehydrogenase subunit G  39.15 
 
 		 811 aa  177  3e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>