More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1376 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_1376  NADH dehydrogenase I chain G  100 
 
 
323 aa  672    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.034851  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7013  ferredoxin  72.7 
 
 
362 aa  495  1e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4076  ferredoxin  75.16 
 
 
334 aa  494  1e-139  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.505676  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4082  ferredoxin  68.69 
 
 
371 aa  468  1.0000000000000001e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.237691  normal  0.121556 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5104  NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit G, iron-sulphur binding protein  70.07 
 
 
361 aa  470  1.0000000000000001e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1240  ferredoxin  66.98 
 
 
342 aa  452  1.0000000000000001e-126  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2624  NADH-quinone oxidoreductase, G subunit  44.44 
 
 
782 aa  219  3.9999999999999997e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2251  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  44.44 
 
 
782 aa  219  3.9999999999999997e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000992476 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39049  predicted protein  42.46 
 
 
685 aa  219  5e-56  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0489184  normal  0.0880451 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5174  NADH dehydrogenase subunit G  40.14 
 
 
707 aa  217  2e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0827  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  40.93 
 
 
771 aa  217  2e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.342284  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3504  NADH dehydrogenase subunit G  38.24 
 
 
720 aa  217  2e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1045  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  40.57 
 
 
771 aa  216  4e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1269  NADH dehydrogenase subunit G  40.43 
 
 
716 aa  216  4e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.626778  normal  0.299354 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3250  NADH dehydrogenase subunit G  39.79 
 
 
717 aa  215  7e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.521932  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2055  NADH dehydrogenase subunit G  42.61 
 
 
808 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1430  NADH dehydrogenase subunit G  40.43 
 
 
714 aa  214  1.9999999999999998e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.718625 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1499  NADH dehydrogenase subunit G  40.28 
 
 
721 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1964  NADH dehydrogenase subunit G  41.13 
 
 
797 aa  214  1.9999999999999998e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0536465  normal  0.0616113 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0967  NADH dehydrogenase subunit G  40.14 
 
 
791 aa  212  7.999999999999999e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0699273  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1409  putative NADH dehydrogenase I chain G  38.97 
 
 
771 aa  212  7.999999999999999e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0277288 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1885  NADH dehydrogenase subunit G  40.93 
 
 
783 aa  211  9e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.441319 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2208  NADH dehydrogenase subunit G  40.93 
 
 
783 aa  211  1e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.336643 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0878  NADH dehydrogenase subunit G  40.14 
 
 
710 aa  211  1e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3629  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  42.35 
 
 
797 aa  211  1e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.192772 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0963  NADH dehydrogenase subunit G  39.79 
 
 
715 aa  211  2e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.409091  normal  0.052717 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2056  NADH dehydrogenase subunit G  39.93 
 
 
783 aa  209  4e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.81056  normal  0.0464837 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0933  NADH dehydrogenase subunit G  39.72 
 
 
790 aa  209  4e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1507  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  39.15 
 
 
770 aa  209  5e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00792374 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1748  NADH dehydrogenase subunit G  46.67 
 
 
779 aa  208  8e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2807  NADH dehydrogenase subunit G  39.36 
 
 
719 aa  208  1e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.434484  normal  0.352791 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0618  NADH dehydrogenase subunit G  41.67 
 
 
683 aa  207  1e-52  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2267  NADH dehydrogenase subunit G  38.52 
 
 
776 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.263925  normal  0.104437 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1034  NADH dehydrogenase subunit G  38.65 
 
 
776 aa  207  2e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.884498  normal  0.272009 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2160  NADH dehydrogenase subunit G  38.65 
 
 
776 aa  207  3e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.26978  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1631  NADH dehydrogenase subunit G  38.65 
 
 
776 aa  207  3e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.65954  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2243  NADH dehydrogenase subunit G  38.65 
 
 
776 aa  207  3e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1823  NADH dehydrogenase subunit G  38.65 
 
 
776 aa  206  4e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1441  NADH dehydrogenase subunit G  38.65 
 
 
776 aa  206  4e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.147964  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0731  NADH dehydrogenase subunit G  38.65 
 
 
776 aa  206  4e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1136  NADH dehydrogenase subunit G  38.65 
 
 
776 aa  206  4e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.205487  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1067  NADH dehydrogenase subunit G  38.65 
 
 
776 aa  206  4e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.149532  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2003  NADH dehydrogenase subunit G  38.43 
 
 
777 aa  206  4e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.643114  normal  0.247059 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0419  NADH dehydrogenase subunit G  38.65 
 
 
776 aa  206  4e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.701161  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1296  NADH dehydrogenase subunit G  38.65 
 
 
776 aa  206  4e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1305  NADH dehydrogenase subunit G  38.65 
 
 
776 aa  206  4e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5571  NADH dehydrogenase subunit G  38.52 
 
 
776 aa  206  5e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.199302 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2281  NADH dehydrogenase subunit G  38.65 
 
 
776 aa  206  6e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.936523  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0714  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  39.08 
 
 
798 aa  205  8e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2830  NADH dehydrogenase subunit G  41.67 
 
 
783 aa  204  1e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1097  NADH dehydrogenase subunit G  39.79 
 
 
809 aa  205  1e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2699  NADH dehydrogenase subunit G  41.67 
 
 
783 aa  204  2e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1148  NADH dehydrogenase subunit G  39.86 
 
 
784 aa  204  2e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1611  NADH dehydrogenase subunit G  40.99 
 
 
787 aa  204  2e-51  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0275  NADH dehydrogenase subunit G  41.37 
 
 
744 aa  204  2e-51  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0552  NADH dehydrogenase subunit G  40.99 
 
 
787 aa  204  2e-51  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0246  NADH dehydrogenase subunit G  41.37 
 
 
744 aa  203  3e-51  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.527407  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2559  NADH dehydrogenase subunit G  40.73 
 
 
797 aa  202  6e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.437488  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01293  NADH dehydrogenase subunit G  41.94 
 
 
739 aa  202  6e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.245708  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1561  NADH dehydrogenase subunit G  41.54 
 
 
689 aa  202  6e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0992  NADH dehydrogenase subunit G  39.51 
 
 
791 aa  202  7e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.529585  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2825  NADH dehydrogenase subunit G  41.37 
 
 
744 aa  202  8e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.266066  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0160  NADH dehydrogenase subunit G  41.18 
 
 
682 aa  201  9.999999999999999e-51  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1759  NADH dehydrogenase subunit G  40.81 
 
 
795 aa  201  1.9999999999999998e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0955  NADH dehydrogenase subunit G  38.87 
 
 
777 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.391451  normal  0.458803 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3208  NADH dehydrogenase subunit G  37.01 
 
 
777 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.453988  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1349  NADH dehydrogenase subunit G  37.01 
 
 
777 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0234349  normal  0.0108936 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1182  NADH dehydrogenase subunit G  39.13 
 
 
673 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.577988  normal  0.579246 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0053  NADH dehydrogenase subunit G  39.13 
 
 
679 aa  197  2.0000000000000003e-49  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.292666  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1303  NADH dehydrogenase subunit G  44.39 
 
 
670 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.460965  normal  0.406307 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04288  NADH-ubiquinone oxidoreductase, subunit G, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G04370)  41.09 
 
 
738 aa  196  4.0000000000000005e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.503379  normal  0.151595 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3334  NADH dehydrogenase subunit G  37.72 
 
 
689 aa  196  6e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.318541 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3220  NADH dehydrogenase subunit G  38.81 
 
 
680 aa  196  7e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0927  NADH dehydrogenase subunit G  38.81 
 
 
686 aa  194  1e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2000  NADH dehydrogenase subunit G  39.86 
 
 
671 aa  194  1e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00951952  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0823  NADH dehydrogenase subunit G  39.93 
 
 
700 aa  194  1e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.477547  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_85822  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 78K chain precursor, 5-prime end  40 
 
 
722 aa  194  2e-48  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.28905  normal  0.0501454 
 
 
-
 
NC_006684  CNB01310  NADH-ubiquinone oxidoreductase, putative  39.71 
 
 
775 aa  194  2e-48  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.754341  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0751  NADH dehydrogenase subunit G  40 
 
 
660 aa  194  2e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0442747  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1320  NADH dehydrogenase subunit G  39.51 
 
 
672 aa  193  3e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.568369  normal  0.0415953 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2237  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  40.88 
 
 
918 aa  193  3e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3389  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  41.22 
 
 
923 aa  193  4e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1361  NADH dehydrogenase subunit G  40.56 
 
 
699 aa  192  5e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.587534  normal  0.089712 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0421  NADH dehydrogenase subunit G  39.93 
 
 
683 aa  190  2.9999999999999997e-47  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2991  NADH dehydrogenase subunit G  43.81 
 
 
667 aa  189  4e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.687826 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1155  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  37.32 
 
 
823 aa  189  4e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2566  ferredoxin  36.92 
 
 
583 aa  189  5e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1958  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  38.79 
 
 
796 aa  189  5.999999999999999e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.254325  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1294  ferredoxin  37.89 
 
 
603 aa  189  5.999999999999999e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1043  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  41.41 
 
 
903 aa  189  7e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2294  NADH dehydrogenase subunit G  38.11 
 
 
669 aa  188  1e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2241  NADH dehydrogenase subunit G  37.8 
 
 
674 aa  188  1e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.242623 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1383  ferredoxin  36.56 
 
 
583 aa  187  2e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0368296  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3087  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  39.2 
 
 
913 aa  187  2e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1282  ferredoxin  36.56 
 
 
583 aa  187  2e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1183  NADH dehydrogenase subunit G  37.54 
 
 
672 aa  187  2e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.551845  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2827  NADH dehydrogenase subunit G  38.52 
 
 
686 aa  186  3e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.655346  normal  0.155123 
 
 
-
 
NC_004310  BR0808  NADH dehydrogenase subunit G  37.94 
 
 
694 aa  186  5e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0896  NADH dehydrogenase subunit G  38.52 
 
 
693 aa  186  5e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.380192  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2417  NADH dehydrogenase subunit G  38.3 
 
 
694 aa  186  6e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.163312  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>