More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5104 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_5104  NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit G, iron-sulphur binding protein  100 
 
 
361 aa  753    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4082  ferredoxin  78.89 
 
 
371 aa  571  1.0000000000000001e-162  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.237691  normal  0.121556 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4076  ferredoxin  75 
 
 
334 aa  501  1e-141  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.505676  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1376  NADH dehydrogenase I chain G  70.07 
 
 
323 aa  470  1.0000000000000001e-131  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.034851  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7013  ferredoxin  70.49 
 
 
362 aa  464  9.999999999999999e-131  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1240  ferredoxin  65.68 
 
 
342 aa  439  9.999999999999999e-123  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0618  NADH dehydrogenase subunit G  43.84 
 
 
683 aa  221  9.999999999999999e-57  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0160  NADH dehydrogenase subunit G  43.84 
 
 
682 aa  219  5e-56  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0053  NADH dehydrogenase subunit G  43.59 
 
 
679 aa  219  7.999999999999999e-56  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.292666  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1964  NADH dehydrogenase subunit G  40.93 
 
 
797 aa  216  4e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0536465  normal  0.0616113 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0927  NADH dehydrogenase subunit G  41.97 
 
 
686 aa  216  7e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3334  NADH dehydrogenase subunit G  42.81 
 
 
689 aa  214  1.9999999999999998e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.318541 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1561  NADH dehydrogenase subunit G  40.25 
 
 
689 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2559  NADH dehydrogenase subunit G  40.75 
 
 
797 aa  213  5.999999999999999e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.437488  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1303  NADH dehydrogenase subunit G  42.86 
 
 
670 aa  212  7e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.460965  normal  0.406307 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3629  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  40.06 
 
 
797 aa  211  1e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.192772 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0827  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  40 
 
 
771 aa  208  9e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.342284  normal 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39049  predicted protein  41.01 
 
 
685 aa  208  1e-52  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0489184  normal  0.0880451 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_85822  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 78K chain precursor, 5-prime end  42.6 
 
 
722 aa  208  1e-52  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.28905  normal  0.0501454 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2827  NADH dehydrogenase subunit G  42.07 
 
 
686 aa  208  1e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.655346  normal  0.155123 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2991  NADH dehydrogenase subunit G  43.24 
 
 
667 aa  208  1e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.687826 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1045  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  39.25 
 
 
771 aa  207  2e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3504  NADH dehydrogenase subunit G  36.69 
 
 
720 aa  207  2e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04288  NADH-ubiquinone oxidoreductase, subunit G, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G04370)  41.55 
 
 
738 aa  207  3e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.503379  normal  0.151595 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1182  NADH dehydrogenase subunit G  38.46 
 
 
673 aa  207  3e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.577988  normal  0.579246 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3220  NADH dehydrogenase subunit G  40.51 
 
 
680 aa  206  4e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5174  NADH dehydrogenase subunit G  40 
 
 
707 aa  206  4e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2055  NADH dehydrogenase subunit G  40.3 
 
 
808 aa  206  6e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2000  NADH dehydrogenase subunit G  40.99 
 
 
671 aa  205  8e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00951952  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0419  NADH dehydrogenase subunit G  40 
 
 
776 aa  205  9e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.701161  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1823  NADH dehydrogenase subunit G  40 
 
 
776 aa  205  9e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1441  NADH dehydrogenase subunit G  40 
 
 
776 aa  205  9e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.147964  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1136  NADH dehydrogenase subunit G  40 
 
 
776 aa  205  9e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.205487  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1305  NADH dehydrogenase subunit G  40 
 
 
776 aa  205  9e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2003  NADH dehydrogenase subunit G  39.25 
 
 
777 aa  205  9e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.643114  normal  0.247059 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1296  NADH dehydrogenase subunit G  40 
 
 
776 aa  205  9e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0731  NADH dehydrogenase subunit G  40 
 
 
776 aa  205  9e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2417  NADH dehydrogenase subunit G  40.28 
 
 
694 aa  204  1e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.163312  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0808  NADH dehydrogenase subunit G  39.93 
 
 
694 aa  205  1e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1034  NADH dehydrogenase subunit G  39.62 
 
 
776 aa  204  1e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.884498  normal  0.272009 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5571  NADH dehydrogenase subunit G  39.62 
 
 
776 aa  204  1e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.199302 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2624  NADH-quinone oxidoreductase, G subunit  42.55 
 
 
782 aa  205  1e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1269  NADH dehydrogenase subunit G  36.69 
 
 
716 aa  205  1e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.626778  normal  0.299354 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1067  NADH dehydrogenase subunit G  40 
 
 
776 aa  205  1e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.149532  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2251  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  42.55 
 
 
782 aa  205  1e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000992476 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3250  NADH dehydrogenase subunit G  38.55 
 
 
717 aa  204  1e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.521932  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1361  NADH dehydrogenase subunit G  38.91 
 
 
699 aa  205  1e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.587534  normal  0.089712 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1759  NADH dehydrogenase subunit G  38.41 
 
 
795 aa  204  2e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0878  NADH dehydrogenase subunit G  37.01 
 
 
710 aa  204  2e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0421  NADH dehydrogenase subunit G  44.17 
 
 
683 aa  204  2e-51  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2267  NADH dehydrogenase subunit G  39.62 
 
 
776 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.263925  normal  0.104437 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2294  NADH dehydrogenase subunit G  42.08 
 
 
669 aa  204  2e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1631  NADH dehydrogenase subunit G  39.62 
 
 
776 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.65954  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2281  NADH dehydrogenase subunit G  39.62 
 
 
776 aa  204  2e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.936523  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2243  NADH dehydrogenase subunit G  39.62 
 
 
776 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1409  putative NADH dehydrogenase I chain G  39.25 
 
 
771 aa  204  2e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0277288 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1430  NADH dehydrogenase subunit G  39.25 
 
 
714 aa  204  2e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.718625 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2160  NADH dehydrogenase subunit G  39.62 
 
 
776 aa  204  2e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.26978  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0784  NADH dehydrogenase subunit G  40.28 
 
 
689 aa  204  2e-51  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.00939613  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0803  NADH dehydrogenase subunit G  39.93 
 
 
694 aa  203  3e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.727429  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0963  NADH dehydrogenase subunit G  36.69 
 
 
715 aa  203  4e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.409091  normal  0.052717 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1267  NADH dehydrogenase subunit G  41.7 
 
 
693 aa  203  4e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.555052  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1359  NADH dehydrogenase subunit G  41.34 
 
 
693 aa  202  6e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.113832  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB01310  NADH-ubiquinone oxidoreductase, putative  41.88 
 
 
775 aa  202  9.999999999999999e-51  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.754341  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0896  NADH dehydrogenase subunit G  34.68 
 
 
693 aa  201  9.999999999999999e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.380192  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1499  NADH dehydrogenase subunit G  38.87 
 
 
721 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3208  NADH dehydrogenase subunit G  38.49 
 
 
777 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.453988  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1028  NADH dehydrogenase subunit G  40.99 
 
 
693 aa  202  9.999999999999999e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1320  NADH dehydrogenase subunit G  40.28 
 
 
672 aa  201  9.999999999999999e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.568369  normal  0.0415953 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1349  NADH dehydrogenase subunit G  38.49 
 
 
777 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0234349  normal  0.0108936 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1885  NADH dehydrogenase subunit G  39.62 
 
 
783 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.441319 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2208  NADH dehydrogenase subunit G  39.62 
 
 
783 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.336643 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2580  NADH dehydrogenase subunit G  40.78 
 
 
691 aa  200  3e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.105022  normal  0.257392 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1507  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  38.49 
 
 
770 aa  200  3e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00792374 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4555  NADH dehydrogenase subunit G  37.98 
 
 
689 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.217608 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2879  NADH dehydrogenase subunit G  35.11 
 
 
691 aa  200  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.644938  normal  0.120527 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1720  NADH dehydrogenase subunit G  40.64 
 
 
693 aa  199  5e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0967  NADH dehydrogenase subunit G  38.57 
 
 
791 aa  199  6e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0699273  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3292  NADH dehydrogenase subunit G  40.78 
 
 
691 aa  199  6e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.995096  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2056  NADH dehydrogenase subunit G  38.87 
 
 
783 aa  199  7e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.81056  normal  0.0464837 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1148  NADH dehydrogenase subunit G  39.23 
 
 
784 aa  199  9e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0992  NADH dehydrogenase subunit G  40.68 
 
 
791 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.529585  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1748  NADH dehydrogenase subunit G  38.46 
 
 
779 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2410  NADH dehydrogenase subunit G  37.09 
 
 
692 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.390379  hitchhiker  0.00632886 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4627  NADH dehydrogenase subunit G  39.93 
 
 
692 aa  196  4.0000000000000005e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.105521 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0714  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  38.79 
 
 
798 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2241  NADH dehydrogenase subunit G  39.58 
 
 
674 aa  196  4.0000000000000005e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.242623 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1611  NADH dehydrogenase subunit G  39.79 
 
 
787 aa  196  5.000000000000001e-49  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0552  NADH dehydrogenase subunit G  39.79 
 
 
787 aa  196  5.000000000000001e-49  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2237  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  40.43 
 
 
918 aa  194  1e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0933  NADH dehydrogenase subunit G  38.11 
 
 
790 aa  195  1e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0751  NADH dehydrogenase subunit G  38.52 
 
 
660 aa  195  1e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0442747  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3439  NADH dehydrogenase subunit G  39.36 
 
 
677 aa  194  2e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0955  NADH dehydrogenase subunit G  38.93 
 
 
777 aa  194  2e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.391451  normal  0.458803 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1881  NADH dehydrogenase subunit G  40.07 
 
 
691 aa  194  2e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.296161 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3389  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  40.12 
 
 
923 aa  194  2e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2924  NADH dehydrogenase subunit G  39.36 
 
 
687 aa  193  3e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1097  NADH dehydrogenase subunit G  37.91 
 
 
809 aa  194  3e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2807  NADH dehydrogenase subunit G  38.17 
 
 
719 aa  194  3e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.434484  normal  0.352791 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01293  NADH dehydrogenase subunit G  41.2 
 
 
739 aa  193  5e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.245708  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>