More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0729 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0729  ferredoxin  100 
 
 
628 aa  1281    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0424  ferredoxin  37.21 
 
 
622 aa  400  9.999999999999999e-111  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0344  NADH dehydrogenase I, G subunit, putative  34.23 
 
 
826 aa  226  1e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3349  NADH dehydrogenase I, G subunit, putative  28.04 
 
 
828 aa  224  3e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.407234  normal  0.217544 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1538  molybdopterin oxidoreductase  32.5 
 
 
879 aa  223  9.999999999999999e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4238  molybdopterin oxidoreductase  34.38 
 
 
828 aa  219  2e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3132  molybdopterin oxidoreductase  32.84 
 
 
815 aa  216  9e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3617  molybdopterin oxidoreductase  30.75 
 
 
850 aa  207  4e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3920  molybdopterin oxidoreductase  32.6 
 
 
821 aa  204  3e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.403816  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4004  molybdopterin oxidoreductase  32.84 
 
 
821 aa  203  7e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.08061e-23 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0661  molybdopterin oxidoreductase  34.55 
 
 
808 aa  202  1.9999999999999998e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3629  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  33.96 
 
 
797 aa  200  6e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.192772 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0509  Fe(III) reductase, alpha subunit  29.98 
 
 
844 aa  197  6e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3639  molybdopterin oxidoreductase  30.02 
 
 
843 aa  195  2e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.424964  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0660  molybdopterin oxidoreductase  25.63 
 
 
822 aa  193  7e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.672989  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3022  Fe(III) reductase, alpha subunit  33.24 
 
 
831 aa  192  1e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3507  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.01 
 
 
893 aa  192  1e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0673  molybdopterin oxidoreductase  32.73 
 
 
822 aa  187  4e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01358e-20 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0835  anaerobic dehydrogenase  37.5 
 
 
305 aa  187  7e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1361  NADH dehydrogenase subunit G  26.37 
 
 
699 aa  185  2.0000000000000003e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.587534  normal  0.089712 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1561  NADH dehydrogenase subunit G  28.44 
 
 
689 aa  184  4.0000000000000006e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0100  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.82 
 
 
893 aa  183  8.000000000000001e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000102152  hitchhiker  0.000000000000206048 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1309  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  28.19 
 
 
788 aa  182  2e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1856  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  33.87 
 
 
351 aa  181  4.999999999999999e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3503  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.25 
 
 
900 aa  180  7e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0160  NADH dehydrogenase subunit G  26.1 
 
 
682 aa  179  1e-43  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0156  formate dehydrogenase, alpha subunit  29.78 
 
 
898 aa  179  1e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1398  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.52 
 
 
893 aa  179  2e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3334  NADH dehydrogenase subunit G  24.96 
 
 
689 aa  179  2e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.318541 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0927  NADH dehydrogenase subunit G  31.04 
 
 
686 aa  178  3e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0704  formate dehydrogenase, alpha subunit  29.74 
 
 
900 aa  177  5e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3220  NADH dehydrogenase subunit G  31.02 
 
 
680 aa  177  7e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0784  NADH dehydrogenase subunit G  27.82 
 
 
689 aa  177  7e-43  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.00939613  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0808  NADH dehydrogenase subunit G  25.8 
 
 
694 aa  176  9.999999999999999e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3087  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  33.71 
 
 
913 aa  176  9.999999999999999e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0618  NADH dehydrogenase subunit G  26.54 
 
 
683 aa  176  9.999999999999999e-43  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2294  NADH dehydrogenase subunit G  25.38 
 
 
669 aa  175  1.9999999999999998e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2417  NADH dehydrogenase subunit G  25.63 
 
 
694 aa  176  1.9999999999999998e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.163312  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2312  formate dehydrogenase subunit alpha  29.36 
 
 
899 aa  174  2.9999999999999996e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0941024  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3504  ferredoxin  40.34 
 
 
312 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0803  NADH dehydrogenase subunit G  25.8 
 
 
694 aa  174  5e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.727429  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2991  NADH dehydrogenase subunit G  24.7 
 
 
667 aa  173  7.999999999999999e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.687826 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1043  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  33.13 
 
 
903 aa  173  1e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0421  NADH dehydrogenase subunit G  25.37 
 
 
683 aa  172  2e-41  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1823  NADH dehydrogenase subunit G  25.9 
 
 
750 aa  172  2e-41  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.427089  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_85822  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 78K chain precursor, 5-prime end  29.11 
 
 
722 aa  172  2e-41  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.28905  normal  0.0501454 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39049  predicted protein  31.82 
 
 
685 aa  172  2e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0489184  normal  0.0880451 
 
 
-
 
NC_006684  CNB01310  NADH-ubiquinone oxidoreductase, putative  33.22 
 
 
775 aa  171  3e-41  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.754341  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1303  NADH dehydrogenase subunit G  25.97 
 
 
670 aa  170  9e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.460965  normal  0.406307 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1831  NADH dehydrogenase I chain G  32.68 
 
 
363 aa  170  9e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2825  NADH dehydrogenase subunit G  39.19 
 
 
744 aa  169  1e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.266066  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04288  NADH-ubiquinone oxidoreductase, subunit G, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G04370)  31.56 
 
 
738 aa  168  2e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.503379  normal  0.151595 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1148  NADH dehydrogenase subunit G  32.12 
 
 
784 aa  168  2e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4517  NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit G, iron- sulphur binding protein  31.52 
 
 
539 aa  168  2.9999999999999998e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.594649  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2624  NADH-quinone oxidoreductase, G subunit  33.44 
 
 
782 aa  167  5e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2251  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  33.44 
 
 
782 aa  167  5e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000992476 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1885  NADH dehydrogenase subunit G  30.32 
 
 
783 aa  167  5e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.441319 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2208  NADH dehydrogenase subunit G  30.32 
 
 
783 aa  167  5.9999999999999996e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.336643 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0785  NADH dehydrogenase I chain G  31.48 
 
 
353 aa  167  5.9999999999999996e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3777  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulphur binding, conserved site  34.38 
 
 
310 aa  167  6.9999999999999995e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000710786  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01293  NADH dehydrogenase subunit G  31.27 
 
 
739 aa  166  9e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.245708  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0967  NADH dehydrogenase subunit G  29.45 
 
 
791 aa  166  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0699273  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1881  NADH dehydrogenase subunit G  28.86 
 
 
691 aa  166  1.0000000000000001e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.296161 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0933  NADH dehydrogenase subunit G  29.45 
 
 
790 aa  166  1.0000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2056  NADH dehydrogenase subunit G  30.03 
 
 
783 aa  166  2.0000000000000002e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.81056  normal  0.0464837 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1097  NADH dehydrogenase subunit G  32.39 
 
 
809 aa  165  2.0000000000000002e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0386  formate dehydrogenase, alpha subunit  29.37 
 
 
917 aa  165  2.0000000000000002e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.118073  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0480  ferredoxin  35.16 
 
 
628 aa  165  2.0000000000000002e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.257942 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1045  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  27.66 
 
 
771 aa  164  3e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3389  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  30.37 
 
 
923 aa  164  3e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0334  NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit G, iron-sulphur binding protein  30.74 
 
 
826 aa  165  3e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0246  NADH dehydrogenase subunit G  38.74 
 
 
744 aa  164  5.0000000000000005e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.527407  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3509  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.94 
 
 
905 aa  164  5.0000000000000005e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.434543  normal  0.526227 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7685  NADH dehydrogenase subunit G  30.15 
 
 
839 aa  163  8.000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0714  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  31.38 
 
 
798 aa  163  8.000000000000001e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2214  NADH dehydrogenase subunit G  28.61 
 
 
691 aa  163  8.000000000000001e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0275  NADH dehydrogenase subunit G  39.19 
 
 
744 aa  163  9e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1349  NADH dehydrogenase subunit G  22.27 
 
 
777 aa  162  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0234349  normal  0.0108936 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2410  NADH dehydrogenase subunit G  31.91 
 
 
692 aa  162  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.390379  hitchhiker  0.00632886 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2237  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  29.74 
 
 
918 aa  162  2e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1720  NADH dehydrogenase subunit G  30.55 
 
 
693 aa  162  2e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3208  NADH dehydrogenase subunit G  22.51 
 
 
777 aa  162  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.453988  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0369  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  24.42 
 
 
833 aa  162  2e-38  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.55399  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0992  NADH dehydrogenase subunit G  30.09 
 
 
791 aa  162  2e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.529585  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0823  NADH dehydrogenase subunit G  28.15 
 
 
700 aa  161  3e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.477547  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1611  ferredoxin  30.08 
 
 
560 aa  161  3e-38  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.972775 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1964  NADH dehydrogenase subunit G  29.74 
 
 
797 aa  161  3e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0536465  normal  0.0616113 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2827  NADH dehydrogenase subunit G  31.85 
 
 
686 aa  161  3e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.655346  normal  0.155123 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5174  NADH dehydrogenase subunit G  30.47 
 
 
707 aa  160  5e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3504  NADH dehydrogenase subunit G  28.01 
 
 
720 aa  160  5e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0827  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  28.85 
 
 
771 aa  160  5e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.342284  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0751  NADH dehydrogenase subunit G  26.44 
 
 
660 aa  160  5e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0442747  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1269  NADH dehydrogenase subunit G  30.38 
 
 
716 aa  160  6e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.626778  normal  0.299354 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2055  NADH dehydrogenase subunit G  30.67 
 
 
808 aa  160  7e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0963  NADH dehydrogenase subunit G  28.86 
 
 
715 aa  160  7e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.409091  normal  0.052717 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0896  NADH dehydrogenase subunit G  25 
 
 
693 aa  160  7e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.380192  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2807  NADH dehydrogenase subunit G  26.45 
 
 
719 aa  160  8e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.434484  normal  0.352791 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2879  NADH dehydrogenase subunit G  36.58 
 
 
691 aa  160  8e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.644938  normal  0.120527 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2705  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  30.26 
 
 
355 aa  160  8e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.223751 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0162  NADH-quinone oxidoreductase, g subunit  36.33 
 
 
464 aa  160  8e-38  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>