More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_4120 on replicon NC_013744
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013744  Htur_4120  NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit G, iron- sulphur binding protein  100 
 
 
320 aa  651    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1038  formate dehydrogenase, alpha subunit  64.16 
 
 
1130 aa  373  1e-102  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4160  formate dehydrogenase, alpha subunit  64.31 
 
 
1110 aa  369  1e-101  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.129392  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4746  formate dehydrogenase, alpha subunit  65.95 
 
 
1111 aa  367  1e-100  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.879601  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4406  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.34 
 
 
950 aa  157  3e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4869  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.34 
 
 
950 aa  157  3e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0187329 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4998  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.51 
 
 
953 aa  156  4e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.217845  hitchhiker  0.000835215 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3710  NAD-dependent formate dehydrogenase alpha subunit  40.35 
 
 
977 aa  155  1e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.749683  normal  0.699855 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4914  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.68 
 
 
950 aa  155  1e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.263268 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0031  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.73 
 
 
1000 aa  154  2e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0255  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.83 
 
 
952 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0971632  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0389  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.18 
 
 
944 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3019  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.91 
 
 
957 aa  150  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0720  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.07 
 
 
949 aa  149  6e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0805  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.05 
 
 
948 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.624345  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4024  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.07 
 
 
966 aa  147  2.0000000000000003e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2750  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.67 
 
 
969 aa  147  2.0000000000000003e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0453604 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1781  hydrogenase, Fe-only  36.41 
 
 
578 aa  147  3e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0724  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.82 
 
 
948 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.696908  normal  0.792249 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2383  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.55 
 
 
959 aa  146  4.0000000000000006e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4097  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.65 
 
 
959 aa  146  5e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0727  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.84 
 
 
979 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0216931  normal  0.398444 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3012  NAD-dependent formate dehydrogenase alpha subunit  39.27 
 
 
984 aa  144  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.467116  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2902  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.73 
 
 
984 aa  145  1e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.679741  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3520  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.65 
 
 
904 aa  144  1e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0623  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.39 
 
 
948 aa  145  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.816724  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0843  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.19 
 
 
994 aa  145  1e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0967  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.27 
 
 
984 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0450  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.27 
 
 
984 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.858013  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2964  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.27 
 
 
984 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2595  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.27 
 
 
984 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.619743  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0180  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.27 
 
 
984 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1925  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.14 
 
 
986 aa  143  3e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2856  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.18 
 
 
959 aa  144  3e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0895  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.73 
 
 
983 aa  143  3e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.99873  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3023  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.07 
 
 
982 aa  143  4e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0162015  normal  0.0152175 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1622  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.6 
 
 
984 aa  143  4e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.437101  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0964  NAD-dependent formate dehydrogenase, alpha subunit  39.07 
 
 
982 aa  143  4e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.133867  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1856  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  38.53 
 
 
351 aa  143  4e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0907  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.73 
 
 
983 aa  143  4e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.979482  decreased coverage  0.00925571 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2366  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.73 
 
 
983 aa  143  4e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.739285 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0619  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.5 
 
 
956 aa  142  5e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.961077  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4645  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.97 
 
 
948 aa  142  7e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3479  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.68 
 
 
946 aa  142  9e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.389807 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0839  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.02 
 
 
946 aa  142  9.999999999999999e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.331727  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0990  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.19 
 
 
951 aa  141  9.999999999999999e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4144  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.27 
 
 
983 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.110494  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0990  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.27 
 
 
983 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.656443 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1888  ferredoxin  39.63 
 
 
307 aa  141  9.999999999999999e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0552  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.27 
 
 
983 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.918724  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1473  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.91 
 
 
947 aa  141  9.999999999999999e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0442327  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1031  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.27 
 
 
983 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.52357  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3089  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.17 
 
 
959 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.440267  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2232  hydrogenase, Fe-only  37.85 
 
 
582 aa  141  1.9999999999999998e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1391  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.05 
 
 
947 aa  140  3e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0835  anaerobic dehydrogenase  38.81 
 
 
305 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2705  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  35.78 
 
 
355 aa  140  3.9999999999999997e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.223751 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00220  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.71 
 
 
906 aa  139  4.999999999999999e-32  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0797991 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2897  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.84 
 
 
959 aa  139  6e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.30865  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1085  hydrogenase, Fe-only  36.24 
 
 
577 aa  139  6e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0100  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.88 
 
 
893 aa  138  1e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000102152  hitchhiker  0.000000000000206048 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1861  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.03 
 
 
978 aa  138  1e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3503  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.61 
 
 
900 aa  138  1e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0785  NADH dehydrogenase I chain G  37.26 
 
 
353 aa  138  1e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2185  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.05 
 
 
960 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.602321  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1605  NAD-reducing iron-only hydrogenase large subunit  39.46 
 
 
585 aa  137  2e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3656  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.71 
 
 
948 aa  137  2e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.480327 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3552  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.05 
 
 
960 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1708  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.74 
 
 
959 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2138  hydrogenase, Fe-only  35.48 
 
 
581 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000865974  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2274  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.05 
 
 
956 aa  137  3.0000000000000003e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.217783 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01810  NADH dehydrogenase I subunit G  34.58 
 
 
666 aa  136  5e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000616939  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2684  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.44 
 
 
951 aa  136  5e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.801873  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1299  hydrogenase, Fe-only  36.17 
 
 
579 aa  135  7.000000000000001e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.130328  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3636  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.63 
 
 
959 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.234983 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3601  hydrogenase, Fe-only  37.16 
 
 
587 aa  135  8e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1809  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.61 
 
 
960 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.550904  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2741  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.32 
 
 
960 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.313061 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2853  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.32 
 
 
960 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.771386 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3290  hydrogenases, Fe-only  38.99 
 
 
594 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0152  hydrogenase, Fe-only  35.63 
 
 
580 aa  134  1.9999999999999998e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4113  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.02 
 
 
901 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.163208  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0156  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.82 
 
 
898 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2058  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.5 
 
 
967 aa  134  3e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.896651  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3507  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.21 
 
 
893 aa  133  3e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0625  hydrogenase, Fe-only  35.75 
 
 
587 aa  133  3.9999999999999996e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000144729  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2312  formate dehydrogenase subunit alpha  35.48 
 
 
899 aa  133  3.9999999999999996e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0941024  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2558  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.52 
 
 
973 aa  133  3.9999999999999996e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.779669  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0555  formate dehydrogenase subunit alpha  37.67 
 
 
957 aa  133  3.9999999999999996e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.185124  normal  0.358497 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1783  hydrogenase, Fe-only  33.8 
 
 
583 aa  133  3.9999999999999996e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3925  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.82 
 
 
959 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.287134  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0704  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.62 
 
 
900 aa  133  5e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1080  NAD-dependent formate dehydrogenase, alpha subunit  34.89 
 
 
960 aa  133  5e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0342  hydrogenase, Fe-only  37.04 
 
 
582 aa  132  6e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3509  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.44 
 
 
905 aa  132  6.999999999999999e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.434543  normal  0.526227 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0334  NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit G, iron-sulphur binding protein  39.07 
 
 
826 aa  132  7.999999999999999e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1633  NAD-reducing iron-only hydrogenase large subunit  37.9 
 
 
585 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000469619  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2303  hydrogenase, Fe-only  34.55 
 
 
562 aa  132  1.0000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0735  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.11 
 
 
952 aa  131  1.0000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0030  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  36.89 
 
 
359 aa  131  1.0000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00062453  normal  0.73393 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>