More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_0076 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_0076  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulphur binding, conserved site  100 
 
 
559 aa  1140    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.75307  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2100  ferredoxin  28.64 
 
 
609 aa  255  1.0000000000000001e-66  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.624892  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3509  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.33 
 
 
905 aa  224  2e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.434543  normal  0.526227 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0030  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  37.5 
 
 
359 aa  217  5e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00062453  normal  0.73393 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2705  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  38.03 
 
 
355 aa  209  9e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.223751 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2312  formate dehydrogenase subunit alpha  38.66 
 
 
899 aa  204  3e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0941024  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0156  formate dehydrogenase, alpha subunit  29.1 
 
 
898 aa  201  3e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1398  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.51 
 
 
893 aa  199  7.999999999999999e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0704  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.95 
 
 
900 aa  199  2.0000000000000003e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1888  ferredoxin  38.84 
 
 
307 aa  193  8e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1831  NADH dehydrogenase I chain G  36.84 
 
 
363 aa  192  2e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1111  bidirectional hydrogenase complex protein HoxU  42.72 
 
 
238 aa  190  5e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.592876  normal  0.501453 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1856  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  35.69 
 
 
351 aa  190  5.999999999999999e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3541  bidirectional hydrogenase complex protein HoxU  44.44 
 
 
235 aa  189  1e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3507  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.6 
 
 
893 aa  188  2e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0167  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.47 
 
 
886 aa  189  2e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0530728  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0100  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.69 
 
 
893 aa  187  3e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000102152  hitchhiker  0.000000000000206048 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1029  NADH dehydrogenase I chain G  35.69 
 
 
358 aa  187  5e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0386  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.2 
 
 
917 aa  187  6e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.118073  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1366  bidirectional hydrogenase complex protein HoxU  43.52 
 
 
235 aa  186  9e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2750  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.6 
 
 
969 aa  184  3e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0453604 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4051  bidirectional hydrogenase complex protein HoxU  42.79 
 
 
238 aa  184  5.0000000000000004e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0848168 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0031  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.05 
 
 
1000 aa  183  6e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2714  bidirectional hydrogenase complex protein HoxU  41.52 
 
 
239 aa  183  7e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2478  bidirectional hydrogenase complex protein HoxU  41.96 
 
 
235 aa  181  2e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0927823  normal  0.689692 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2720  bidirectional hydrogenase complex protein HoxU  40.53 
 
 
238 aa  180  4.999999999999999e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1861  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.98 
 
 
978 aa  180  4.999999999999999e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4164  bidirectional hydrogenase complex protein HoxU  44.08 
 
 
238 aa  180  5.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3504  ferredoxin  36.93 
 
 
312 aa  179  1e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3503  formate dehydrogenase, alpha subunit  26.44 
 
 
900 aa  179  1e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0785  NADH dehydrogenase I chain G  29.2 
 
 
353 aa  179  1e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3019  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.56 
 
 
957 aa  177  4e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3710  NAD-dependent formate dehydrogenase alpha subunit  33.1 
 
 
977 aa  176  8e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.749683  normal  0.699855 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0344  NADH dehydrogenase I, G subunit, putative  30.77 
 
 
826 aa  176  9.999999999999999e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0334  NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit G, iron-sulphur binding protein  33.13 
 
 
826 aa  176  9.999999999999999e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2793  bidirectional hydrogenase complex protein HoxU  40.38 
 
 
240 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30068  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2138  hydrogenase, Fe-only  41.63 
 
 
581 aa  175  1.9999999999999998e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000865974  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3023  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.81 
 
 
982 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0162015  normal  0.0152175 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0964  NAD-dependent formate dehydrogenase, alpha subunit  28.57 
 
 
982 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.133867  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0389  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.84 
 
 
944 aa  174  5.999999999999999e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2557  bidirectional hydrogenase complex protein HoxU  41.31 
 
 
238 aa  173  6.999999999999999e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.379328  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0097  bidirectional hydrogenase complex protein HoxU  39.34 
 
 
238 aa  172  1e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2249  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.45 
 
 
903 aa  172  1e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.580662  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0172  hydrogenase, Fe-only  38.28 
 
 
573 aa  172  1e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0727  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.62 
 
 
979 aa  172  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0216931  normal  0.398444 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3777  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulphur binding, conserved site  36.63 
 
 
310 aa  172  2e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000710786  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0094  bidirectional hydrogenase complex protein HoxU  39.34 
 
 
238 aa  172  2e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.604003 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2383  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.1 
 
 
959 aa  172  2e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4657  bidirectional hydrogenase complex protein HoxU  41.23 
 
 
238 aa  172  2e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00220  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.64 
 
 
906 aa  171  3e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0797991 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0845  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  30.49 
 
 
376 aa  170  5e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3617  molybdopterin oxidoreductase  33.33 
 
 
850 aa  170  8e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0808  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.7 
 
 
879 aa  169  1e-40  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1622  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.1 
 
 
984 aa  169  2e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.437101  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0673  molybdopterin oxidoreductase  26.61 
 
 
822 aa  168  2.9999999999999998e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01358e-20 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2595  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.1 
 
 
984 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.619743  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0450  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.1 
 
 
984 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.858013  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3012  NAD-dependent formate dehydrogenase alpha subunit  28.1 
 
 
984 aa  167  6.9999999999999995e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.467116  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4113  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.28 
 
 
901 aa  166  6.9999999999999995e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.163208  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0967  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.1 
 
 
984 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0180  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.1 
 
 
984 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2902  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.86 
 
 
984 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.679741  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3805  hydrogenase, Fe-only  39.15 
 
 
582 aa  166  1.0000000000000001e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2964  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.1 
 
 
984 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0660  molybdopterin oxidoreductase  26.18 
 
 
822 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.672989  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2366  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.66 
 
 
983 aa  164  3e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.739285 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3132  molybdopterin oxidoreductase  30.77 
 
 
815 aa  164  3e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06330  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 75 kDa subunit  37.38 
 
 
578 aa  164  4.0000000000000004e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00021405  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0895  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.38 
 
 
983 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.99873  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3639  molybdopterin oxidoreductase  27.49 
 
 
843 aa  164  4.0000000000000004e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.424964  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3520  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.53 
 
 
904 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1538  molybdopterin oxidoreductase  30.03 
 
 
879 aa  164  5.0000000000000005e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3089  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.19 
 
 
959 aa  164  5.0000000000000005e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.440267  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0625  hydrogenase, Fe-only  37.67 
 
 
587 aa  163  6e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000144729  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0907  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.38 
 
 
983 aa  163  7e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.979482  decreased coverage  0.00925571 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2856  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.52 
 
 
959 aa  163  8.000000000000001e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1309  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  23.9 
 
 
788 aa  163  9e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0990  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.16 
 
 
951 aa  163  9e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0255  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.19 
 
 
952 aa  162  1e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0971632  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4024  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.03 
 
 
966 aa  163  1e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4238  molybdopterin oxidoreductase  29.82 
 
 
828 aa  162  2e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4869  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.86 
 
 
950 aa  162  2e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0187329 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4914  formate dehydrogenase, alpha subunit  26.28 
 
 
950 aa  162  2e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.263268 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4406  formate dehydrogenase, alpha subunit  29.43 
 
 
950 aa  162  2e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0424  ferredoxin  26.43 
 
 
622 aa  162  2e-38  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3656  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.79 
 
 
948 aa  161  3e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.480327 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0555  formate dehydrogenase subunit alpha  25.33 
 
 
957 aa  161  3e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.185124  normal  0.358497 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01810  NADH dehydrogenase I subunit G  38.61 
 
 
666 aa  160  4e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000616939  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4144  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.14 
 
 
983 aa  160  4e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.110494  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2853  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.54 
 
 
960 aa  160  4e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.771386 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2741  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.54 
 
 
960 aa  160  5e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.313061 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0552  formate dehydrogenase, alpha subunit  26.9 
 
 
983 aa  160  5e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.918724  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1031  formate dehydrogenase, alpha subunit  26.9 
 
 
983 aa  160  5e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.52357  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0661  molybdopterin oxidoreductase  25.43 
 
 
808 aa  160  6e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1080  NAD-dependent formate dehydrogenase, alpha subunit  32.54 
 
 
960 aa  160  7e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0990  formate dehydrogenase, alpha subunit  26.9 
 
 
983 aa  160  8e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.656443 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2058  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.28 
 
 
967 aa  159  1e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.896651  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3349  NADH dehydrogenase I, G subunit, putative  29.82 
 
 
828 aa  159  1e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.407234  normal  0.217544 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4645  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.15 
 
 
948 aa  159  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2897  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.23 
 
 
959 aa  159  1e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.30865  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>