More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_1126 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_5186  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  90.55 
 
 
383 aa  709    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1126  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  100 
 
 
383 aa  783    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.251236  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1791  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  75.2 
 
 
388 aa  587  1e-167  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.940519 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4959  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  75.2 
 
 
381 aa  585  1e-166  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.446104 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4784  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  74.54 
 
 
404 aa  574  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.873877  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4490  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  74.27 
 
 
404 aa  572  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.274729  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4403  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  74.27 
 
 
404 aa  572  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0269703  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3707  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  71.81 
 
 
395 aa  556  1e-157  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2275  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  50.53 
 
 
401 aa  384  1e-105  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.559073 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5571  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  48.02 
 
 
415 aa  365  1e-99  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5037  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  47.52 
 
 
398 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0608  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  47.52 
 
 
398 aa  357  2.9999999999999997e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0237  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  46.44 
 
 
419 aa  334  1e-90  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4564  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  47 
 
 
403 aa  328  8e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.419878  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3863  Formyl-CoA transferase  47.63 
 
 
426 aa  326  3e-88  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.859373  normal  0.485093 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6841  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  45 
 
 
417 aa  323  2e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3315  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  43.65 
 
 
403 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4071  putative formyl-CoA transferases/L-carnitine dehydratase  44.97 
 
 
391 aa  322  9.999999999999999e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0818051  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2104  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  44.18 
 
 
404 aa  320  3e-86  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0421788  normal  0.0185484 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3560  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  45.29 
 
 
407 aa  319  5e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0058  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  45.24 
 
 
398 aa  318  9e-86  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4713  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  44.5 
 
 
408 aa  313  2.9999999999999996e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3262  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  45.95 
 
 
423 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.436186  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5362  putative CoA-transferase  45.41 
 
 
403 aa  313  4.999999999999999e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.360586  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1135  Formyl-CoA transferase  44.33 
 
 
424 aa  311  7.999999999999999e-84  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.923521  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1038  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  43.6 
 
 
394 aa  310  2e-83  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3953  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  43.12 
 
 
400 aa  309  4e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.15496  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4518  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  44.81 
 
 
385 aa  307  2.0000000000000002e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3565  putative Formyl-CoA transferase  42.63 
 
 
401 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7488  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  42.48 
 
 
406 aa  306  3e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.800783  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2995  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  45.62 
 
 
398 aa  303  3.0000000000000004e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.233271  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0178  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  43.64 
 
 
432 aa  303  5.000000000000001e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.207633 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4617  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  42.78 
 
 
388 aa  302  7.000000000000001e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.629332  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1334  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  44.44 
 
 
421 aa  298  1e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000214497 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3673  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  43.16 
 
 
473 aa  297  2e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.653273  normal  0.0775315 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0077  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  41.11 
 
 
409 aa  294  1e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4224  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  45.24 
 
 
384 aa  295  1e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0326799  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2058  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  42.71 
 
 
413 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3797  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  45.74 
 
 
404 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3999  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  41.38 
 
 
397 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1195  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  44.18 
 
 
389 aa  273  3e-72  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0445  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  40.2 
 
 
405 aa  270  5e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.225942  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2501  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  39.36 
 
 
390 aa  262  6.999999999999999e-69  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0195  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  38.92 
 
 
401 aa  239  5.999999999999999e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.111208  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0818  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  37.53 
 
 
409 aa  224  2e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0683  Formyl-CoA transferase  37.37 
 
 
416 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.521571  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0034  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  35.48 
 
 
409 aa  220  3.9999999999999997e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0222  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  40.48 
 
 
406 aa  219  5e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2408  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  35.77 
 
 
418 aa  219  6e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2980  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  35.52 
 
 
418 aa  218  2e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5625  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  36.84 
 
 
415 aa  216  4e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.344287  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2971  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  37.47 
 
 
419 aa  216  5e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.315436  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1077  CAIB/BAIF family protein  34.63 
 
 
420 aa  216  5e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.674108  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0039  Formyl-CoA transferase  35.13 
 
 
406 aa  216  5e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2206  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  34.81 
 
 
415 aa  216  5.9999999999999996e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0738352 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6435  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  35.03 
 
 
415 aa  216  7e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00145178 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0244  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  35.92 
 
 
395 aa  215  9e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0151  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  35.15 
 
 
450 aa  214  9.999999999999999e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0133  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  34.9 
 
 
428 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4672  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  35.7 
 
 
393 aa  213  4.9999999999999996e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00203708  normal  0.032071 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0047  Formyl-CoA transferase  34.87 
 
 
412 aa  212  7.999999999999999e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.386629  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1814  CAIB/BAIF family protein  35.52 
 
 
544 aa  211  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00543882  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2662  CAIB/BAIF family protein  35.53 
 
 
406 aa  211  2e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0000146578  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4069  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  33.66 
 
 
426 aa  211  2e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0894  CAIB/BAIF family protein  35.52 
 
 
577 aa  211  3e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.846716  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0849  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  33.5 
 
 
433 aa  210  3e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5748  Formyl-CoA transferase  34.74 
 
 
397 aa  210  3e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3808  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  34.42 
 
 
430 aa  210  3e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1422  CAIB/BAIF family protein  35.52 
 
 
568 aa  211  3e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.498676  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5909  L-carnitine dehydratase  35.46 
 
 
383 aa  209  5e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2169  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  34.02 
 
 
381 aa  209  6e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3286  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  34.65 
 
 
401 aa  209  6e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0456  CAIB/BAIF family protein  35.53 
 
 
406 aa  209  6e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.367298  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0704  CAIB/BAIF family protein  35.53 
 
 
406 aa  209  6e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.504433  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1658  CAIB/BAIF family protein  35.53 
 
 
406 aa  209  6e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0837995  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2484  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  34.02 
 
 
407 aa  209  7e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0601081  normal  0.0181338 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1635  CAIB/BAIF family protein  35.53 
 
 
406 aa  209  7e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0382163  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10503  conserved hypothetical protein  33.33 
 
 
442 aa  207  2e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0354311  normal  0.124736 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0173  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  33.25 
 
 
433 aa  207  2e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3421  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  34.95 
 
 
416 aa  207  2e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0846  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  34.1 
 
 
415 aa  207  3e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1038  Alpha-methylacyl-CoA racemase  35.19 
 
 
413 aa  207  3e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000337447  normal  0.997405 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0057  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  34.92 
 
 
415 aa  207  4e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3087  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  35.34 
 
 
411 aa  206  5e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0176  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  35.93 
 
 
406 aa  206  6e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000247826  normal  0.235552 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2624  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  34.96 
 
 
399 aa  206  7e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3621  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  32.98 
 
 
388 aa  205  8e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6417  Formyl-CoA transferase  32.32 
 
 
418 aa  205  1e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.478883  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0119  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  33.25 
 
 
413 aa  204  1e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.391223  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0159  CAIB/BAIF family protein  35.93 
 
 
406 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  unclonable  0.0000839359  hitchhiker  0.0000973372 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0706  Alpha-methylacyl-CoA racemase  34.54 
 
 
395 aa  204  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.848354  normal  0.893078 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1981  Formyl-CoA transferase  34.33 
 
 
425 aa  203  3e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.5463  hitchhiker  0.00178281 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1735  Formyl-CoA transferase  33.17 
 
 
448 aa  204  3e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.186489 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0409  Formyl-CoA transferase  32.21 
 
 
396 aa  204  3e-51  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2825  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  33.76 
 
 
406 aa  204  3e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0265401 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3426  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  35.58 
 
 
403 aa  204  3e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0253848 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1045  CAIB/BAIF family protein  33.59 
 
 
381 aa  203  4e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.372992  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1084  CAIB/BAIF family protein  33.59 
 
 
381 aa  203  4e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.254633  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0143  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  36.53 
 
 
413 aa  203  4e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.235606 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3414  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  33.33 
 
 
412 aa  202  6e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>