86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_1249 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011370  Rleg2_6121  citrate lyase, alpha subunit  68.97 
 
 		 508 aa  641    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.32733 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1249  citrate lyase, alpha subunit  100 
 
 		 510 aa  1004    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0940044 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4206  citrate lyase, alpha subunit  58.22 
 
 		 518 aa  584  1.0000000000000001e-165  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000987109  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1084  citrate lyase, alpha subunit  53.75 
 
 		 512 aa  494  9.999999999999999e-139  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3943  citrate lyase, alpha subunit  52.21 
 
 		 512 aa  473  1e-132  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000277042 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3858  citrate lyase, alpha subunit  52.42 
 
 		 512 aa  474  1e-132  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1371  citrate lyase, alpha subunit  49.9 
 
 		 517 aa  457  1e-127  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0970  citrate lyase, alpha subunit  48.22 
 
 		 511 aa  451  1e-125  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1165  citrate lyase, alpha subunit  46.27 
 
 		 519 aa  448  1.0000000000000001e-124  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.776939  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1631  citrate lyase, alpha subunit  46.06 
 
 		 498 aa  432  1e-120  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0341  citrate lyase, alpha subunit  47.51 
 
 		 518 aa  426  1e-118  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0661  citrate lyase, alpha subunit  46.61 
 
 		 509 aa  425  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0024  citrate lyase, alpha subunit  47.51 
 
 		 518 aa  424  1e-117  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0675  citrate lyase, alpha subunit  46.61 
 
 		 509 aa  425  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0780  citrate lyase, alpha subunit  46.41 
 
 		 509 aa  424  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.495863  normal  0.466757 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0721  citrate lyase subunit alpha  46.61 
 
 		 509 aa  424  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.331125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0734  citrate lyase subunit alpha  46.41 
 
 		 509 aa  424  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04690  citrate lyase, alpha subunit  45.11 
 
 		 497 aa  419  1e-116  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0326  citrate lyase, alpha subunit  47.64 
 
 		 534 aa  412  1e-114  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0067  citrate lyase, alpha subunit  44.29 
 
 		 506 aa  406  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.139514  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0066  citrate lyase subunit alpha  44.29 
 
 		 506 aa  407  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.597387 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0066  citrate lyase, alpha subunit  44.29 
 
 		 506 aa  406  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0065  citrate lyase subunit alpha  44.09 
 
 		 506 aa  405  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0068  citrate lyase, alpha subunit  44.09 
 
 		 506 aa  405  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00583  citrate lyase, citrate-ACP transferase (alpha) subunit  46.09 
 
 		 510 aa  402  1e-111  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0634  citrate lyase, alpha subunit  46.09 
 
 		 510 aa  402  1e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00572  hypothetical protein  46.09 
 
 		 510 aa  402  1e-111  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3029  citrate lyase, alpha subunit  46.09 
 
 		 510 aa  402  1e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0637  citrate lyase alpha chain  46.09 
 
 		 510 aa  402  1e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.559114  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0666  citrate lyase alpha chain  46.88 
 
 		 510 aa  402  1e-111  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0703  citrate lyase, alpha subunit  46.09 
 
 		 510 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3010  citrate lyase, alpha subunit  45.88 
 
 		 510 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.049663  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1755  citrate lyase, alpha subunit  41.9 
 
 		 509 aa  399  9.999999999999999e-111  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2407  citrate lyase, alpha subunit  44.19 
 
 		 512 aa  397  1e-109  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0227211  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3168  citrate lyase, alpha subunit  45.61 
 
 		 501 aa  397  1e-109  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.385767  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0529  citrate lyase, alpha subunit  45.67 
 
 		 510 aa  395  1e-109  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2217  citrate lyase, alpha subunit  44.87 
 
 		 507 aa  398  1e-109  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2028  citrate lyase, alpha subunit  43.8 
 
 		 509 aa  394  1e-108  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.578582  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3372  citrate lyase, alpha subunit  42.34 
 
 		 505 aa  387  1e-106  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0954315 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2319  citrate lyase, alpha subunit  41.7 
 
 		 509 aa  388  1e-106  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0423  citrate lyase, alpha subunit  42.29 
 
 		 512 aa  380  1e-104  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1427  citrate CoA-transferase  45.57 
 
 		 515 aa  373  1e-102  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.749143 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2962  citrate lyase, alpha subunit  39.48 
 
 		 536 aa  338  1.9999999999999998e-91  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0727414  normal  0.222216 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18740  Acetyl-CoA hydrolase/transferase  45.45 
 
 		 498 aa  50.1  0.00009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1793  acetyl-CoA hydrolase/transferase  26.5 
 
 		 614 aa  47.8  0.0005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00194756  normal  0.574819 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0292  Acetyl-CoA hydrolase  42.86 
 
 		 510 aa  47  0.0009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2278  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  37.74 
 
 		 208 aa  46.6  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1863  acetyl-CoA hydrolase/transferase family protein  44.16 
 
 		 504 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2213  succinate CoA transferase  37.21 
 
 		 505 aa  46.6  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.285742  normal  0.144104 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1678  succinyl-CoA: coenzyme A transferase  44.16 
 
 		 504 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1730  Acetyl-CoA hydrolase  41.38 
 
 		 508 aa  45.8  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.267908  normal  0.945334 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0154  acetyl-CoA hydrolase/transferase family protein  42.86 
 
 		 497 aa  45.4  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000105319 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3479  acetyl-CoA hydrolase/transferase family protein  42.86 
 
 		 504 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0253626 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1978  acetyl-CoA hydrolase/transferase family protein  42.7 
 
 		 504 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1948  acetyl-CoA hydrolase/transferase family protein  42.7 
 
 		 504 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0172  Acetyl-CoA hydrolase  42.86 
 
 		 497 aa  45.4  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.938894 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0170  succinate CoA transferase  42.86 
 
 		 497 aa  45.4  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.696891 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5073  succinate CoA transferase  42.86 
 
 		 497 aa  45.4  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00240679 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0111  Acetyl-CoA hydrolase  42.86 
 
 		 497 aa  45.1  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1290  Acetyl-CoA hydrolase  38.96 
 
 		 505 aa  45.1  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1382  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  36.27 
 
 		 218 aa  45.1  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5032  putative 4-hydroxybutyrate CoA transferase  28.86 
 
 		 413 aa  45.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1436  Acetyl-CoA hydrolase  42.86 
 
 		 497 aa  45.1  0.004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6235  putative coenzyme A transferase  41.56 
 
 		 497 aa  45.1  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0438  succinate CoA transferase  41.56 
 
 		 507 aa  44.7  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71890  putative coenzyme A transferase  41.56 
 
 		 497 aa  44.7  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2589  acetyl-CoA hydrolase/transferase  27.51 
 
 		 490 aa  44.7  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16700  acetyl-CoA hydrolase/transferase family protein  38.96 
 
 		 498 aa  44.7  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1533  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  31.75 
 
 		 447 aa  43.9  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.172337 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1400  succinate CoA transferase  42.86 
 
 		 515 aa  44.3  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.428811  normal  0.0306794 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1335  succinate CoA transferase  42.86 
 
 		 515 aa  43.9  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.311322 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1900  acetyl-CoA hydrolase/transferase family protein  41.56 
 
 		 504 aa  43.9  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1909  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  35.79 
 
 		 219 aa  44.3  0.006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1216  Acetyl-CoA hydrolase  40 
 
 		 517 aa  43.9  0.006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.533497  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0350  succinate CoA transferase  28.88 
 
 		 504 aa  43.9  0.007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0236116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2183  Acetyl-CoA hydrolase  27.06 
 
 		 499 aa  43.9  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1862  acetyl-CoA hydrolase/transferase family protein  41.56 
 
 		 504 aa  43.9  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5019  Acetyl-CoA hydrolase  38.96 
 
 		 497 aa  43.9  0.007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.49195 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1704  succinyl-CoA: coenzyme A transferase  41.56 
 
 		 504 aa  43.9  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1726  acetyl-CoA hydrolase/transferase family protein  41.56 
 
 		 504 aa  43.9  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1471  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  35.64 
 
 		 219 aa  43.5  0.008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.155964  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5465  acetyl-CoA hydrolase/transferase family protein  38.96 
 
 		 497 aa  43.5  0.008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1658  Acetyl-CoA hydrolase  37.66 
 
 		 499 aa  43.5  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.391166  normal  0.0484541 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4895  propionyl-CoA:succinate-CoA transferase  38.96 
 
 		 510 aa  43.5  0.009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.101367 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0029  acetyl-CoA hydrolase/transferase family protein  37.66 
 
 		 499 aa  43.5  0.009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2696  3-oxoacid CoA-transferase B subunit  34.95 
 
 		 448 aa  43.5  0.01  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.494818  normal  0.507072 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>