48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_1755 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011149  SeAg_B0661  citrate lyase, alpha subunit  69.72 
 
 		 509 aa  711    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0529  citrate lyase, alpha subunit  66.27 
 
 		 510 aa  687    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0066  citrate lyase, alpha subunit  67.92 
 
 		 506 aa  714    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0675  citrate lyase, alpha subunit  69.72 
 
 		 509 aa  711    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0065  citrate lyase subunit alpha  67.92 
 
 		 506 aa  713    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0734  citrate lyase subunit alpha  69.72 
 
 		 509 aa  710    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0067  citrate lyase, alpha subunit  67.92 
 
 		 506 aa  714    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.139514  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0780  citrate lyase, alpha subunit  69.72 
 
 		 509 aa  710    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.495863  normal  0.466757 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0068  citrate lyase, alpha subunit  67.92 
 
 		 506 aa  714    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3010  citrate lyase, alpha subunit  66.86 
 
 		 510 aa  697    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.049663  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0066  citrate lyase subunit alpha  67.92 
 
 		 506 aa  713    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.597387 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0721  citrate lyase subunit alpha  69.31 
 
 		 509 aa  707    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.331125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0703  citrate lyase, alpha subunit  66.67 
 
 		 510 aa  694    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2217  citrate lyase, alpha subunit  86.76 
 
 		 507 aa  919    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00572  hypothetical protein  67.06 
 
 		 510 aa  700    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2319  citrate lyase, alpha subunit  87.94 
 
 		 509 aa  927    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1755  citrate lyase, alpha subunit  100 
 
 		 509 aa  1047    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2028  citrate lyase, alpha subunit  94.7 
 
 		 509 aa  994    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.578582  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3029  citrate lyase, alpha subunit  67.06 
 
 		 510 aa  700    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0634  citrate lyase, alpha subunit  67.06 
 
 		 510 aa  699    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2407  citrate lyase, alpha subunit  70.52 
 
 		 512 aa  737    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0227211  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3168  citrate lyase, alpha subunit  66.73 
 
 		 501 aa  657    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.385767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0637  citrate lyase alpha chain  67.06 
 
 		 510 aa  700    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.559114  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0666  citrate lyase alpha chain  67.06 
 
 		 510 aa  700    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00583  citrate lyase, citrate-ACP transferase (alpha) subunit  67.06 
 
 		 510 aa  700    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0326  citrate lyase, alpha subunit  65.24 
 
 		 534 aa  664    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3372  citrate lyase, alpha subunit  79.84 
 
 		 505 aa  832    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0954315 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1165  citrate lyase, alpha subunit  54.45 
 
 		 519 aa  548  1e-155  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.776939  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0423  citrate lyase, alpha subunit  58.59 
 
 		 512 aa  528  1e-149  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04690  citrate lyase, alpha subunit  48.77 
 
 		 497 aa  493  9.999999999999999e-139  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4206  citrate lyase, alpha subunit  48.61 
 
 		 518 aa  466  9.999999999999999e-131  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000987109  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1084  citrate lyase, alpha subunit  50.11 
 
 		 512 aa  456  1e-127  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3858  citrate lyase, alpha subunit  45.4 
 
 		 512 aa  433  1e-120  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3943  citrate lyase, alpha subunit  45.79 
 
 		 512 aa  434  1e-120  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000277042 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0341  citrate lyase, alpha subunit  46.88 
 
 		 518 aa  429  1e-119  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0024  citrate lyase, alpha subunit  46.67 
 
 		 518 aa  427  1e-118  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1371  citrate lyase, alpha subunit  45.38 
 
 		 517 aa  422  1e-116  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0970  citrate lyase, alpha subunit  43.13 
 
 		 511 aa  416  9.999999999999999e-116  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1631  citrate lyase, alpha subunit  43.42 
 
 		 498 aa  405  1.0000000000000001e-112  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1249  citrate lyase, alpha subunit  41.9 
 
 		 510 aa  385  1e-105  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0940044 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6121  citrate lyase, alpha subunit  42.25 
 
 		 508 aa  353  4e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.32733 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2962  citrate lyase, alpha subunit  39.52 
 
 		 536 aa  350  3e-95  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0727414  normal  0.222216 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1427  citrate CoA-transferase  36.48 
 
 		 515 aa  283  4.0000000000000003e-75  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.749143 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7279  Acetyl-CoA hydrolase/transferase  27.97 
 
 		 430 aa  51.2  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0965  Acetyl-CoA hydrolase/transferase  27.16 
 
 		 424 aa  43.9  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.201698  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1010  acetyl-CoA hydrolase/transferase  26.54 
 
 		 424 aa  44.3  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763151 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1024  acetyl-CoA hydrolase/transferase  27.16 
 
 		 424 aa  43.5  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.825013  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1027  acetyl-CoA hydrolase/transferase  27.16 
 
 		 424 aa  43.5  0.009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.719595  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>