44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_2407 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011205  SeD_A0066  citrate lyase subunit alpha  63.47 
 
 		 506 aa  674    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.597387 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0066  citrate lyase, alpha subunit  63.47 
 
 		 506 aa  676    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0675  citrate lyase, alpha subunit  64 
 
 		 509 aa  652    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0065  citrate lyase subunit alpha  63.47 
 
 		 506 aa  674    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0734  citrate lyase subunit alpha  64 
 
 		 509 aa  652    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0067  citrate lyase, alpha subunit  63.47 
 
 		 506 aa  676    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.139514  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0780  citrate lyase, alpha subunit  64 
 
 		 509 aa  652    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.495863  normal  0.466757 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0068  citrate lyase, alpha subunit  63.47 
 
 		 506 aa  675    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0661  citrate lyase, alpha subunit  64 
 
 		 509 aa  652    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3010  citrate lyase, alpha subunit  64.81 
 
 		 510 aa  650    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.049663  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0721  citrate lyase subunit alpha  63.79 
 
 		 509 aa  650    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.331125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0703  citrate lyase, alpha subunit  64.38 
 
 		 510 aa  646    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2217  citrate lyase, alpha subunit  70.94 
 
 		 507 aa  743    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00572  hypothetical protein  64.81 
 
 		 510 aa  651    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2319  citrate lyase, alpha subunit  71.14 
 
 		 509 aa  739    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1755  citrate lyase, alpha subunit  70.52 
 
 		 509 aa  737    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2028  citrate lyase, alpha subunit  70.14 
 
 		 509 aa  733    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.578582  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0529  citrate lyase, alpha subunit  64.38 
 
 		 510 aa  644    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2407  citrate lyase, alpha subunit  100 
 
 		 512 aa  1049    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0227211  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00583  citrate lyase, citrate-ACP transferase (alpha) subunit  64.81 
 
 		 510 aa  651    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3372  citrate lyase, alpha subunit  69.38 
 
 		 505 aa  729    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0954315 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0326  citrate lyase, alpha subunit  61.84 
 
 		 534 aa  644    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0666  citrate lyase alpha chain  64.81 
 
 		 510 aa  651    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0637  citrate lyase alpha chain  64.81 
 
 		 510 aa  651    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.559114  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3168  citrate lyase, alpha subunit  62.32 
 
 		 501 aa  635    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.385767  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3029  citrate lyase, alpha subunit  64.81 
 
 		 510 aa  651    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0634  citrate lyase, alpha subunit  65.02 
 
 		 510 aa  652    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1165  citrate lyase, alpha subunit  52.24 
 
 		 519 aa  535  1e-151  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.776939  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0423  citrate lyase, alpha subunit  50.3 
 
 		 512 aa  494  9.999999999999999e-139  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04690  citrate lyase, alpha subunit  50.54 
 
 		 497 aa  493  9.999999999999999e-139  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4206  citrate lyase, alpha subunit  45.82 
 
 		 518 aa  440  9.999999999999999e-123  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000987109  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1084  citrate lyase, alpha subunit  47 
 
 		 512 aa  437  1e-121  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1371  citrate lyase, alpha subunit  45.19 
 
 		 517 aa  434  1e-120  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3858  citrate lyase, alpha subunit  45.59 
 
 		 512 aa  431  1e-119  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3943  citrate lyase, alpha subunit  44.93 
 
 		 512 aa  430  1e-119  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000277042 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0341  citrate lyase, alpha subunit  44.95 
 
 		 518 aa  416  9.999999999999999e-116  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0024  citrate lyase, alpha subunit  44.73 
 
 		 518 aa  414  1e-114  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0970  citrate lyase, alpha subunit  41.94 
 
 		 511 aa  403  1e-111  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1249  citrate lyase, alpha subunit  44.19 
 
 		 510 aa  384  1e-105  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0940044 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1631  citrate lyase, alpha subunit  41.56 
 
 		 498 aa  372  1e-101  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6121  citrate lyase, alpha subunit  44.52 
 
 		 508 aa  355  2e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.32733 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2962  citrate lyase, alpha subunit  38.84 
 
 		 536 aa  338  9.999999999999999e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0727414  normal  0.222216 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1427  citrate CoA-transferase  34.94 
 
 		 515 aa  273  6e-72  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.749143 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0141  acetyl-CoA hydrolase/transferase  23.96 
 
 		 426 aa  43.9  0.008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>