45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_3029 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011205  SeD_A0066  citrate lyase subunit alpha  72.29 
 
 		 506 aa  704    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.597387 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0066  citrate lyase, alpha subunit  72.29 
 
 		 506 aa  706    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0675  citrate lyase, alpha subunit  88.82 
 
 		 509 aa  939    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0065  citrate lyase subunit alpha  72.29 
 
 		 506 aa  704    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0734  citrate lyase subunit alpha  88.63 
 
 		 509 aa  938    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0067  citrate lyase, alpha subunit  72.29 
 
 		 506 aa  706    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.139514  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0780  citrate lyase, alpha subunit  88.63 
 
 		 509 aa  938    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.495863  normal  0.466757 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0068  citrate lyase, alpha subunit  72.5 
 
 		 506 aa  708    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0661  citrate lyase, alpha subunit  88.82 
 
 		 509 aa  939    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3010  citrate lyase, alpha subunit  99.8 
 
 		 510 aa  1046    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.049663  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0721  citrate lyase subunit alpha  88.82 
 
 		 509 aa  937    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.331125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0703  citrate lyase, alpha subunit  99.61 
 
 		 510 aa  1042    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2217  citrate lyase, alpha subunit  70.66 
 
 		 507 aa  691    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00572  hypothetical protein  100 
 
 		 510 aa  1048    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2319  citrate lyase, alpha subunit  67.72 
 
 		 509 aa  704    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1755  citrate lyase, alpha subunit  67.06 
 
 		 509 aa  700    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2028  citrate lyase, alpha subunit  69.83 
 
 		 509 aa  696    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.578582  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0529  citrate lyase, alpha subunit  99.02 
 
 		 510 aa  1035    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2407  citrate lyase, alpha subunit  64.81 
 
 		 512 aa  651    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0227211  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00583  citrate lyase, citrate-ACP transferase (alpha) subunit  100 
 
 		 510 aa  1048    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3372  citrate lyase, alpha subunit  67.55 
 
 		 505 aa  676    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0954315 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0326  citrate lyase, alpha subunit  71.37 
 
 		 534 aa  696    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0666  citrate lyase alpha chain  99.8 
 
 		 510 aa  1046    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0637  citrate lyase alpha chain  100 
 
 		 510 aa  1048    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.559114  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3168  citrate lyase, alpha subunit  79.08 
 
 		 501 aa  817    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.385767  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3029  citrate lyase, alpha subunit  100 
 
 		 510 aa  1048    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0634  citrate lyase, alpha subunit  99.61 
 
 		 510 aa  1045    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1165  citrate lyase, alpha subunit  53.55 
 
 		 519 aa  550  1e-155  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.776939  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04690  citrate lyase, alpha subunit  50.92 
 
 		 497 aa  521  1e-147  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0423  citrate lyase, alpha subunit  54.26 
 
 		 512 aa  506  9.999999999999999e-143  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1084  citrate lyase, alpha subunit  51.5 
 
 		 512 aa  464  1e-129  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4206  citrate lyase, alpha subunit  47.36 
 
 		 518 aa  461  9.999999999999999e-129  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000987109  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0341  citrate lyase, alpha subunit  49.79 
 
 		 518 aa  451  1e-125  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0024  citrate lyase, alpha subunit  49.58 
 
 		 518 aa  450  1e-125  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3858  citrate lyase, alpha subunit  48.93 
 
 		 512 aa  442  1e-123  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3943  citrate lyase, alpha subunit  48.93 
 
 		 512 aa  442  1e-123  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000277042 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1371  citrate lyase, alpha subunit  48.18 
 
 		 517 aa  434  1e-120  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0970  citrate lyase, alpha subunit  46.35 
 
 		 511 aa  421  1e-116  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1631  citrate lyase, alpha subunit  44.01 
 
 		 498 aa  403  1e-111  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1249  citrate lyase, alpha subunit  46.09 
 
 		 510 aa  389  1e-107  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0940044 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6121  citrate lyase, alpha subunit  47.08 
 
 		 508 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.32733 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2962  citrate lyase, alpha subunit  38.36 
 
 		 536 aa  330  3e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0727414  normal  0.222216 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1427  citrate CoA-transferase  38.74 
 
 		 515 aa  296  5e-79  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.749143 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7279  Acetyl-CoA hydrolase/transferase  28.66 
 
 		 430 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2743  acetyl-CoA hydrolase/transferase  24.56 
 
 		 432 aa  45.4  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>