119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1427 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_1427  citrate CoA-transferase  100 
 
 		 515 aa  1016    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.749143 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1249  citrate lyase, alpha subunit  45.57 
 
 		 510 aa  357  3.9999999999999996e-97  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0940044 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1631  citrate lyase, alpha subunit  41.72 
 
 		 498 aa  353  5e-96  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4206  citrate lyase, alpha subunit  42.18 
 
 		 518 aa  352  7e-96  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000987109  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6121  citrate lyase, alpha subunit  42.41 
 
 		 508 aa  317  3e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.32733 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04690  citrate lyase, alpha subunit  37.28 
 
 		 497 aa  315  9e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1371  citrate lyase, alpha subunit  39.84 
 
 		 517 aa  313  3.9999999999999997e-84  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1165  citrate lyase, alpha subunit  38.45 
 
 		 519 aa  303  7.000000000000001e-81  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.776939  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0024  citrate lyase, alpha subunit  36.79 
 
 		 518 aa  301  2e-80  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2319  citrate lyase, alpha subunit  38.33 
 
 		 509 aa  301  2e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0341  citrate lyase, alpha subunit  36.59 
 
 		 518 aa  300  3e-80  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0326  citrate lyase, alpha subunit  37.87 
 
 		 534 aa  300  6e-80  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0065  citrate lyase subunit alpha  37.15 
 
 		 506 aa  298  1e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2217  citrate lyase, alpha subunit  38.09 
 
 		 507 aa  298  1e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1084  citrate lyase, alpha subunit  38.49 
 
 		 512 aa  298  2e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0066  citrate lyase subunit alpha  36.93 
 
 		 506 aa  298  2e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.597387 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2028  citrate lyase, alpha subunit  37.98 
 
 		 509 aa  297  3e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.578582  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0066  citrate lyase, alpha subunit  37.15 
 
 		 506 aa  297  3e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0067  citrate lyase, alpha subunit  37.15 
 
 		 506 aa  297  3e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.139514  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00583  citrate lyase, citrate-ACP transferase (alpha) subunit  38.74 
 
 		 510 aa  296  5e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3010  citrate lyase, alpha subunit  38.74 
 
 		 510 aa  296  5e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.049663  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00572  hypothetical protein  38.74 
 
 		 510 aa  296  5e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0637  citrate lyase alpha chain  38.74 
 
 		 510 aa  296  5e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.559114  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3029  citrate lyase, alpha subunit  38.74 
 
 		 510 aa  296  5e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0068  citrate lyase, alpha subunit  37.15 
 
 		 506 aa  296  5e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0634  citrate lyase, alpha subunit  38.74 
 
 		 510 aa  296  6e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0666  citrate lyase alpha chain  39.1 
 
 		 510 aa  296  7e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0734  citrate lyase subunit alpha  39.35 
 
 		 509 aa  296  8e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0780  citrate lyase, alpha subunit  39.35 
 
 		 509 aa  296  8e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.495863  normal  0.466757 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0970  citrate lyase, alpha subunit  38.04 
 
 		 511 aa  295  1e-78  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0675  citrate lyase, alpha subunit  39.14 
 
 		 509 aa  295  2e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0661  citrate lyase, alpha subunit  39.14 
 
 		 509 aa  295  2e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0721  citrate lyase subunit alpha  39.14 
 
 		 509 aa  294  2e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.331125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0703  citrate lyase, alpha subunit  38.53 
 
 		 510 aa  295  2e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0529  citrate lyase, alpha subunit  38.53 
 
 		 510 aa  293  4e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3168  citrate lyase, alpha subunit  38.91 
 
 		 501 aa  290  3e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.385767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0423  citrate lyase, alpha subunit  38.56 
 
 		 512 aa  289  8e-77  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3372  citrate lyase, alpha subunit  36.94 
 
 		 505 aa  288  1e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0954315 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1755  citrate lyase, alpha subunit  36.48 
 
 		 509 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3943  citrate lyase, alpha subunit  36.88 
 
 		 512 aa  283  5.000000000000001e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000277042 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3858  citrate lyase, alpha subunit  35.76 
 
 		 512 aa  283  5.000000000000001e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2407  citrate lyase, alpha subunit  34.94 
 
 		 512 aa  273  6e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0227211  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2962  citrate lyase, alpha subunit  34.75 
 
 		 536 aa  244  3e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0727414  normal  0.222216 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1217  Acetyl-CoA hydrolase  29.66 
 
 		 483 aa  56.2  0.000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.872767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1216  Acetyl-CoA hydrolase  35.29 
 
 		 517 aa  53.9  0.000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.533497  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0254  Acetyl-CoA hydrolase  32.34 
 
 		 499 aa  53.9  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.202355  normal  0.127915 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0301  succinate CoA transferase  34.29 
 
 		 511 aa  53.9  0.000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2183  Acetyl-CoA hydrolase  32.82 
 
 		 499 aa  51.6  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1863  acetyl-CoA hydrolase/transferase family protein  41.56 
 
 		 504 aa  51.2  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1678  succinyl-CoA: coenzyme A transferase  41.56 
 
 		 504 aa  51.2  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4309  Acetyl-CoA hydrolase  34.07 
 
 		 500 aa  50.8  0.00005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18740  Acetyl-CoA hydrolase/transferase  36.14 
 
 		 498 aa  51.2  0.00005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3479  acetyl-CoA hydrolase/transferase family protein  40.26 
 
 		 504 aa  50.8  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0253626 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3791  Acetyl-CoA hydrolase  40.24 
 
 		 503 aa  50.1  0.00009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1948  acetyl-CoA hydrolase/transferase family protein  40.79 
 
 		 504 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3540  Acetyl-CoA hydrolase  32.12 
 
 		 504 aa  50.1  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0100  Acetyl-CoA hydrolase  33.09 
 
 		 507 aa  49.7  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4466  succinate CoA transferase  32.12 
 
 		 504 aa  49.7  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.388893  normal  0.939468 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4021  succinate CoA transferase  32.12 
 
 		 504 aa  50.1  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.205204  normal  0.45753 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1978  acetyl-CoA hydrolase/transferase family protein  40.79 
 
 		 504 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0154  acetyl-CoA hydrolase/transferase family protein  38.96 
 
 		 497 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000105319 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5465  acetyl-CoA hydrolase/transferase family protein  38.96 
 
 		 497 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1726  acetyl-CoA hydrolase/transferase family protein  38.96 
 
 		 504 aa  48.9  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1704  succinyl-CoA: coenzyme A transferase  38.96 
 
 		 504 aa  48.9  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5019  Acetyl-CoA hydrolase  38.96 
 
 		 497 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.49195 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0029  acetyl-CoA hydrolase/transferase family protein  31.3 
 
 		 499 aa  48.9  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1862  acetyl-CoA hydrolase/transferase family protein  38.96 
 
 		 504 aa  48.9  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1658  Acetyl-CoA hydrolase  31.3 
 
 		 499 aa  48.9  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.391166  normal  0.0484541 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0172  Acetyl-CoA hydrolase  38.96 
 
 		 497 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.938894 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0170  succinate CoA transferase  38.96 
 
 		 497 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.696891 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5073  succinate CoA transferase  38.96 
 
 		 497 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00240679 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16700  acetyl-CoA hydrolase/transferase family protein  34.72 
 
 		 498 aa  48.9  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1900  acetyl-CoA hydrolase/transferase family protein  38.96 
 
 		 504 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1290  Acetyl-CoA hydrolase  40.26 
 
 		 505 aa  48.1  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0111  Acetyl-CoA hydrolase  38.96 
 
 		 497 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1909  Acetyl-CoA hydrolase  32.12 
 
 		 504 aa  48.5  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.708436 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0292  Acetyl-CoA hydrolase  32.09 
 
 		 510 aa  48.5  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4240  Acetyl-CoA hydrolase  32.12 
 
 		 504 aa  48.5  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4126  Acetyl-CoA hydrolase  32.12 
 
 		 504 aa  48.5  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.890881  normal  0.330046 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71890  putative coenzyme A transferase  38.96 
 
 		 497 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2146  Acetyl-CoA hydrolase  31.62 
 
 		 504 aa  48.1  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3393  succinate CoA transferase  31.39 
 
 		 504 aa  48.1  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0350  succinate CoA transferase  32.6 
 
 		 504 aa  48.1  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0236116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6235  putative coenzyme A transferase  38.96 
 
 		 497 aa  47.8  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0516  coenzyme A transferase  32.09 
 
 		 496 aa  47.8  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5056  succinate CoA transferase  42.31 
 
 		 504 aa  47.4  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.265353 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15880  acetyl-CoA hydrolase  28.5 
 
 		 504 aa  47.4  0.0006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.699182  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0438  succinate CoA transferase  38.96 
 
 		 507 aa  47.4  0.0007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1730  Acetyl-CoA hydrolase  31.34 
 
 		 508 aa  47  0.0007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.267908  normal  0.945334 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0322  Acetyl-CoA hydrolase  37.8 
 
 		 520 aa  47  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.461781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2071  acetyl-CoA hydrolase/transferase  39.02 
 
 		 542 aa  47  0.0009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.189529  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1436  Acetyl-CoA hydrolase  40.26 
 
 		 497 aa  47  0.0009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1763  coenzyme A transferase  39.02 
 
 		 504 aa  47  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2807  Acetyl-CoA hydrolase/transferase  37.8 
 
 		 503 aa  46.2  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00135825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0397  Acetyl-CoA hydrolase  29.2 
 
 		 504 aa  46.2  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0753  coenzyme A transferase  39.02 
 
 		 504 aa  47  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1046  coenzyme A transferase  39.02 
 
 		 504 aa  47  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0785  acetyl-CoA hydrolase/transferase family protein  39.02 
 
 		 504 aa  46.6  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0696  acetyl-CoA hydrolase/transferase family protein  39.02 
 
 		 504 aa  47  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.194387  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2021  coenzyme A transferase  39.02 
 
 		 504 aa  47  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>