261 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1290 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_1400  succinate CoA transferase  85.51 
 
 
515 aa  863    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.428811  normal  0.0306794 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18740  Acetyl-CoA hydrolase/transferase  67.41 
 
 
498 aa  677    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0154  acetyl-CoA hydrolase/transferase family protein  69.01 
 
 
497 aa  694    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000105319 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2146  Acetyl-CoA hydrolase  69.49 
 
 
504 aa  711    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4800  succinate CoA transferase  65.93 
 
 
510 aa  666    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0678941  hitchhiker  0.0000783257 
 
 
-
 
NC_004310  BR1058  acetyl-CoA hydrolase/transferase family protein  68.35 
 
 
496 aa  703    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.338164  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0172  Acetyl-CoA hydrolase  69.01 
 
 
497 aa  694    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.938894 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5465  acetyl-CoA hydrolase/transferase family protein  67.21 
 
 
497 aa  685    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5019  Acetyl-CoA hydrolase  66.8 
 
 
497 aa  681    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.49195 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1290  Acetyl-CoA hydrolase  100 
 
 
505 aa  1027    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2183  Acetyl-CoA hydrolase  71.86 
 
 
499 aa  719    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0111  Acetyl-CoA hydrolase  69.64 
 
 
497 aa  701    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0029  acetyl-CoA hydrolase/transferase family protein  72.36 
 
 
499 aa  694    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6235  putative coenzyme A transferase  69.84 
 
 
497 aa  695    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5073  succinate CoA transferase  69.22 
 
 
497 aa  692    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00240679 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0516  coenzyme A transferase  70.1 
 
 
496 aa  734    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16700  acetyl-CoA hydrolase/transferase family protein  66.4 
 
 
498 aa  664    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5077  succinate CoA transferase  65.88 
 
 
504 aa  674    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0771155  normal  0.512532 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1927  Acetyl-CoA hydrolase  71.49 
 
 
501 aa  748    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.431308  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1730  Acetyl-CoA hydrolase  69.54 
 
 
508 aa  709    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.267908  normal  0.945334 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1216  Acetyl-CoA hydrolase  67.75 
 
 
517 aa  650    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.533497  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1335  succinate CoA transferase  85.71 
 
 
515 aa  865    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.311322 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0292  Acetyl-CoA hydrolase  70.1 
 
 
510 aa  717    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1860  Acetyl-CoA hydrolase  65.52 
 
 
504 aa  642    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.105734 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4895  propionyl-CoA:succinate-CoA transferase  80.81 
 
 
510 aa  838    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.101367 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1023  acetyl-CoA hydrolase/transferase family protein  68.35 
 
 
496 aa  703    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.391798  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0170  succinate CoA transferase  69.01 
 
 
497 aa  694    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.696891 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1436  Acetyl-CoA hydrolase  74.19 
 
 
497 aa  749    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71890  putative coenzyme A transferase  69.64 
 
 
497 aa  697    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16440  acetyl-CoA hydrolase/transferase family  65.46 
 
 
498 aa  654    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.311164  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1658  Acetyl-CoA hydrolase  72.36 
 
 
499 aa  694    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.391166  normal  0.0484541 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4309  Acetyl-CoA hydrolase  68.42 
 
 
500 aa  696    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0767  succinate CoA transferase  67 
 
 
497 aa  689    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0438  succinate CoA transferase  60.24 
 
 
507 aa  624  1e-177  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1863  acetyl-CoA hydrolase/transferase family protein  59.88 
 
 
504 aa  624  1e-177  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1678  succinyl-CoA: coenzyme A transferase  59.27 
 
 
504 aa  618  1e-176  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1948  acetyl-CoA hydrolase/transferase family protein  59.27 
 
 
504 aa  617  1e-175  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1900  acetyl-CoA hydrolase/transferase family protein  59.07 
 
 
504 aa  615  1e-175  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1978  acetyl-CoA hydrolase/transferase family protein  59.27 
 
 
504 aa  617  1e-175  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3479  acetyl-CoA hydrolase/transferase family protein  59.07 
 
 
504 aa  617  1e-175  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0253626 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1704  succinyl-CoA: coenzyme A transferase  58.87 
 
 
504 aa  614  9.999999999999999e-175  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1726  acetyl-CoA hydrolase/transferase family protein  58.67 
 
 
504 aa  608  1e-173  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1862  acetyl-CoA hydrolase/transferase family protein  58.67 
 
 
504 aa  608  1e-173  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2213  succinate CoA transferase  55.26 
 
 
505 aa  554  1e-156  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.285742  normal  0.144104 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2807  Acetyl-CoA hydrolase/transferase  53.01 
 
 
503 aa  524  1e-147  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00135825  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0085  succinate CoA transferase  52.3 
 
 
504 aa  522  1e-147  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1025  succinate CoA transferase  52 
 
 
503 aa  521  1e-146  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.273752  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0350  succinate CoA transferase  54.08 
 
 
504 aa  520  1e-146  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0236116  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1175  putative acetyl-CoA hydrolase/transferase family protein  52.1 
 
 
510 aa  516  1.0000000000000001e-145  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.802387 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0301  succinate CoA transferase  52.43 
 
 
511 aa  515  1.0000000000000001e-145  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0073  Acetyl-CoA hydrolase  53.59 
 
 
516 aa  515  1.0000000000000001e-145  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.528341  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1227  Acetyl-CoA hydrolase  51.7 
 
 
516 aa  515  1.0000000000000001e-145  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.492271 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0397  Acetyl-CoA hydrolase  52.88 
 
 
504 aa  509  1e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2304  succinate CoA transferase  52.01 
 
 
503 aa  510  1e-143  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0363976  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2021  coenzyme A transferase  53.28 
 
 
504 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1763  coenzyme A transferase  53.28 
 
 
504 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2071  acetyl-CoA hydrolase/transferase  53.28 
 
 
542 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.189529  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1046  coenzyme A transferase  53.28 
 
 
504 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0503  Acetyl-CoA hydrolase  50.69 
 
 
548 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.636654  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0753  coenzyme A transferase  53.28 
 
 
504 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0785  acetyl-CoA hydrolase/transferase family protein  53.28 
 
 
504 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0696  acetyl-CoA hydrolase/transferase family protein  53.28 
 
 
504 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.194387  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0100  Acetyl-CoA hydrolase  52.91 
 
 
507 aa  504  1e-141  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15880  acetyl-CoA hydrolase  53.2 
 
 
504 aa  502  1e-141  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.699182  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1903  coenzyme A transferase  53.08 
 
 
639 aa  504  1e-141  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0538  succinate CoA transferase  51.99 
 
 
519 aa  501  1e-141  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0066  succinate CoA transferase  52.52 
 
 
506 aa  503  1e-141  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0046  Acetyl-CoA hydrolase  52.52 
 
 
506 aa  504  1e-141  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.505771 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4021  succinate CoA transferase  52.29 
 
 
504 aa  500  1e-140  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.205204  normal  0.45753 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1909  Acetyl-CoA hydrolase  52.09 
 
 
504 aa  498  1e-140  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.708436 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0322  Acetyl-CoA hydrolase  49.9 
 
 
520 aa  501  1e-140  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.461781  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5056  succinate CoA transferase  51.98 
 
 
504 aa  496  1e-139  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.265353 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4240  Acetyl-CoA hydrolase  52.49 
 
 
504 aa  495  1e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3393  succinate CoA transferase  52.68 
 
 
504 aa  496  1e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4126  Acetyl-CoA hydrolase  52.49 
 
 
504 aa  495  1e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.890881  normal  0.330046 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3000  succinate CoA transferase  51.7 
 
 
505 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.297289 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3540  Acetyl-CoA hydrolase  52.09 
 
 
504 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4466  succinate CoA transferase  52.29 
 
 
504 aa  489  1e-137  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.388893  normal  0.939468 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0063  succinate CoA transferase  50.8 
 
 
506 aa  491  1e-137  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0034824 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3791  Acetyl-CoA hydrolase  49.8 
 
 
503 aa  485  1e-136  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0254  Acetyl-CoA hydrolase  50.72 
 
 
499 aa  482  1e-135  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.202355  normal  0.127915 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3051  putative succinyl-CoA/coenzyme A transferase  52.41 
 
 
496 aa  478  1e-133  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.282197  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2668  succinate CoA transferase  45.54 
 
 
510 aa  452  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.48281  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4108  succinate CoA transferase  47.97 
 
 
497 aa  453  1.0000000000000001e-126  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2572  succinate CoA transferase  45.54 
 
 
510 aa  452  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2477  Acetyl-CoA hydrolase  45.35 
 
 
510 aa  453  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.507052  normal  0.0950739 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1288  Acetyl-CoA hydrolase  45.74 
 
 
510 aa  451  1e-125  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0308  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1013  acetyl-CoA hydrolase/transferase family protein  46.83 
 
 
498 aa  440  9.999999999999999e-123  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.442146 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0206  succinate CoA transferase  44.58 
 
 
498 aa  429  1e-119  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2384  putative coenzyme A transferase  44.12 
 
 
519 aa  424  1e-117  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000381077  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02751  propionyl-CoA:succinate-CoA transferase  45.57 
 
 
492 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0773  succinate CoA transferase  45.57 
 
 
492 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3078  acetyl-CoA hydrolase/transferase  45.57 
 
 
492 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3057  acetyl-CoA hydrolase/transferase  45.77 
 
 
492 aa  418  9.999999999999999e-116  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.83512 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02714  hypothetical protein  45.57 
 
 
492 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4217  acetyl-CoA hydrolase/transferase  45.77 
 
 
492 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0790  succinate CoA transferase  45.77 
 
 
492 aa  418  9.999999999999999e-116  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1337  Acetyl-CoA hydrolase  41.88 
 
 
519 aa  414  1e-114  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2843  acetyl-CoA hydrolase/transferase  41.68 
 
 
519 aa  410  1e-113  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.185361  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78208  Acetyl-CoA hydrolase (Acetyl-CoA deacylase) (Acetyl-CoA acylase)  43.27 
 
 
524 aa  411  1e-113  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.950828  normal  0.246661 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>