256 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_0254 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_3051  putative succinyl-CoA/coenzyme A transferase  78.66 
 
 		 496 aa  826    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.282197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0063  succinate CoA transferase  64.89 
 
 		 506 aa  678    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0034824 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1763  coenzyme A transferase  65.65 
 
 		 504 aa  673    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1175  putative acetyl-CoA hydrolase/transferase family protein  63.88 
 
 		 510 aa  662    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.802387 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2807  Acetyl-CoA hydrolase/transferase  73.72 
 
 		 503 aa  765    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00135825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2071  acetyl-CoA hydrolase/transferase  65.65 
 
 		 542 aa  674    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.189529  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4021  succinate CoA transferase  65.3 
 
 		 504 aa  678    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.205204  normal  0.45753 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1909  Acetyl-CoA hydrolase  65.3 
 
 		 504 aa  679    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.708436 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0696  acetyl-CoA hydrolase/transferase family protein  65.65 
 
 		 504 aa  673    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.194387  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0350  succinate CoA transferase  65.43 
 
 		 504 aa  692    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0236116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3000  succinate CoA transferase  67.08 
 
 		 505 aa  676    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.297289 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15880  acetyl-CoA hydrolase  62.63 
 
 		 504 aa  656    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.699182  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0785  acetyl-CoA hydrolase/transferase family protein  65.65 
 
 		 504 aa  672    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1903  coenzyme A transferase  65.24 
 
 		 639 aa  670    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2021  coenzyme A transferase  65.65 
 
 		 504 aa  673    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0503  Acetyl-CoA hydrolase  73.51 
 
 		 548 aa  760    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.636654  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0085  succinate CoA transferase  62.96 
 
 		 504 aa  649    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0073  Acetyl-CoA hydrolase  71.63 
 
 		 516 aa  741    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.528341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0254  Acetyl-CoA hydrolase  100 
 
 		 499 aa  1023    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.202355  normal  0.127915 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0397  Acetyl-CoA hydrolase  65.23 
 
 		 504 aa  676    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0322  Acetyl-CoA hydrolase  72.76 
 
 		 520 aa  760    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.461781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1227  Acetyl-CoA hydrolase  63.47 
 
 		 516 aa  660    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.492271 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4240  Acetyl-CoA hydrolase  65.5 
 
 		 504 aa  659    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1025  succinate CoA transferase  69.64 
 
 		 503 aa  736    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.273752  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3791  Acetyl-CoA hydrolase  63.75 
 
 		 503 aa  683    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3393  succinate CoA transferase  65.5 
 
 		 504 aa  659    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1046  coenzyme A transferase  65.65 
 
 		 504 aa  673    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0753  coenzyme A transferase  65.65 
 
 		 504 aa  673    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5056  succinate CoA transferase  67.69 
 
 		 504 aa  707    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.265353 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0046  Acetyl-CoA hydrolase  66.94 
 
 		 506 aa  681    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.505771 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3540  Acetyl-CoA hydrolase  65.3 
 
 		 504 aa  657    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4126  Acetyl-CoA hydrolase  65.5 
 
 		 504 aa  659    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.890881  normal  0.330046 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0538  succinate CoA transferase  73.05 
 
 		 519 aa  756    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0066  succinate CoA transferase  66.73 
 
 		 506 aa  679    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2304  succinate CoA transferase  73.31 
 
 		 503 aa  760    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0363976  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0100  Acetyl-CoA hydrolase  71.25 
 
 		 507 aa  738    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4466  succinate CoA transferase  65.5 
 
 		 504 aa  651    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.388893  normal  0.939468 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2668  succinate CoA transferase  53.16 
 
 		 510 aa  545  1e-154  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.48281  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1288  Acetyl-CoA hydrolase  52.95 
 
 		 510 aa  543  1e-153  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0308  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2477  Acetyl-CoA hydrolase  52.55 
 
 		 510 aa  539  9.999999999999999e-153  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.507052  normal  0.0950739 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2572  succinate CoA transferase  52.55 
 
 		 510 aa  541  9.999999999999999e-153  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0301  succinate CoA transferase  52.16 
 
 		 511 aa  498  1e-139  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1927  Acetyl-CoA hydrolase  50.82 
 
 		 501 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.431308  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0154  acetyl-CoA hydrolase/transferase family protein  51.02 
 
 		 497 aa  489  1e-137  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000105319 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5073  succinate CoA transferase  51.23 
 
 		 497 aa  488  1e-137  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00240679 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0172  Acetyl-CoA hydrolase  51.02 
 
 		 497 aa  489  1e-137  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.938894 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0170  succinate CoA transferase  51.02 
 
 		 497 aa  489  1e-137  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.696891 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1730  Acetyl-CoA hydrolase  50.72 
 
 		 508 aa  485  1e-136  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.267908  normal  0.945334 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2183  Acetyl-CoA hydrolase  50.92 
 
 		 499 aa  487  1e-136  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1436  Acetyl-CoA hydrolase  49.28 
 
 		 497 aa  483  1e-135  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5465  acetyl-CoA hydrolase/transferase family protein  50.51 
 
 		 497 aa  479  1e-134  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5019  Acetyl-CoA hydrolase  50.31 
 
 		 497 aa  479  1e-134  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.49195 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0111  Acetyl-CoA hydrolase  50.21 
 
 		 497 aa  480  1e-134  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71890  putative coenzyme A transferase  51.33 
 
 		 497 aa  479  1e-134  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1400  succinate CoA transferase  51.95 
 
 		 515 aa  481  1e-134  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.428811  normal  0.0306794 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1335  succinate CoA transferase  51.95 
 
 		 515 aa  481  1e-134  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.311322 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4800  succinate CoA transferase  49.8 
 
 		 510 aa  481  1e-134  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0678941  hitchhiker  0.0000783257 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6235  putative coenzyme A transferase  51.54 
 
 		 497 aa  478  1e-133  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0516  coenzyme A transferase  48.46 
 
 		 496 aa  477  1e-133  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16440  acetyl-CoA hydrolase/transferase family  51.63 
 
 		 498 aa  473  1e-132  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.311164  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16700  acetyl-CoA hydrolase/transferase family protein  50.51 
 
 		 498 aa  472  1e-132  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0029  acetyl-CoA hydrolase/transferase family protein  51.12 
 
 		 499 aa  471  1e-132  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18740  Acetyl-CoA hydrolase/transferase  48.67 
 
 		 498 aa  472  1e-132  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0438  succinate CoA transferase  49.79 
 
 		 507 aa  474  1e-132  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1658  Acetyl-CoA hydrolase  51.12 
 
 		 499 aa  471  1e-132  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.391166  normal  0.0484541 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5077  succinate CoA transferase  48.98 
 
 		 504 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0771155  normal  0.512532 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2146  Acetyl-CoA hydrolase  49.28 
 
 		 504 aa  469  1.0000000000000001e-131  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4309  Acetyl-CoA hydrolase  49.28 
 
 		 500 aa  471  1.0000000000000001e-131  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1058  acetyl-CoA hydrolase/transferase family protein  49.28 
 
 		 496 aa  467  9.999999999999999e-131  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.338164  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0767  succinate CoA transferase  49.28 
 
 		 497 aa  466  9.999999999999999e-131  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1290  Acetyl-CoA hydrolase  50.72 
 
 		 505 aa  466  9.999999999999999e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1023  acetyl-CoA hydrolase/transferase family protein  49.28 
 
 		 496 aa  467  9.999999999999999e-131  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.391798  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1216  Acetyl-CoA hydrolase  48.98 
 
 		 517 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.533497  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1860  Acetyl-CoA hydrolase  49.59 
 
 		 504 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.105734 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1337  Acetyl-CoA hydrolase  46.8 
 
 		 519 aa  458  9.999999999999999e-129  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4895  propionyl-CoA:succinate-CoA transferase  49.69 
 
 		 510 aa  459  9.999999999999999e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.101367 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0206  succinate CoA transferase  46.99 
 
 		 498 aa  461  9.999999999999999e-129  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1013  acetyl-CoA hydrolase/transferase family protein  47.97 
 
 		 498 aa  458  1e-127  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.442146 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0292  Acetyl-CoA hydrolase  49.29 
 
 		 510 aa  456  1e-127  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2843  acetyl-CoA hydrolase/transferase  46.73 
 
 		 519 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.185361  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4108  succinate CoA transferase  48.33 
 
 		 497 aa  452  1.0000000000000001e-126  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2384  putative coenzyme A transferase  47.81 
 
 		 519 aa  449  1e-125  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000381077  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3897  acetyl-CoA hydrolase/transferase  47.6 
 
 		 520 aa  451  1e-125  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2213  succinate CoA transferase  48.47 
 
 		 505 aa  451  1e-125  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.285742  normal  0.144104 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3982  Acetyl-CoA hydrolase  47.4 
 
 		 520 aa  449  1e-125  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000234474 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02751  propionyl-CoA:succinate-CoA transferase  46.51 
 
 		 492 aa  447  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0773  succinate CoA transferase  46.51 
 
 		 492 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02714  hypothetical protein  46.51 
 
 		 492 aa  447  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4217  acetyl-CoA hydrolase/transferase  46.51 
 
 		 492 aa  447  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3057  acetyl-CoA hydrolase/transferase  46.51 
 
 		 492 aa  448  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.83512 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0790  succinate CoA transferase  46.51 
 
 		 492 aa  447  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3479  acetyl-CoA hydrolase/transferase family protein  45.34 
 
 		 504 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0253626 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3078  acetyl-CoA hydrolase/transferase  46.51 
 
 		 492 aa  447  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0795  acetyl-CoA hydrolase/transferase  47.9 
 
 		 549 aa  444  1e-123  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0842  Acetyl-CoA hydrolase  47.9 
 
 		 549 aa  444  1e-123  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1863  acetyl-CoA hydrolase/transferase family protein  45.55 
 
 		 504 aa  443  1e-123  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3013  Acetyl-CoA hydrolase  47.8 
 
 		 520 aa  444  1e-123  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1948  acetyl-CoA hydrolase/transferase family protein  45.34 
 
 		 504 aa  441  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1978  acetyl-CoA hydrolase/transferase family protein  45.14 
 
 		 504 aa  440  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1370  Acetyl-CoA hydrolase  45.69 
 
 		 519 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000044229 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>