50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3943 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3858  citrate lyase, alpha subunit  97.66 
 
 		 512 aa  1019    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1084  citrate lyase, alpha subunit  75 
 
 		 512 aa  802    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3943  citrate lyase, alpha subunit  100 
 
 		 512 aa  1039    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000277042 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1165  citrate lyase, alpha subunit  50.97 
 
 		 519 aa  529  1e-149  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.776939  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1371  citrate lyase, alpha subunit  54.19 
 
 		 517 aa  527  1e-148  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4206  citrate lyase, alpha subunit  50.58 
 
 		 518 aa  516  1.0000000000000001e-145  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000987109  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0970  citrate lyase, alpha subunit  47.85 
 
 		 511 aa  489  1e-137  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0326  citrate lyase, alpha subunit  50 
 
 		 534 aa  485  1e-136  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0024  citrate lyase, alpha subunit  49.9 
 
 		 518 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0341  citrate lyase, alpha subunit  50.29 
 
 		 518 aa  471  1.0000000000000001e-131  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0066  citrate lyase subunit alpha  48.38 
 
 		 506 aa  464  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.597387 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0067  citrate lyase, alpha subunit  48.38 
 
 		 506 aa  463  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.139514  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0065  citrate lyase subunit alpha  48.38 
 
 		 506 aa  464  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0066  citrate lyase, alpha subunit  48.38 
 
 		 506 aa  463  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1249  citrate lyase, alpha subunit  52.21 
 
 		 510 aa  464  1e-129  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0940044 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0068  citrate lyase, alpha subunit  48.38 
 
 		 506 aa  462  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0637  citrate lyase alpha chain  48.93 
 
 		 510 aa  442  1e-123  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.559114  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00572  hypothetical protein  48.93 
 
 		 510 aa  442  1e-123  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3029  citrate lyase, alpha subunit  48.93 
 
 		 510 aa  442  1e-123  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0634  citrate lyase, alpha subunit  49.14 
 
 		 510 aa  442  1e-123  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0666  citrate lyase alpha chain  48.93 
 
 		 510 aa  442  1e-123  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00583  citrate lyase, citrate-ACP transferase (alpha) subunit  48.93 
 
 		 510 aa  442  1e-123  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04690  citrate lyase, alpha subunit  47.44 
 
 		 497 aa  444  1e-123  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1631  citrate lyase, alpha subunit  47.25 
 
 		 498 aa  444  1e-123  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0721  citrate lyase subunit alpha  47.79 
 
 		 509 aa  441  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.331125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0661  citrate lyase, alpha subunit  47.79 
 
 		 509 aa  441  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0675  citrate lyase, alpha subunit  47.79 
 
 		 509 aa  441  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0703  citrate lyase, alpha subunit  48.93 
 
 		 510 aa  441  9.999999999999999e-123  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2028  citrate lyase, alpha subunit  45.99 
 
 		 509 aa  439  9.999999999999999e-123  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.578582  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0734  citrate lyase subunit alpha  47.79 
 
 		 509 aa  441  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3010  citrate lyase, alpha subunit  48.93 
 
 		 510 aa  441  9.999999999999999e-123  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.049663  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0780  citrate lyase, alpha subunit  47.79 
 
 		 509 aa  441  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.495863  normal  0.466757 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0529  citrate lyase, alpha subunit  48.71 
 
 		 510 aa  439  9.999999999999999e-123  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3168  citrate lyase, alpha subunit  47.98 
 
 		 501 aa  436  1e-121  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.385767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0423  citrate lyase, alpha subunit  47.3 
 
 		 512 aa  435  1e-121  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1755  citrate lyase, alpha subunit  45.79 
 
 		 509 aa  434  1e-120  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2407  citrate lyase, alpha subunit  44.93 
 
 		 512 aa  430  1e-119  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0227211  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3372  citrate lyase, alpha subunit  45.38 
 
 		 505 aa  432  1e-119  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0954315 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2217  citrate lyase, alpha subunit  44.53 
 
 		 507 aa  425  1e-118  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2319  citrate lyase, alpha subunit  44.42 
 
 		 509 aa  422  1e-117  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6121  citrate lyase, alpha subunit  48.94 
 
 		 508 aa  397  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.32733 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2962  citrate lyase, alpha subunit  42.47 
 
 		 536 aa  384  1e-105  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0727414  normal  0.222216 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1427  citrate CoA-transferase  36.88 
 
 		 515 aa  283  5.000000000000001e-75  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.749143 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0292  Acetyl-CoA hydrolase  27.71 
 
 		 510 aa  48.1  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2213  succinate CoA transferase  25.64 
 
 		 505 aa  47  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.285742  normal  0.144104 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1217  Acetyl-CoA hydrolase  30.6 
 
 		 483 aa  45.8  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.872767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6427  propionate CoA-transferase  28.14 
 
 		 522 aa  45.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.395247  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5056  succinate CoA transferase  24.91 
 
 		 504 aa  45.8  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.265353 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7279  Acetyl-CoA hydrolase/transferase  24.48 
 
 		 430 aa  45.1  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1066  butyrate-acetoacetate CoA-transferase, subunit A  24.09 
 
 		 214 aa  45.4  0.003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.25272 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>