261 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2213 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_2213  succinate CoA transferase  100 
 
 		 505 aa  1030    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.285742  normal  0.144104 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1927  Acetyl-CoA hydrolase  54.93 
 
 		 501 aa  572  1.0000000000000001e-162  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.431308  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2183  Acetyl-CoA hydrolase  55.92 
 
 		 499 aa  561  1e-158  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2146  Acetyl-CoA hydrolase  55.08 
 
 		 504 aa  560  1e-158  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4895  propionyl-CoA:succinate-CoA transferase  56.42 
 
 		 510 aa  561  1e-158  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.101367 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0170  succinate CoA transferase  55.51 
 
 		 497 aa  558  1e-158  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.696891 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0154  acetyl-CoA hydrolase/transferase family protein  55.51 
 
 		 497 aa  558  1e-157  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000105319 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0516  coenzyme A transferase  54.38 
 
 		 496 aa  557  1e-157  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0172  Acetyl-CoA hydrolase  55.51 
 
 		 497 aa  558  1e-157  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.938894 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71890  putative coenzyme A transferase  56.12 
 
 		 497 aa  555  1e-157  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6235  putative coenzyme A transferase  55.92 
 
 		 497 aa  551  1e-156  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1058  acetyl-CoA hydrolase/transferase family protein  54.07 
 
 		 496 aa  552  1e-156  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.338164  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5073  succinate CoA transferase  55.51 
 
 		 497 aa  553  1e-156  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00240679 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0111  Acetyl-CoA hydrolase  55.71 
 
 		 497 aa  555  1e-156  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18740  Acetyl-CoA hydrolase/transferase  54.16 
 
 		 498 aa  553  1e-156  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1023  acetyl-CoA hydrolase/transferase family protein  54.07 
 
 		 496 aa  552  1e-156  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.391798  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4309  Acetyl-CoA hydrolase  55.6 
 
 		 500 aa  552  1e-156  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1436  Acetyl-CoA hydrolase  54.97 
 
 		 497 aa  550  1e-155  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1335  succinate CoA transferase  55.51 
 
 		 515 aa  550  1e-155  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.311322 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1400  succinate CoA transferase  55.51 
 
 		 515 aa  550  1e-155  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.428811  normal  0.0306794 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5465  acetyl-CoA hydrolase/transferase family protein  54.08 
 
 		 497 aa  546  1e-154  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5019  Acetyl-CoA hydrolase  54.29 
 
 		 497 aa  547  1e-154  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.49195 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16440  acetyl-CoA hydrolase/transferase family  54.07 
 
 		 498 aa  545  1e-154  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.311164  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0767  succinate CoA transferase  53.97 
 
 		 497 aa  542  1e-153  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0029  acetyl-CoA hydrolase/transferase family protein  55.58 
 
 		 499 aa  542  1e-153  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1658  Acetyl-CoA hydrolase  55.58 
 
 		 499 aa  542  1e-153  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.391166  normal  0.0484541 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0438  succinate CoA transferase  53.37 
 
 		 507 aa  540  9.999999999999999e-153  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1730  Acetyl-CoA hydrolase  53.23 
 
 		 508 aa  537  1e-151  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.267908  normal  0.945334 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0292  Acetyl-CoA hydrolase  54.79 
 
 		 510 aa  535  1e-151  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16700  acetyl-CoA hydrolase/transferase family protein  53.46 
 
 		 498 aa  533  1e-150  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1290  Acetyl-CoA hydrolase  55.26 
 
 		 505 aa  534  1e-150  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1216  Acetyl-CoA hydrolase  55.6 
 
 		 517 aa  533  1e-150  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.533497  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5077  succinate CoA transferase  54.27 
 
 		 504 aa  530  1e-149  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0771155  normal  0.512532 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4800  succinate CoA transferase  54.27 
 
 		 510 aa  531  1e-149  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0678941  hitchhiker  0.0000783257 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3479  acetyl-CoA hydrolase/transferase family protein  51.12 
 
 		 504 aa  518  1e-146  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0253626 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1863  acetyl-CoA hydrolase/transferase family protein  51.32 
 
 		 504 aa  518  1e-146  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1948  acetyl-CoA hydrolase/transferase family protein  50.51 
 
 		 504 aa  512  1e-144  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1860  Acetyl-CoA hydrolase  54.88 
 
 		 504 aa  513  1e-144  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.105734 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1678  succinyl-CoA: coenzyme A transferase  50.51 
 
 		 504 aa  510  1e-143  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1978  acetyl-CoA hydrolase/transferase family protein  50.31 
 
 		 504 aa  511  1e-143  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1704  succinyl-CoA: coenzyme A transferase  49.8 
 
 		 504 aa  508  9.999999999999999e-143  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1900  acetyl-CoA hydrolase/transferase family protein  49.6 
 
 		 504 aa  507  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1726  acetyl-CoA hydrolase/transferase family protein  49.19 
 
 		 504 aa  500  1e-140  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1862  acetyl-CoA hydrolase/transferase family protein  49.19 
 
 		 504 aa  500  1e-140  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0301  succinate CoA transferase  48.98 
 
 		 511 aa  484  1e-135  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3051  putative succinyl-CoA/coenzyme A transferase  50.41 
 
 		 496 aa  473  1e-132  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.282197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0322  Acetyl-CoA hydrolase  48.07 
 
 		 520 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.461781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0063  succinate CoA transferase  47.71 
 
 		 506 aa  468  1.0000000000000001e-131  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0034824 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2304  succinate CoA transferase  47.12 
 
 		 503 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0363976  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3791  Acetyl-CoA hydrolase  47.7 
 
 		 503 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15880  acetyl-CoA hydrolase  47.5 
 
 		 504 aa  462  1e-129  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.699182  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0085  succinate CoA transferase  45.98 
 
 		 504 aa  462  1e-129  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0350  succinate CoA transferase  47.2 
 
 		 504 aa  462  1e-129  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0236116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1175  putative acetyl-CoA hydrolase/transferase family protein  46.6 
 
 		 510 aa  459  9.999999999999999e-129  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.802387 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2807  Acetyl-CoA hydrolase/transferase  45.53 
 
 		 503 aa  458  9.999999999999999e-129  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00135825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1025  succinate CoA transferase  46.12 
 
 		 503 aa  459  9.999999999999999e-129  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.273752  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0503  Acetyl-CoA hydrolase  46.86 
 
 		 548 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.636654  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4021  succinate CoA transferase  47.9 
 
 		 504 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.205204  normal  0.45753 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2071  acetyl-CoA hydrolase/transferase  48.02 
 
 		 542 aa  455  1e-127  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.189529  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1903  coenzyme A transferase  48.02 
 
 		 639 aa  455  1e-127  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0100  Acetyl-CoA hydrolase  45.33 
 
 		 507 aa  457  1e-127  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1227  Acetyl-CoA hydrolase  46.2 
 
 		 516 aa  456  1e-127  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.492271 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5056  succinate CoA transferase  47.62 
 
 		 504 aa  456  1e-127  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.265353 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0073  Acetyl-CoA hydrolase  46.89 
 
 		 516 aa  457  1e-127  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.528341  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0066  succinate CoA transferase  46.63 
 
 		 506 aa  455  1e-127  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1763  coenzyme A transferase  48.02 
 
 		 504 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1909  Acetyl-CoA hydrolase  47.11 
 
 		 504 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.708436 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2021  coenzyme A transferase  48.02 
 
 		 504 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0696  acetyl-CoA hydrolase/transferase family protein  48.02 
 
 		 504 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.194387  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0046  Acetyl-CoA hydrolase  46.49 
 
 		 506 aa  455  1.0000000000000001e-126  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.505771 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0785  acetyl-CoA hydrolase/transferase family protein  47.82 
 
 		 504 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1046  coenzyme A transferase  48.02 
 
 		 504 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3540  Acetyl-CoA hydrolase  47.5 
 
 		 504 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0753  coenzyme A transferase  48.02 
 
 		 504 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3000  succinate CoA transferase  47.62 
 
 		 505 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.297289 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0254  Acetyl-CoA hydrolase  48.47 
 
 		 499 aa  451  1e-125  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.202355  normal  0.127915 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0397  Acetyl-CoA hydrolase  45.51 
 
 		 504 aa  451  1e-125  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4240  Acetyl-CoA hydrolase  46.91 
 
 		 504 aa  449  1e-125  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0538  succinate CoA transferase  46.28 
 
 		 519 aa  449  1e-125  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4126  Acetyl-CoA hydrolase  46.91 
 
 		 504 aa  449  1e-125  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.890881  normal  0.330046 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3393  succinate CoA transferase  47.11 
 
 		 504 aa  449  1e-125  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4466  succinate CoA transferase  46.91 
 
 		 504 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.388893  normal  0.939468 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2572  succinate CoA transferase  43.87 
 
 		 510 aa  429  1e-119  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1288  Acetyl-CoA hydrolase  43.68 
 
 		 510 aa  429  1e-119  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0308  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2668  succinate CoA transferase  43.68 
 
 		 510 aa  427  1e-118  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.48281  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2477  Acetyl-CoA hydrolase  44.07 
 
 		 510 aa  426  1e-118  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.507052  normal  0.0950739 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1370  Acetyl-CoA hydrolase  41.85 
 
 		 519 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000044229 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0206  succinate CoA transferase  42.97 
 
 		 498 aa  416  9.999999999999999e-116  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2843  acetyl-CoA hydrolase/transferase  41.45 
 
 		 519 aa  414  1e-114  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.185361  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2384  putative coenzyme A transferase  42.63 
 
 		 519 aa  411  1e-113  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000381077  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4108  succinate CoA transferase  41.68 
 
 		 497 aa  406  1.0000000000000001e-112  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1013  acetyl-CoA hydrolase/transferase family protein  42.33 
 
 		 498 aa  404  1e-111  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.442146 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1337  Acetyl-CoA hydrolase  41.18 
 
 		 519 aa  404  1e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02751  propionyl-CoA:succinate-CoA transferase  42.09 
 
 		 492 aa  397  1e-109  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0773  succinate CoA transferase  42.09 
 
 		 492 aa  397  1e-109  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0790  succinate CoA transferase  42.09 
 
 		 492 aa  397  1e-109  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02714  hypothetical protein  42.09 
 
 		 492 aa  397  1e-109  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4217  acetyl-CoA hydrolase/transferase  41.89 
 
 		 492 aa  396  1e-109  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3078  acetyl-CoA hydrolase/transferase  42.09 
 
 		 492 aa  398  1e-109  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3057  acetyl-CoA hydrolase/transferase  42.09 
 
 		 492 aa  398  1e-109  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.83512 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>